MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me1_14_96_0.524_1.017524e-53 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.753504 0.0 0.104916 0.14158 0.792639 0.009529 0.0 0.197832 0.011194 0.886913 0.068412 0.033481 0.811707 0.14361 0.024982 0.019701 0.339825 0.016397 0.631843 0.011935 0.689888 0.261742 0.008607 0.039763 0.017915 0.019447 0.895466 0.067173 0.00409 0.950465 0.027975 0.01747 0.06295 0.893874 0.015574 0.027602 0.03636 0.103223 0.204147 0.656269 MOTIF Heart_P0_H3K4me1_20_162_0.520_4.201278e-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.743 0.094 0.08 0.083 0.728 0.105 0.095 0.072 0.765 0.055 0.084 0.096 0.073 0.098 0.743 0.086 0.086 0.069 0.093 0.752 0.098 0.081 0.741 0.08 0.081 0.746 0.086 0.087 0.085 0.084 0.041 0.79 0.079 0.09 0.087 0.744 0.098 0.052 0.072 0.778 0.087 0.102 0.731 0.08 0.083 0.089 0.09 0.738 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me1_10_168_0.541_2.112796e-64 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.694 0.116 0.151 0.039 0.678 0.094 0.175 0.053 0.38 0.022 0.173 0.425 0.114 0.254 0.362 0.269 0.309 0.028 0.288 0.376 0.037 0.213 0.667 0.083 0.076 0.842 0.031 0.051 0.065 0.068 0.001 0.866 0.005 0.156 0.131 0.708 0.014 0.003 0.036 0.947 0.024 0.213 0.654 0.109 0.105 0.075 0.058 0.762 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me1_10_160_0.536_1.144261e-47 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.724 0.12 0.136 0.02 0.796 0.06 0.116 0.028 0.067 0.801 0.093 0.039 0.959 0.03 0.003 0.008 0.795 0.086 0.118 0.001 0.965 0.001 0.021 0.013 0.015 0.021 0.948 0.016 0.022 0.74 0.232 0.006 0.167 0.698 0.003 0.132 0.231 0.214 0.23 0.325 0.037 0.088 0.023 0.852 0.021 0.137 0.146 0.696 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_11_158_0.543_1.321657e-154 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me1_35_162_0.521_3.996494e-25 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.754 0.04 0.11 0.096 0.794 0.126 0.066 0.014 0.798 0.04 0.139 0.023 0.16 0.701 0.045 0.094 0.892 0.005 0.023 0.08 0.162 0.192 0.579 0.067 0.846 0.001 0.059 0.094 0.06 0.127 0.734 0.079 0.069 0.716 0.141 0.074 0.129 0.705 0.026 0.14 0.082 0.72 0.042 0.156 0.159 0.078 0.054 0.709 MOTIF Liver_E14.5_H3K4me1_86_164_0.511_3.321762e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.125 0.069 0.688 0.118 0.115 0.104 0.664 0.117 0.15 0.52 0.161 0.169 0.15 0.156 0.518 0.176 0.105 0.057 0.101 0.737 0.089 0.109 0.678 0.124 0.106 0.057 0.112 0.725 0.097 0.108 0.67 0.125 0.091 0.112 0.103 0.694 0.089 0.102 0.111 0.698 0.081 0.099 0.099 0.721 0.109 0.1 0.103 0.688 MOTIF Lung_E16.5_H3K27ac_46_167_0.523_3.882823e-29 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.764 0.071 0.084 0.081 0.768 0.123 0.108 0.001 0.742 0.078 0.107 0.073 0.105 0.697 0.106 0.092 0.716 0.059 0.116 0.109 0.124 0.757 0.118 0.001 0.87 0.001 0.001 0.128 0.001 0.115 0.808 0.076 0.079 0.703 0.12 0.098 0.102 0.775 0.001 0.122 0.119 0.126 0.01 0.745 0.122 0.112 0.103 0.663 MOTIF Liver_E11.5_H3K27ac_51_164_0.526_6.606429e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.185 0.078 0.089 0.648 0.911 0.037 0.032 0.02 0.842 0.11 0.024 0.024 0.935 0.015 0.028 0.022 0.045 0.895 0.021 0.039 0.862 0.096 0.012 0.03 0.514 0.269 0.172 0.045 0.902 0.01 0.066 0.022 0.223 0.043 0.705 0.029 0.113 0.72 0.124 0.043 0.158 0.739 0.03 0.073 0.136 0.48 0.013 0.371 MOTIF Stomach_E14.5_H3K27ac_32_160_0.537_4.809091e-37 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.713 0.058 0.111 0.118 0.091 0.067 0.746 0.096 0.001 0.496 0.502 0.001 0.098 0.737 0.061 0.104 0.087 0.107 0.037 0.769 0.067 0.102 0.111 0.72 0.074 0.047 0.092 0.787 0.089 0.119 0.683 0.109 0.079 0.114 0.079 0.728 0.08 0.083 0.094 0.743 0.106 0.086 0.085 0.723 0.651 0.116 0.11 0.123 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me2_79_166_0.542_2.11752e-51 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.802 0.083 0.08 0.035 0.814 0.1 0.078 0.008 0.752 0.067 0.101 0.08 0.109 0.701 0.123 0.067 0.878 0.023 0.072 0.027 0.776 0.112 0.109 0.003 0.838 0.01 0.067 0.085 0.111 0.104 0.723 0.062 0.106 0.715 0.106 0.073 0.1 0.709 0.092 0.099 0.105 0.637 0.11 0.148 0.121 0.139 0.609 0.131 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me2_87_173_0.533_6.639517e-39 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.747 0.105 0.084 0.064 0.757 0.079 0.099 0.065 0.099 0.731 0.101 0.069 0.799 0.094 0.051 0.056 0.787 0.091 0.093 0.029 0.813 0.043 0.065 0.079 0.081 0.073 0.781 0.065 0.087 0.76 0.09 0.063 0.094 0.8 0.035 0.071 0.114 0.648 0.087 0.151 0.101 0.119 0.645 0.135 0.082 0.732 0.105 0.081