MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me1_13_31_0.541_1.222767e-138 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.085931 0.499362 0.355085 0.059622 0.411943 0.159181 0.161936 0.26694 0.779667 0.005927 0.178243 0.036163 0.934571 0.018226 0.026736 0.020467 0.839191 0.037213 0.040489 0.083107 0.054297 0.909377 0.017126 0.0192 0.885671 0.032821 0.018137 0.063371 0.136288 0.730527 0.13044 0.002745 0.526448 0.087498 0.208587 0.177467 0.002385 0.054196 0.9367 0.006719 0.028348 0.857212 0.056274 0.058166 0.03747 0.529827 0.337993 0.09471 0.039186 0.511447 0.427955 0.021412 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me1_33_90_0.520_3.301734e-35 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.318335 0.159461 0.522204 0.0 0.119056 0.321997 0.500416 0.05853 0.276335 0.170581 0.463116 0.089968 0.291202 0.028943 0.310774 0.36908 0.865599 0.031563 0.07425 0.028589 0.872928 0.016054 0.068253 0.042765 0.675159 0.21276 0.043439 0.068641 0.034244 0.90327 0.02453 0.037956 0.82251 0.028085 0.130255 0.01915 0.078089 0.900789 0.017193 0.003929 0.689454 0.079951 0.105278 0.125317 0.016524 0.089629 0.878272 0.015575 0.054474 0.654688 0.104947 0.185891 0.266006 0.211042 0.506654 0.016299 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_28_91_0.528_3.887e-45 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.0 0.258797 0.619111 0.122092 0.016106 0.019104 0.495668 0.469122 0.96356 0.0 0.022003 0.014438 0.909599 0.001393 0.077026 0.011982 0.831108 0.026137 0.049293 0.093462 0.012343 0.884809 0.028456 0.074391 0.83736 0.039062 0.104743 0.018835 0.128843 0.832496 0.033064 0.005598 0.487982 0.146271 0.159731 0.206016 0.026259 0.084464 0.869655 0.019622 0.053254 0.680301 0.071514 0.194932 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me1_7_111_0.534_2.906003e-76 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.754924 0.018853 0.146678 0.079545 0.863987 0.039805 0.046442 0.049767 0.854344 0.02623 0.02629 0.093135 0.076859 0.850868 0.018244 0.054029 0.820719 0.045375 0.095703 0.038204 0.091466 0.874889 0.029859 0.003786 0.616488 0.105089 0.162765 0.115658 0.018368 0.159794 0.801328 0.02051 0.024747 0.78368 0.056563 0.13501 MOTIF Intestine_E14.5_H3K4me1_16_53_0.530_2.247215e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.307013 0.223781 0.447669 0.021538 0.015497 0.928403 0.043464 0.012635 0.20977 0.20536 0.08737 0.4975 0.015896 0.033966 0.923888 0.026249 0.01651 0.141745 0.015926 0.825819 0.009579 0.008147 0.968476 0.013798 0.009073 0.038198 0.160466 0.792263 0.041375 0.052043 0.027291 0.879291 0.082376 0.039502 0.018657 0.859465 0.804441 0.065051 0.073779 0.05673 0.112423 0.41585 0.087331 0.384395 MOTIF Lung_E15.5_H3K4me1_26_87_0.527_6.70824e-71 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.032402 0.919988 0.027662 0.019948 0.021932 0.479519 0.024448 0.474101 0.0 0.038554 0.941409 0.020037 0.011511 0.250117 0.005317 0.733055 0.004943 0.019906 0.968045 0.007105 0.013522 0.215428 0.0713 0.69975 0.022013 0.044963 0.046664 0.88636 0.022498 0.021654 0.0316 0.924248 0.771885 0.067199 0.059765 0.101151 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me1_19_71_0.530_9.691708e-107 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.652225 0.215798 0.0 0.131977 0.068414 0.502968 0.380245 0.048373 0.031593 0.094774 0.50824 0.365392 0.359875 0.028507 0.295262 0.316356 0.960885 0.002719 0.021734 0.014663 0.889817 0.017 0.065523 0.027661 0.782549 0.048846 0.023383 0.145222 0.037817 0.832502 0.060346 0.069335 0.690657 0.033597 0.194259 0.081487 0.067091 0.900763 0.018205 0.01394 0.617897 0.093914 0.179339 0.10885 0.006886 0.164486 0.807589 0.02104 0.037107 0.803319 0.095679 0.063895 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me1_40_94_0.523_1.278758e-55 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.240741 0.59773 0.010748 0.150781 0.19691 0.712911 0.023175 0.067004 0.564223 0.077524 0.322614 0.035639 0.171917 0.05604 0.310945 0.461097 0.905208 0.007897 0.056294 0.030601 0.890586 0.001032 0.068466 0.039916 0.827996 0.032791 0.018693 0.12052 0.056717 0.836496 0.052569 0.054219 0.784539 0.036959 0.143836 0.034667 0.12412 0.845902 0.024977 0.005001 0.626811 0.110576 0.163101 0.099513 0.010249 0.093702 0.880439 0.015609 0.025269 0.688745 0.142146 0.14384 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me1_24_19_0.531_2.823718e-61 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.019536 0.686593 0.058307 0.235565 0.353283 0.074996 0.545745 0.025976 0.142056 0.056581 0.406763 0.3946 0.919124 0.010332 0.047864 0.022679 0.873465 0.004081 0.092887 0.029568 0.676846 0.177124 0.046722 0.099308 0.005377 0.895922 0.023865 0.074836 0.892417 0.042966 0.042462 0.022155 0.057726 0.907612 0.026563 0.008098 0.521695 0.140783 0.251749 0.085772 0.017959 0.195796 0.775934 0.010312 0.013209 0.84543 0.0774 0.063961 0.0 0.303022 0.553762 0.143216 0.029052 0.032455 0.590743 0.34775 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_20_106_0.537_7.541484e-92 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.194997 0.008648 0.514693 0.281662 0.229264 0.149137 0.160386 0.461213 0.947071 0.0 0.014891 0.038038 0.907826 0.013956 0.054011 0.024207 0.836311 0.016871 0.025882 0.120936 0.056443 0.805663 0.04709 0.090805 0.779149 0.041674 0.156718 0.022459 0.096817 0.858887 0.04011 0.004186 0.539499 0.07403 0.210347 0.176123 0.008017 0.030539 0.943988 0.017456 0.030407 0.707885 0.21408 0.047627 0.026019 0.394334 0.364056 0.215591 MOTIF Heart_P0_H3K4me1_70_124_0.502_0.0003600575 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.106477 0.81115 0.0 0.082373 0.0 0.862617 0.044535 0.092849 0.058139 0.741307 0.151331 0.049222 0.054455 0.90154 0.033173 0.010833 0.596862 0.250064 0.071711 0.081363 0.0 0.069098 0.928834 0.002068 0.060094 0.030608 0.055233 0.854066 0.002081 0.078659 0.911452 0.007808 0.093897 0.342799 0.037878 0.525426 0.01986 0.070147 0.136725 0.773268 MOTIF Stomach_E16.5_H3K4me1_47_74_0.518_1.064814e-26 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.94479 0.009368 0.018904 0.026938 0.747737 0.07948 0.02996 0.142823 0.922989 0.035718 0.028651 0.012643 0.00904 0.959743 0.017306 0.013911 0.951568 0.019143 0.010468 0.018821 0.013837 0.963433 0.02273 0.0 0.177144 0.164667 0.557174 0.101015 0.059461 0.04095 0.852061 0.047528 0.070689 0.01513 0.848179 0.066001