MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me1_27_7_0.527_2.531995e-41
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.122235	0.045159	0.77758	0.055026
0.054313	0.900502	0.010494	0.034691
0.054797	0.905151	0.028101	0.011951
0.521787	0.313665	0.113241	0.051307
0.005262	0.224287	0.601764	0.168687
0.021729	0.802576	0.026276	0.14942
0.004594	0.960138	0.029221	0.006047
0.833339	0.025347	0.084951	0.056363
0.0	0.903193	0.083813	0.012994
0.032646	0.0	0.967354	0.0
0.011973	0.954024	0.026433	0.00757

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me1_81_60_0.508_8.971353e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.183627	0.029714	0.610419	0.17624
0.076432	0.851415	0.037585	0.034568
0.013256	0.949382	0.026492	0.01087
0.65913	0.144043	0.134993	0.061834
0.015923	0.065181	0.843469	0.075427
0.166899	0.642905	0.072225	0.11797
0.004053	0.922677	0.06777	0.0055
0.881495	0.0	0.052535	0.06597
0.0	0.908073	0.073704	0.018223
0.406946	0.255481	0.190411	0.147162

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me1_55_109_0.516_5.642742e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.837697	0.078291	0.074555	0.009458
0.10093	0.064658	0.80864	0.025772
0.044607	0.880339	0.046803	0.028251
0.032102	0.864537	0.103361	0.0
0.824833	0.024894	0.024878	0.125396
0.004635	0.05283	0.857388	0.085148
0.06097	0.768338	0.063316	0.107377
0.119143	0.647406	0.178341	0.05511
0.850832	0.062179	0.034305	0.052683

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me1_59_81_0.516_2.31417e-26
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.729863	0.043171	0.07795	0.149015
0.067731	0.101566	0.793059	0.037644
0.111235	0.772247	0.063613	0.052905
0.018502	0.867226	0.095609	0.018662
0.762014	0.024946	0.089846	0.123194
0.0	0.089227	0.858304	0.052468
0.046304	0.774889	0.121061	0.057746
0.090255	0.853782	0.02528	0.030683
0.805995	0.032244	0.053231	0.10853

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me1_87_106_0.507_6.373742e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.039461	0.067673	0.892866	0.0
0.261414	0.639656	0.016819	0.08211
0.028749	0.889778	0.048078	0.033395
0.856778	0.008761	0.094562	0.039899
0.008335	0.1046	0.791564	0.095501
0.124237	0.727584	0.033469	0.11471
0.029887	0.785527	0.178286	0.0063
0.854314	0.089718	0.03651	0.019458
0.0	0.852495	0.061001	0.086504

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me1_86_118_0.505_5.647745e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.687267	0.155477	0.013386	0.14387
0.060753	0.117907	0.785643	0.035697
0.29581	0.5516	0.020189	0.132401
0.043313	0.903285	0.02374	0.029662
0.797227	0.024221	0.159956	0.018596
0.0	0.032146	0.85188	0.115974
0.060383	0.838684	0.023818	0.077115
0.004183	0.9553	0.03107	0.009447
0.878673	0.037172	0.035335	0.04882

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me1_79_79_0.508_4.594374e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.087601	0.481498	0.0	0.430901
0.051458	0.005608	0.916717	0.026217
0.028878	0.920804	0.005599	0.044718
0.017382	0.96129	0.015394	0.005935
0.689593	0.187776	0.066556	0.056076
0.027308	0.321128	0.38206	0.269503
0.016358	0.900649	0.055005	0.027987
0.012497	0.957	0.030503	0.0
0.978572	0.0	0.021428	0.0

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me1_24_32_0.523_1.058827e-38
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.019403	0.863386	0.114755	0.002456
0.051614	0.07328	0.022622	0.852484
0.035559	0.073177	0.78855	0.102713
0.046316	0.10969	0.77362	0.070374
0.042391	0.781296	0.173897	0.002416
0.158949	0.090113	0.039428	0.711511
0.034912	0.055375	0.862395	0.047318
0.059679	0.182904	0.711464	0.045953
0.047364	0.788239	0.035954	0.128443
0.007625	0.0	0.453453	0.538922

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me1_40_43_0.519_4.051046e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.060574	0.873909	0.059566	0.005952
0.051051	0.072919	0.05406	0.82197
0.021998	0.061503	0.80747	0.109029
0.031421	0.064616	0.798038	0.105925
0.049302	0.815573	0.124781	0.010343
0.126819	0.047875	0.081455	0.743851
0.036257	0.041666	0.888083	0.033994
0.102637	0.128086	0.727261	0.042017
0.176197	0.662935	0.06321	0.097657
0.180979	0.042266	0.55294	0.223815

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me1_39_23_0.522_8.068023e-54
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.077435	0.794343	0.123618	0.004604
0.060721	0.070673	0.068009	0.800597
0.019019	0.090643	0.856379	0.03396
0.038876	0.063278	0.830083	0.067763
0.039798	0.816034	0.142132	0.002036
0.180603	0.055952	0.048001	0.715444
0.027458	0.079103	0.876167	0.017273
0.075972	0.112826	0.764419	0.046783
0.069948	0.775662	0.065645	0.088746
0.082982	0.17395	0.321321	0.421747

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me1_25_16_0.530_7.056297e-47
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.059973	0.789935	0.131841	0.018251
0.07531	0.073587	0.071706	0.779396
0.036965	0.069355	0.854876	0.038804
0.022628	0.048422	0.808586	0.120364
0.023938	0.855226	0.113092	0.007744
0.130054	0.035163	0.075602	0.759181
0.008115	0.040547	0.906263	0.045075
0.056049	0.243152	0.645509	0.05529
0.07135	0.789519	0.07498	0.064151
0.122855	0.037189	0.248056	0.5919