MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me3_76_175_0.565_3.840431e-69
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.742	0.063	0.109	0.086
0.692	0.003	0.122	0.183
0.146	0.053	0.635	0.166
0.037	0.687	0.2	0.076
0.874	0.063	0.001	0.062
0.135	0.153	0.558	0.154
0.141	0.195	0.151	0.513
0.575	0.15	0.133	0.142
0.231	0.026	0.091	0.652
0.023	0.001	0.007	0.969
0.005	0.051	0.03	0.914
0.184	0.132	0.146	0.538

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me3_91_175_0.527_3.633764e-21
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.328	0.225	0.222	0.225
0.643	0.1	0.116	0.141
0.154	0.109	0.611	0.126
0.145	0.609	0.119	0.127
0.666	0.097	0.098	0.139
0.133	0.117	0.613	0.137
0.145	0.125	0.125	0.605
0.565	0.131	0.129	0.175
0.133	0.112	0.106	0.649
0.098	0.105	0.098	0.699
0.109	0.105	0.103	0.683
0.24	0.218	0.213	0.328

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me3_71_163_0.559_1.174632e-94
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.115	0.1	0.692	0.093
0.109	0.676	0.087	0.128
0.666	0.101	0.117	0.116
0.104	0.1	0.703	0.093
0.092	0.1	0.099	0.709
0.7	0.086	0.103	0.111
0.647	0.108	0.107	0.138
0.127	0.082	0.067	0.724
0.077	0.093	0.072	0.758
0.09	0.097	0.088	0.725

MOTIF	Heart_P0_H3K4me3_76_172_0.555_1.83024e-92
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.815	0.084	0.053	0.048
0.826	0.039	0.063	0.072
0.8	0.07	0.062	0.068
0.088	0.064	0.075	0.773
0.04	0.089	0.071	0.8
0.799	0.053	0.074	0.074
0.075	0.8	0.06	0.065
0.081	0.024	0.03	0.865
0.06	0.095	0.775	0.07
0.097	0.749	0.061	0.093

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_74_161_0.563_1.588766e-83
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.092	0.051	0.782	0.075
0.085	0.815	0.045	0.055
0.773	0.054	0.061	0.112
0.055	0.075	0.792	0.078
0.069	0.088	0.032	0.811
0.761	0.084	0.094	0.061
0.749	0.074	0.038	0.139
0.064	0.055	0.05	0.831
0.037	0.058	0.038	0.867
0.042	0.054	0.082	0.822

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me3_68_166_0.561_1.473563e-72
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.083	0.035	0.808	0.074
0.093	0.782	0.066	0.059
0.834	0.022	0.054	0.09
0.072	0.062	0.813	0.053
0.094	0.065	0.055	0.786
0.766	0.076	0.088	0.07
0.722	0.066	0.08	0.132
0.067	0.068	0.055	0.81
0.039	0.057	0.039	0.865
0.054	0.078	0.053	0.815

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me3_74_163_0.561_1.116292e-77
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.074	0.041	0.809	0.076
0.086	0.779	0.068	0.067
0.811	0.035	0.059	0.095
0.068	0.061	0.814	0.057
0.076	0.104	0.069	0.751
0.781	0.075	0.071	0.073
0.748	0.074	0.056	0.122
0.054	0.054	0.05	0.842
0.028	0.065	0.036	0.871
0.059	0.059	0.088	0.794

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_70_165_0.564_1.492036e-91
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069	0.057	0.797	0.077
0.11	0.75	0.071	0.069
0.8	0.051	0.058	0.091
0.052	0.062	0.815	0.071
0.062	0.107	0.072	0.759
0.777	0.08	0.073	0.07
0.761	0.067	0.047	0.125
0.057	0.054	0.044	0.845
0.02	0.053	0.043	0.884
0.059	0.074	0.055	0.812

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me3_76_163_0.565_1.005429e-103
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049	0.081	0.815	0.055
0.116	0.729	0.069	0.086
0.896	0.001	0.001	0.102
0.061	0.07	0.804	0.065
0.096	0.078	0.091	0.735
0.767	0.055	0.068	0.11
0.072	0.038	0.04	0.85
0.007	0.028	0.012	0.953
0.011	0.031	0.007	0.951
0.071	0.033	0.076	0.82
0.808	0.046	0.051	0.095
0.861	0.051	0.046	0.042

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me3_73_164_0.587_1.901184e-99
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.163	0.128	0.582	0.127
0.116	0.679	0.075	0.13
0.814	0.006	0.007	0.173
0.062	0.082	0.742	0.114
0.091	0.128	0.073	0.708
0.626	0.142	0.09	0.142
0.13	0.041	0.042	0.787
0.038	0.037	0.037	0.888
0.004	0.026	0.047	0.923
0.14	0.075	0.056	0.729
0.703	0.076	0.095	0.126
0.82	0.039	0.07	0.071

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me3_81_164_0.568_5.905099e-90
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.108	0.087	0.715	0.09
0.095	0.72	0.08	0.105
0.794	0.054	0.045	0.107
0.089	0.073	0.742	0.096
0.111	0.097	0.073	0.719
0.703	0.094	0.094	0.109
0.098	0.071	0.069	0.762
0.062	0.075	0.074	0.789
0.057	0.07	0.067	0.806
0.1	0.075	0.082	0.743
0.744	0.086	0.071	0.099
0.763	0.069	0.088	0.08

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me3_77_165_0.562_2.830653e-90
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.105	0.084	0.709	0.102
0.115	0.714	0.075	0.096
0.794	0.052	0.051	0.103
0.086	0.075	0.761	0.078
0.117	0.094	0.086	0.703
0.686	0.099	0.094	0.121
0.09	0.069	0.073	0.768
0.063	0.061	0.068	0.808
0.052	0.073	0.071	0.804
0.112	0.083	0.084	0.721
0.76	0.078	0.068	0.094
0.771	0.069	0.091	0.069

MOTIF	Limb_E12.5_H3K9ac_55_167_0.553_4.064499e-55
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.001	0.997	0.001
0.001	0.997	0.001	0.001
0.635	0.031	0.085	0.249
0.143	0.001	0.855	0.001
0.034	0.156	0.001	0.809
0.678	0.001	0.001	0.32
0.077	0.001	0.001	0.921
0.001	0.001	0.046	0.952
0.001	0.152	0.001	0.846
0.311	0.001	0.195	0.492
0.716	0.001	0.001	0.282
0.817	0.001	0.162	0.02