MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me3_60_173_0.588_4.583914e-140
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.151	0.282	0.108	0.459
0.014	0.03	0.129	0.827
0.1	0.16	0.05	0.69
0.165	0.101	0.439	0.295
0.108	0.768	0.001	0.123
0.497	0.001	0.325	0.178
0.628	0.001	0.205	0.166
0.683	0.194	0.051	0.072

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me3_39_157_0.645_2.371795e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.341	0.042	0.114	0.503
0.224	0.2	0.121	0.454
0.149	0.453	0.097	0.301
0.243	0.212	0.489	0.056
0.523	0.111	0.345	0.021
0.997	0.001	0.001	0.001
0.997	0.001	0.001	0.001
0.469	0.07	0.276	0.185
0.103	0.692	0.058	0.147
0.15	0.062	0.526	0.262

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me3_28_156_0.650_4.609091e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.293	0.167	0.166	0.373
0.27	0.224	0.203	0.302
0.209	0.345	0.169	0.277
0.231	0.195	0.352	0.221
0.398	0.192	0.284	0.126
0.997	0.001	0.001	0.001
0.996	0.001	0.001	0.002
0.43	0.184	0.206	0.181
0.152	0.645	0.063	0.14
0.148	0.085	0.516	0.251

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me3_38_164_0.663_2.010897e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.129	0.116	0.121	0.634
0.132	0.146	0.137	0.585
0.14	0.589	0.113	0.158
0.147	0.128	0.589	0.136
0.577	0.141	0.154	0.128
0.641	0.116	0.121	0.122
0.625	0.117	0.119	0.139
0.544	0.148	0.157	0.151
0.14	0.61	0.119	0.131
0.132	0.125	0.608	0.135

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me3_40_157_0.651_2.904099e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.155	0.104	0.094	0.647
0.16	0.159	0.174	0.507
0.122	0.555	0.143	0.18
0.143	0.128	0.574	0.155
0.521	0.171	0.162	0.146
0.867	0.012	0.053	0.068
0.744	0.056	0.101	0.099
0.476	0.17	0.171	0.183
0.16	0.571	0.11	0.159
0.157	0.139	0.557	0.147

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me3_33_163_0.668_6.597942e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.156	0.192	0.125	0.527
0.127	0.032	0.111	0.73
0.065	0.033	0.114	0.788
0.034	0.155	0.113	0.698
0.177	0.648	0.013	0.162
0.12	0.131	0.733	0.016
0.204	0.214	0.186	0.396
0.523	0.125	0.114	0.238

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me3_73_171_0.568_3.093015e-103
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me3_46_173_0.607_3.496375e-221
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.114	0.147	0.12	0.619
0.138	0.149	0.117	0.596
0.136	0.133	0.572	0.159
0.15	0.579	0.127	0.144
0.594	0.121	0.141	0.144
0.632	0.111	0.134	0.123
0.616	0.125	0.127	0.132
0.563	0.14	0.144	0.153
0.154	0.617	0.101	0.128
0.129	0.112	0.612	0.147

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me3_55_174_0.600_1.999496e-205
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.099	0.101	0.092	0.708
0.106	0.098	0.066	0.73
0.121	0.101	0.64	0.138
0.121	0.672	0.105	0.102
0.705	0.086	0.103	0.106
0.755	0.073	0.094	0.078
0.767	0.084	0.075	0.074
0.634	0.115	0.136	0.115
0.103	0.703	0.084	0.11
0.107	0.094	0.686	0.113

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me3_47_164_0.624_6.245301e-244
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.14	0.138	0.116	0.606
0.167	0.172	0.023	0.638
0.156	0.13	0.505	0.209
0.171	0.526	0.155	0.148
0.605	0.074	0.154	0.167
0.705	0.047	0.145	0.103
0.725	0.115	0.03	0.13
0.451	0.201	0.172	0.175
0.16	0.626	0.073	0.141
0.15	0.106	0.619	0.125

MOTIF	Heart_E16.5_H3K27me3_16_173_0.531_2.469668e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.592	0.135	0.126	0.147
0.135	0.133	0.135	0.597
0.133	0.572	0.154	0.141
0.143	0.149	0.582	0.126
0.618	0.129	0.144	0.109
0.626	0.121	0.131	0.122
0.615	0.114	0.145	0.126
0.125	0.137	0.608	0.13
0.135	0.591	0.149	0.125
0.133	0.13	0.598	0.139

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me3_50_167_0.601_8.182999e-209
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me3_72_175_0.590_1.310506e-145
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.372	0.406	0.167	0.054
0.148	0.124	0.692	0.036
0.156	0.639	0.079	0.126
0.117	0.001	0.362	0.52
0.21	0.08	0.08	0.63
0.046	0.028	0.257	0.669
0.224	0.378	0.085	0.314
0.622	0.043	0.334	0.001
0.218	0.213	0.104	0.466
0.022	0.05	0.13	0.798
0.136	0.297	0.348	0.219
0.203	0.256	0.274	0.267