MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K27me3_4_17_0.584_8.400012e-56
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.096803	0.816128	0.044368	0.042701
0.067116	0.100002	0.745994	0.086888
0.795261	0.005123	0.122539	0.077077
0.083195	0.056934	0.777391	0.08248
0.11617	0.774651	0.032755	0.076425
0.042429	0.028238	0.821785	0.107548
0.006443	0.91005	0.077174	0.006333
0.119925	0.028359	0.731781	0.119934
0.026634	0.868215	0.029899	0.075253

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me2_5_156_0.647_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069	0.502	0.268	0.161
0.125	0.163	0.561	0.151
0.489	0.302	0.001	0.208
0.001	0.332	0.666	0.001
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.001	0.771	0.227
0.273	0.725	0.001	0.001
0.155	0.274	0.57	0.001
0.001	0.997	0.001	0.001
0.287	0.001	0.252	0.46

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me2_8_160_0.667_1.559765e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.096	0.747	0.091	0.066
0.074	0.062	0.803	0.061
0.738	0.126	0.049	0.087
0.033	0.041	0.869	0.057
0.063	0.815	0.065	0.057
0.07	0.056	0.778	0.096
0.089	0.786	0.056	0.069
0.072	0.057	0.81	0.061
0.025	0.864	0.064	0.047
0.069	0.043	0.099	0.789

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me2_5_158_0.680_7.729978e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.078	0.785	0.068	0.069
0.089	0.063	0.785	0.063
0.725	0.076	0.101	0.098
0.036	0.088	0.812	0.064
0.046	0.841	0.082	0.031
0.085	0.043	0.805	0.067
0.066	0.802	0.061	0.071
0.05	0.081	0.791	0.078
0.051	0.885	0.029	0.035
0.07	0.076	0.082	0.772

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me2_3_157_0.641_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me2_7_173_0.681_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_3_163_0.671_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9ac_14_27_0.620_6.920621e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.068016	0.852352	0.043893	0.035739
0.117618	0.800747	0.015138	0.066497
0.00434	0.08291	0.867009	0.045742
0.913838	0.012825	0.02726	0.046078
0.089086	0.024476	0.770291	0.116148
0.184502	0.766283	0.029111	0.020104
0.111249	0.0	0.880623	0.008128
0.163489	0.781735	0.038474	0.016302
0.031682	0.032766	0.907026	0.028525
0.197678	0.249834	0.215711	0.336777

MOTIF	Limb_E13.5_H3K9ac_9_17_0.611_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.071931	0.79833	0.107735	0.022005
0.083649	0.860828	0.03115	0.024374
0.003878	0.089823	0.906299	0.0
0.848418	0.003962	0.0	0.14762
0.086934	0.144673	0.660488	0.107905
0.0288	0.728635	0.049052	0.193512
0.022414	0.033663	0.870562	0.073361
0.144999	0.798009	0.020541	0.036452
0.019648	0.050764	0.917317	0.012271

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K9ac_23_28_0.609_7.303011e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.01124	0.952068	0.024873	0.01182
0.044283	0.888609	0.015399	0.051709
0.008567	0.042384	0.949049	0.0
0.81349	0.058499	0.044635	0.083375
0.020359	0.16536	0.607484	0.206797
0.031158	0.960327	0.0	0.008515
0.026657	0.067377	0.853068	0.052898
0.011547	0.933153	0.047457	0.007843
0.369589	0.398678	0.049794	0.18194
0.085513	0.508035	0.189457	0.216996

MOTIF	Limb_E12.5_H3K9ac_35_17_0.588_6.144801e-247
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.149735	0.850265	0.0
0.264874	0.090281	0.614942	0.029903
0.019433	0.969851	0.0	0.010716
0.273236	0.639584	0.030478	0.056702
0.00595	0.072352	0.918601	0.003097
0.887609	0.038725	0.026708	0.046958
0.069443	0.146467	0.733911	0.050178
0.19767	0.771338	0.014625	0.016367
0.025623	0.054475	0.894244	0.025657
0.038729	0.899091	0.044089	0.018091
0.05856	0.421435	0.344364	0.175641

MOTIF	Liver_E16.5_H3K9ac_28_30_0.599_2.357992e-251
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025049	0.063485	0.901587	0.009879
0.006304	0.977799	0.015897	0.0
0.050761	0.691394	0.044103	0.213742
0.063379	0.028029	0.902505	0.006087
0.707516	0.025932	0.061236	0.205316
0.073428	0.085138	0.823227	0.018207
0.138152	0.747844	0.058688	0.055316
0.013259	0.021253	0.781911	0.183576
0.031269	0.921165	0.027894	0.019671
0.06398	0.240425	0.468646	0.226948