MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K27me3_41_26_0.507_3.570768e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013004	0.897147	0.080126	0.009723
0.27355	0.676837	0.030942	0.018671
0.097899	0.003454	0.895144	0.003503
0.057454	0.701244	0.076535	0.164768
0.030715	0.623943	0.186625	0.158717
0.041568	0.022478	0.031115	0.904838
0.049065	0.794797	0.1094	0.046738
0.063586	0.89188	0.022664	0.02187
0.053979	0.888281	0.030352	0.027388

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_67_22_0.577_1.128744e-174
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.039873	0.065988	0.755975	0.138164
0.010822	0.795421	0.154699	0.039058
0.119575	0.709878	0.055197	0.11535
0.093275	0.068838	0.771081	0.066807
0.045166	0.815929	0.064698	0.074207
0.007792	0.860533	0.076374	0.055301
0.082378	0.050553	0.01283	0.854239
0.026842	0.809131	0.12261	0.041417
0.002997	0.936559	0.00606	0.054384
0.480023	0.097507	0.032281	0.390189
0.020023	0.341873	0.524804	0.1133

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me3_64_38_0.608_7.465587e-230
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02478	0.057	0.732272	0.185948
0.010217	0.745342	0.177475	0.066966
0.147223	0.719089	0.021322	0.112366
0.027424	0.105864	0.783376	0.083336
0.027616	0.79686	0.080427	0.095097
0.035093	0.835478	0.032955	0.096475
0.056301	0.03463	0.0	0.909069
0.019207	0.781969	0.119846	0.078978
0.007135	0.953868	0.0	0.038997

MOTIF	Limb_E12.5_H3K4me3_52_41_0.607_2.250237e-268
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.084999	0.034293	0.813409	0.067299
0.012345	0.672739	0.21174	0.103177
0.176764	0.739889	0.046019	0.037329
0.02507	0.178161	0.762064	0.034705
0.095733	0.737754	0.073182	0.093332
0.016817	0.795324	0.037435	0.150424
0.068047	0.014512	0.017008	0.900433
0.036896	0.903565	0.035879	0.02366
0.0099	0.948075	0.011009	0.031016

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me3_55_20_0.599_3.478069e-230
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038396	0.595692	0.269549	0.096363
0.210769	0.321167	0.287464	0.180601
0.047991	0.504548	0.439834	0.007626
0.698001	0.063522	0.090229	0.148247
0.010174	0.011145	0.977081	0.0016
0.074685	0.042828	0.8802	0.002287
0.825907	0.028723	0.046373	0.098997
0.052652	0.089657	0.802043	0.055648
0.037564	0.178533	0.742434	0.041469
0.071447	0.743722	0.079757	0.105075
0.059806	0.073418	0.76986	0.096916
0.049786	0.114665	0.827736	0.007814

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me3_43_32_0.610_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.820424	0.06856	0.056061	0.054954
0.016845	0.006841	0.975697	0.000617
0.034328	0.03881	0.904224	0.022639
0.816199	0.044121	0.082385	0.057295
0.161253	0.069904	0.718717	0.050126
0.110159	0.211701	0.644864	0.033275
0.026258	0.875785	0.055998	0.041959
0.097667	0.0318	0.772052	0.09848
0.104656	0.196685	0.653558	0.045102

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me3_67_38_0.590_1.053371e-307
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.756033	0.049123	0.139193	0.055652
0.064393	0.004927	0.928043	0.002638
0.102256	0.026823	0.868271	0.00265
0.906093	0.052266	0.01115	0.030491
0.156168	0.100079	0.73661	0.007143
0.105555	0.197143	0.654695	0.042607
0.075792	0.843051	0.049764	0.031393
0.091177	0.042765	0.740438	0.125621
0.043359	0.057057	0.851412	0.048172

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me3_71_50_0.557_1.448159e-122
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.24779	0.451311	0.294124	0.006775
0.889783	0.032576	0.056302	0.021339
0.064888	0.014167	0.916949	0.003996
0.02251	0.02096	0.954269	0.002261
0.914498	0.032284	0.007678	0.04554
0.048205	0.050007	0.806016	0.095772
0.051123	0.222774	0.654544	0.071559
0.055689	0.717366	0.188026	0.038919
0.043684	0.145429	0.714769	0.096117
0.165177	0.030075	0.787943	0.016805

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me3_62_15_0.612_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.055957	0.40911	0.471685	0.063248
0.056923	0.815867	0.028781	0.098429
0.04377	0.058824	0.836393	0.061013
0.012	0.815812	0.07172	0.100468
0.083047	0.633638	0.128925	0.15439
0.057843	0.049052	0.075217	0.817888
0.003238	0.723409	0.160514	0.112838
0.001887	0.972357	0.007675	0.018081
0.12091	0.063095	0.086998	0.728996
0.005648	0.905786	0.045263	0.043303
0.243497	0.020224	0.399192	0.337087
0.003894	0.04306	0.951527	0.001519

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me3_63_29_0.591_1.490978e-236
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088537	0.826125	0.022356	0.062981
0.07708	0.06981	0.702579	0.15053
0.028455	0.792177	0.109147	0.070221
0.043516	0.801003	0.055744	0.099737
0.085902	0.053067	0.057835	0.803195
0.001858	0.879273	0.030844	0.088025
0.002727	0.9245	0.012419	0.060354
0.06832	0.10632	0.074292	0.751068
0.031616	0.711611	0.182211	0.074562

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me3_59_23_0.602_2.599154e-247
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.056304	0.832424	0.034328	0.076943
0.032734	0.050513	0.743906	0.172847
0.015791	0.856665	0.065348	0.062196
0.01161	0.742226	0.126873	0.119292
0.09757	0.057855	0.047625	0.79695
0.00232	0.800128	0.104734	0.092818
0.004575	0.894452	0.018032	0.082941
0.10467	0.063729	0.072312	0.759289
0.003104	0.789214	0.156763	0.05092
0.170578	0.061339	0.35088	0.417204

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me3_51_22_0.627_1.747532e-307
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.155899	0.803604	0.032831	0.007667
0.070347	0.070533	0.839207	0.019913
0.007273	0.842285	0.049402	0.10104
0.006794	0.582527	0.226534	0.184146
0.054935	0.049242	0.078502	0.817322
0.001366	0.792386	0.172048	0.0342
0.036731	0.938344	0.010593	0.014332
0.028898	0.09252	0.087917	0.790666
0.047227	0.819214	0.052664	0.080895
0.101933	0.0	0.335325	0.562742

MOTIF	Heart_E16.5_H3K9ac_60_68_0.537_1.306442e-88
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.916403	0.032481	0.0	0.051116
0.008803	0.05532	0.930036	0.005841
0.006631	0.833806	0.062836	0.096727
0.02932	0.613278	0.202058	0.155344
0.095818	0.031376	0.836284	0.036522
0.015585	0.764442	0.100331	0.119642
0.0	0.787702	0.167753	0.044545
0.086062	0.038639	0.038929	0.836371
0.0	0.943127	0.033599	0.023274