MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me3_11_23_0.710_5.825948e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.137058	0.862942	0.0
0.229277	0.216643	0.0	0.554081
0.0	0.0	1.0	0.0
0.056721	0.880242	0.04466	0.018378
0.036036	0.013727	0.917174	0.033064
0.349523	0.577862	0.043185	0.02943
0.298526	0.581767	0.10333	0.016377
0.006256	0.050494	0.94325	0.0
0.0	0.841255	0.009966	0.148779

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_8_17_0.722_1.015857e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.884597	0.026523	0.0	0.08888
0.040687	0.010532	0.841264	0.107517
0.084549	0.822436	0.075103	0.017912
0.143814	0.055047	0.768579	0.03256
0.157322	0.708502	0.05737	0.076807
0.175599	0.629557	0.097528	0.097316
0.036384	0.07106	0.807317	0.085239
0.184364	0.714612	0.068931	0.032093
0.019929	0.041392	0.900624	0.038054
0.139074	0.223391	0.178814	0.458721

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me3_16_16_0.713_1.941849e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041425	0.254402	0.659393	0.04478
0.838996	0.058193	0.019423	0.083388
0.039804	0.02142	0.889982	0.048794
0.159599	0.781102	0.040856	0.018442
0.117076	0.059557	0.769398	0.053969
0.108717	0.800643	0.018968	0.071673
0.219004	0.696131	0.027168	0.057698
0.023475	0.035762	0.812308	0.128455
0.135085	0.770576	0.044173	0.050166
0.020728	0.029525	0.925929	0.023817

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me3_10_18_0.735_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.862899	0.014558	0.043715	0.078828
0.065389	0.032316	0.880207	0.022088
0.033862	0.90471	0.032463	0.028965
0.043464	0.032233	0.881505	0.042798
0.161526	0.673769	0.037097	0.127608
0.186563	0.72853	0.049833	0.035075
0.089327	0.049657	0.679433	0.181583
0.121037	0.715966	0.059259	0.103739
0.026956	0.006647	0.953237	0.013161
0.265626	0.26369	0.0	0.470684

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me3_1_20_0.699_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.879516	0.045577	0.03171	0.043196
0.079462	0.034416	0.7248	0.161322
0.046353	0.934343	0.0	0.019303
0.047736	0.0	0.892854	0.05941
0.165965	0.587307	0.039825	0.206904
0.231954	0.694222	0.052403	0.021421
0.028483	0.040723	0.865871	0.064922
0.035773	0.887042	0.062689	0.014496
0.015414	0.068505	0.899084	0.016996

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me3_37_24_0.645_1.798187e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.024852	0.076968	0.890967	0.007214
0.899767	0.038132	0.018744	0.043357
0.077641	0.009536	0.896236	0.016586
0.226947	0.732566	0.032155	0.008331
0.039295	0.058337	0.880046	0.022322
0.128256	0.777036	0.041119	0.053589
0.357579	0.528293	0.062999	0.05113
0.038923	0.013186	0.872395	0.075496
0.160163	0.745223	0.071307	0.023307
0.026306	0.16909	0.208564	0.59604

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me3_19_26_0.661_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.193954	0.145578	0.512035	0.148433
0.055621	0.084284	0.824731	0.035364
0.854006	0.052949	0.038582	0.054462
0.105614	0.034612	0.845163	0.014611
0.134216	0.816764	0.040775	0.008246
0.090914	0.047601	0.84723	0.014255
0.165632	0.71255	0.043771	0.078047
0.030176	0.84829	0.087695	0.033839
0.111947	0.036694	0.780411	0.070949
0.088472	0.769286	0.074301	0.067941

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_14_34_0.667_2.121783e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.065457	0.101924	0.781469	0.05115
0.879296	0.014059	0.024436	0.082209
0.120556	0.017212	0.849532	0.0127
0.05254	0.917417	0.026253	0.00379
0.034659	0.022232	0.904739	0.03837
0.054806	0.800202	0.004567	0.140425
0.170196	0.722719	0.052181	0.054904
0.157018	0.037543	0.683391	0.122047
0.075088	0.817346	0.056881	0.050684

MOTIF	Limb_E14.5_H3K4me3_10_20_0.715_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.015565	0.072718	0.897352	0.014366
0.803448	0.037638	0.068358	0.090556
0.07628	0.028957	0.874415	0.020348
0.125891	0.82296	0.040219	0.010929
0.034678	0.04872	0.876404	0.040199
0.097121	0.806903	0.033835	0.06214
0.130276	0.673675	0.072608	0.123441
0.091524	0.005359	0.79508	0.108037
0.114638	0.724531	0.113497	0.047334
0.359757	0.071289	0.500017	0.068937

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_29_28_0.695_5.718576e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.004481	0.046585	0.945398	0.003536
0.834167	0.044882	0.044022	0.076929
0.068571	0.012468	0.907104	0.011857
0.115651	0.824629	0.047845	0.011875
0.06152	0.094419	0.832163	0.011897
0.155183	0.675778	0.072326	0.096713
0.140141	0.734501	0.085678	0.03968
0.129856	0.019609	0.787186	0.063349
0.071513	0.790225	0.064754	0.073508

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me3_21_16_0.690_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.018576	0.045335	0.936089	0.0
0.856423	0.050893	0.0245	0.068184
0.049055	0.016726	0.929864	0.004355
0.143011	0.806588	0.03684	0.013562
0.12848	0.073019	0.764016	0.034485
0.106542	0.785299	0.032371	0.075787
0.140457	0.736127	0.08023	0.043186
0.127423	0.022414	0.736275	0.113888
0.130601	0.708411	0.079118	0.08187
0.138706	0.312274	0.426551	0.122469

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me3_16_28_0.714_3.226249e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.176945	0.037671	0.774165	0.011219
0.796381	0.024164	0.027449	0.152006
0.010187	0.017621	0.837549	0.134643
0.046938	0.884886	0.053084	0.015092
0.228702	0.065186	0.693246	0.012866
0.093177	0.70847	0.076056	0.122297
0.036414	0.877441	0.030713	0.055432
0.02497	0.030449	0.924015	0.020565
0.134818	0.752803	0.052672	0.059708