MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Liver_E15.5_H3K27me3_6_15_0.542_2.721743e-116
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043396	0.453024	0.282886	0.220693
0.0	0.714092	0.057178	0.22873
0.025092	0.027085	0.932327	0.015496
0.0	0.946898	0.0	0.053102
0.059136	0.02857	0.912294	0.0
0.143341	0.031999	0.765981	0.058679
0.014315	0.045649	0.926739	0.013297
0.001486	0.774111	0.074211	0.150192
0.24199	0.019569	0.079928	0.658513
0.006852	0.834952	0.0	0.158196

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K27me3_29_18_0.531_6.654654e-29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025109	0.921143	0.019232	0.034516
0.17314	0.037153	0.752652	0.037055
0.007672	0.918757	0.060048	0.013523
0.048803	0.06291	0.743839	0.144449
0.11728	0.019454	0.676654	0.186612
0.090604	0.030575	0.651979	0.226842
0.005408	0.951693	0.024516	0.018383
0.026576	0.10596	0.050289	0.817175
0.032863	0.84011	0.031895	0.095132
0.331864	0.124381	0.12169	0.422065

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me2_42_48_0.589_6.740953e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.094685	0.198174	0.707141	0.0
0.118996	0.781493	0.022058	0.077453
0.068051	0.664169	0.085463	0.182317
0.143932	0.791135	0.0	0.064933
0.011478	0.0	0.958683	0.02984
0.201549	0.653306	0.0	0.145144
0.0	0.0	0.980876	0.019124
0.0	0.020454	0.979546	0.0
0.875018	0.0	0.0	0.124982

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_42_51_0.593_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	1.0	0.0	0.0
0.106043	0.78433	0.0	0.109627
0.0	0.0	0.930279	0.069721
0.0	0.946899	0.03663	0.016471
0.159126	0.0	0.562521	0.278353
0.060603	0.0	0.79347	0.145927
0.0	0.011741	0.914048	0.074212
0.24233	0.664218	0.043402	0.050049
0.091975	0.053329	0.0	0.854696

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K27me3_13_20_0.533_7.20337e-35
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.711697	0.046366	0.076348	0.16559
0.157882	0.04849	0.704617	0.089011
0.095488	0.831529	0.028287	0.044696
0.173896	0.780936	0.020666	0.024502
0.030944	0.889343	0.044933	0.03478
0.034865	0.024335	0.854588	0.086212
0.04323	0.787496	0.0	0.169274
0.0	0.043815	0.937024	0.019161
0.081375	0.064328	0.822232	0.032065

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K27me3_18_22_0.546_3.327825e-39
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.758431	0.121905	0.044168	0.075496
0.046395	0.03598	0.820082	0.097543
0.081172	0.848731	0.028513	0.041583
0.144298	0.743988	0.045864	0.06585
0.170427	0.72989	0.065077	0.034606
0.008662	0.044033	0.833928	0.113377
0.141534	0.794504	0.012888	0.051075
0.039459	0.02615	0.818453	0.115937
0.066626	0.043657	0.87087	0.018847

MOTIF	Heart_E13.5_H3K9ac_23_19_0.565_3.566771e-301
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.084692	0.677851	0.233243	0.004215
0.905553	0.031973	0.00615	0.056324
0.020956	0.082844	0.826989	0.069211
0.107067	0.809991	0.033501	0.049442
0.193063	0.604414	0.045849	0.156675
0.060604	0.850035	0.059979	0.029381
0.067041	0.02279	0.815846	0.094323
0.025521	0.918017	0.013869	0.042593
0.111012	0.0	0.82807	0.060918
0.104078	0.0	0.595607	0.300315

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K9ac_24_34_0.622_4.436663e-267
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.779182	0.056498	0.050354	0.113967
0.026761	0.025259	0.817542	0.130439
0.036541	0.796735	0.063973	0.102751
0.121955	0.847517	0.0	0.030528
0.040581	0.848186	0.051682	0.05955
0.014813	0.037023	0.924337	0.023827
0.262102	0.684976	0.037665	0.015257
0.19027	0.06175	0.714529	0.033451
0.074875	0.029784	0.865368	0.029973

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K9ac_27_14_0.630_7.968731e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.247879	0.532663	0.131848	0.087609
0.023858	0.042116	0.698529	0.235496
0.025289	0.889419	0.018604	0.066688
0.020209	0.896604	0.046361	0.036825
0.133334	0.796504	0.034757	0.035405
0.032363	0.047008	0.808219	0.11241
0.174782	0.532151	0.241481	0.051586
0.046144	0.054631	0.863926	0.035298
0.035516	0.019905	0.917911	0.026668
0.080945	0.746184	0.113688	0.059183

MOTIF	Limb_E13.5_H3K9ac_13_10_0.608_7.663946e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.249167	0.172216	0.344837	0.23378
0.31594	0.245028	0.145637	0.293395
0.061128	0.054766	0.678312	0.205794
0.036366	0.904388	0.02757	0.031676
0.022953	0.900243	0.040315	0.036489
0.178652	0.695748	0.034724	0.090876
0.086133	0.047763	0.774772	0.091332
0.057307	0.880205	0.042255	0.020233
0.060966	0.025428	0.853888	0.059718
0.068242	0.041823	0.776926	0.113009
0.084077	0.795182	0.073128	0.047613

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K9ac_20_9_0.620_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.44902	0.142215	0.147405	0.261359
0.072554	0.060325	0.7373	0.129821
0.037608	0.907114	0.022496	0.032783
0.075029	0.733844	0.0861	0.105028
0.112832	0.815425	0.04694	0.024804
0.074692	0.026192	0.81172	0.087397
0.109878	0.773998	0.069057	0.047068
0.038978	0.030199	0.891861	0.038962
0.077282	0.065943	0.779995	0.07678
0.124525	0.724558	0.064366	0.086551

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K9ac_13_8_0.638_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.379689	0.288972	0.181529	0.14981
0.071265	0.036866	0.728475	0.163394
0.03558	0.912303	0.017758	0.034359
0.076157	0.69548	0.106337	0.122025
0.134334	0.801729	0.046506	0.017432
0.063881	0.027807	0.809738	0.098574
0.04032	0.851814	0.064917	0.042949
0.050025	0.018467	0.883051	0.048457
0.087077	0.048472	0.784198	0.080252
0.081573	0.733074	0.060985	0.124368