MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Midbrain_P0_H3K27ac_14_157_0.565_1.712517e-136 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.165 0.059 0.052 0.724 0.665 0.131 0.12 0.084 0.12 0.035 0.806 0.039 0.132 0.638 0.146 0.084 0.764 0.04 0.135 0.061 0.741 0.058 0.103 0.098 0.007 0.826 0.073 0.094 0.043 0.053 0.835 0.069 MOTIF Liver_E14.5_H3K4me1_50_176_0.524_9.5078e-39 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092 0.088 0.108 0.712 0.093 0.101 0.081 0.725 0.105 0.102 0.101 0.692 0.693 0.08 0.098 0.129 0.106 0.107 0.668 0.119 0.712 0.093 0.097 0.098 0.701 0.095 0.101 0.103 0.708 0.1 0.093 0.099 0.096 0.706 0.106 0.092 0.102 0.104 0.681 0.113 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me1_17_164_0.531_1.122538e-87 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.097 0.66 0.089 0.154 0.06 0.067 0.763 0.11 0.062 0.063 0.052 0.823 0.035 0.028 0.066 0.871 0.076 0.096 0.719 0.109 0.049 0.85 0.031 0.07 0.062 0.054 0.03 0.854 0.785 0.045 0.078 0.092 0.867 0.042 0.036 0.055 0.811 0.05 0.08 0.059 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me1_9_163_0.534_7.467515e-64 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.106 0.807 0.032 0.055 0.01 0.083 0.807 0.1 0.106 0.16 0.079 0.655 0.001 0.019 0.13 0.85 0.057 0.145 0.546 0.252 0.095 0.817 0.001 0.087 0.013 0.02 0.001 0.966 0.787 0.039 0.121 0.053 0.895 0.008 0.06 0.037 0.601 0.029 0.19 0.18 MOTIF Intestine_P0_H3K4me2_36_168_0.586_1.701478e-257 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_40_156_0.592_3.752716e-208 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.205 0.748 0.028 0.019 0.122 0.018 0.827 0.033 0.055 0.191 0.113 0.641 0.001 0.085 0.057 0.857 0.295 0.11 0.197 0.398 0.103 0.749 0.137 0.011 0.159 0.064 0.002 0.775 0.592 0.05 0.029 0.329 0.78 0.112 0.013 0.095 0.7 0.008 0.124 0.168 MOTIF Intestine_E16.5_H3K4me2_50_167_0.580_1.364435e-164 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.275 0.076 0.35 0.299 0.225 0.134 0.217 0.423 0.123 0.071 0.039 0.767 0.726 0.102 0.07 0.102 0.567 0.102 0.166 0.165 0.471 0.23 0.23 0.069 0.039 0.629 0.134 0.198 0.375 0.23 0.292 0.102 0.07 0.482 0.25 0.197 0.009 0.669 0.313 0.009 0.136 0.167 0.477 0.219 0.268 0.388 0.108 0.236 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me2_58_165_0.577_1.924582e-182 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.137 0.623 0.122 0.118 0.115 0.111 0.628 0.146 0.121 0.154 0.14 0.585 0.119 0.161 0.107 0.613 0.139 0.127 0.572 0.162 0.141 0.594 0.121 0.144 0.139 0.126 0.136 0.599 0.163 0.114 0.146 0.577 0.596 0.13 0.127 0.147 0.614 0.134 0.133 0.119 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me2_21_162_0.596_4.085719e-276 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.144 0.19 0.226 0.441 0.306 0.099 0.093 0.502 0.48 0.192 0.001 0.327 0.644 0.155 0.015 0.186 0.25 0.241 0.382 0.127 0.255 0.408 0.068 0.269 0.487 0.001 0.393 0.119 0.391 0.265 0.326 0.018 0.117 0.867 0.015 0.001 0.045 0.066 0.667 0.222 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me2_15_156_0.650_2.796929e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.094 0.788 0.108 0.01 0.009 0.005 0.916 0.07 0.075 0.361 0.223 0.342 0.187 0.231 0.016 0.566 0.215 0.138 0.408 0.24 0.163 0.485 0.014 0.338 0.208 0.042 0.171 0.579 0.238 0.117 0.269 0.376 0.367 0.129 0.156 0.347 0.373 0.226 0.186 0.215 MOTIF Lung_E14.5_H3K4me2_11_152_0.634_1.336788e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.08 0.883 0.017 0.02 0.016 0.012 0.922 0.05 0.167 0.316 0.179 0.338 0.234 0.159 0.147 0.461 0.321 0.214 0.19 0.275 0.238 0.289 0.162 0.312 0.227 0.129 0.165 0.478 0.285 0.128 0.187 0.4 0.487 0.128 0.016 0.369 0.38 0.215 0.114 0.291 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me2_60_172_0.571_1.207431e-155 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Kidney_E15.5_H3K4me3_64_161_0.585_1.118268e-129 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.108 0.754 0.076 0.062 0.076 0.055 0.79 0.079 0.058 0.081 0.08 0.781 0.042 0.064 0.042 0.852 0.04 0.057 0.09 0.813 0.058 0.797 0.103 0.042 0.055 0.066 0.029 0.85 0.77 0.064 0.083 0.083 0.798 0.096 0.046 0.06 0.797 0.064 0.072 0.067