MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me1_78_80_0.513_1.874087e-41
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.126193	0.840492	0.033316	0.0
0.218165	0.133129	0.190205	0.458502
0.002968	0.054634	0.927943	0.014456
0.170964	0.022301	0.018574	0.788161
0.087832	0.036098	0.85936	0.01671
0.855144	0.048134	0.040604	0.056118
0.034968	0.942703	0.003003	0.019326
0.050928	0.892139	0.012623	0.044311
0.001745	0.930253	0.038962	0.029041
0.121117	0.061095	0.28344	0.534348
0.025781	0.117909	0.583697	0.272613

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K27me3_58_44_0.504_1.016105e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.316348	0.451787	0.192643	0.039222
0.005944	0.962962	0.014168	0.016926
0.659389	0.130719	0.091193	0.118699
0.019613	0.075779	0.847363	0.057246
0.070161	0.124281	0.758724	0.046834
0.086162	0.040009	0.805247	0.068583
0.133647	0.084928	0.049062	0.732362
0.031821	0.901525	0.049043	0.017611
0.058846	0.190116	0.034556	0.716483
0.002501	0.914106	0.055357	0.028036
0.067491	0.206277	0.274629	0.451604

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K27me3_64_73_0.501_0.004085615
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.002856	0.955779	0.023324	0.018041
0.787791	0.028439	0.123187	0.060583
0.039899	0.082218	0.877081	0.000802
0.076674	0.165861	0.693082	0.064383
0.10705	0.011455	0.806986	0.074509
0.165904	0.092583	0.053228	0.688285
0.041206	0.899891	0.020772	0.038131
0.110696	0.134461	0.010585	0.744257
0.001453	0.892267	0.070803	0.035477
0.095658	0.334723	0.187162	0.382457
0.027475	0.220299	0.733783	0.018443

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K27me3_63_42_0.505_3.955945e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.008086	0.961745	0.01068	0.019489
0.72401	0.096022	0.112443	0.067526
0.031702	0.084797	0.871258	0.012243
0.057672	0.142828	0.756871	0.042629
0.121142	0.042497	0.772836	0.063524
0.077787	0.059093	0.016305	0.846815
0.021689	0.910155	0.037633	0.030523
0.164938	0.191567	0.024176	0.61932
0.00185	0.937342	0.037031	0.023777
0.136218	0.419451	0.208924	0.235408

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K27me3_62_42_0.506_0.001020762
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.002483	0.978512	0.006498	0.012506
0.652887	0.164431	0.079525	0.103157
0.039207	0.075567	0.858958	0.026268
0.068509	0.071453	0.814728	0.04531
0.051638	0.036368	0.853473	0.05852
0.084809	0.163068	0.051607	0.700515
0.014545	0.922977	0.031216	0.031263
0.091648	0.242479	0.031786	0.634087
0.000742	0.91424	0.044455	0.040563
0.109766	0.391174	0.317449	0.181611

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K27ac_77_46_0.512_1.232435e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005043	0.976212	0.0	0.018745
0.582686	0.206023	0.197266	0.014025
0.040645	0.030981	0.91475	0.013623
0.163926	0.02939	0.780467	0.026216
0.018971	0.035418	0.926743	0.018869
0.224044	0.103992	0.0	0.671964
0.026035	0.845202	0.106469	0.022295
0.172261	0.0592	0.186153	0.582386
0.0	0.847858	0.094082	0.05806
0.27104	0.129482	0.459678	0.139799
0.012022	0.488749	0.485792	0.013438

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K27ac_90_58_0.504_8.345758e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.004396	0.979951	0.009118	0.006535
0.734871	0.136274	0.081954	0.046901
0.048101	0.084466	0.851996	0.015436
0.090133	0.118607	0.726042	0.065218
0.049845	0.033558	0.863098	0.053499
0.064113	0.032367	0.030282	0.873237
0.010845	0.917458	0.039822	0.031875
0.262656	0.178788	0.015013	0.543543
0.005229	0.936995	0.027421	0.030356
0.158511	0.057275	0.316524	0.46769
0.0	0.355503	0.603469	0.041027

MOTIF	Kidney_P0_H3K27ac_72_55_0.508_6.124175e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005054	0.976783	0.0	0.018163
0.649486	0.147624	0.157233	0.045656
0.023103	0.155149	0.808345	0.013402
0.186106	0.043309	0.715483	0.055101
0.019109	0.020404	0.890426	0.070062
0.194533	0.036684	0.021413	0.74737
0.017431	0.923818	0.052688	0.006063
0.267492	0.07872	0.025503	0.628286
0.001094	0.90007	0.065017	0.033819
0.223753	0.532614	0.135094	0.108539
0.033132	0.196565	0.724268	0.046035

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me1_96_41_0.504_8.379607e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001303	0.984569	0.007911	0.006217
0.731195	0.104157	0.106362	0.058286
0.036626	0.032428	0.912966	0.01798
0.053364	0.043664	0.811377	0.091595
0.024494	0.02081	0.915163	0.039532
0.198883	0.137288	0.091835	0.571994
0.033953	0.921768	0.019317	0.024962
0.153725	0.140583	0.02076	0.684933
0.0	0.906017	0.051969	0.042015
0.139367	0.060042	0.641372	0.159218
0.0	0.250381	0.749619	0.0
0.0	0.019895	0.0	0.980105

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me1_65_41_0.514_5.167214e-29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.240506	0.492537	0.231694	0.035263
0.007012	0.97081	0.010456	0.011722
0.653658	0.161105	0.144809	0.040427
0.040306	0.047268	0.895031	0.017396
0.03674	0.044019	0.837031	0.082211
0.059484	0.02303	0.820172	0.097314
0.072299	0.188054	0.024256	0.715391
0.049993	0.91685	0.017362	0.015795
0.073566	0.205689	0.013385	0.70736
0.0	0.914511	0.034242	0.051247
0.142263	0.049061	0.69058	0.118096
0.0	0.366662	0.633338	0.0
0.057845	0.050738	0.026775	0.864643
0.0	0.0	0.985714	0.014286

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me1_91_70_0.505_4.8734e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.003165	0.983334	0.011707	0.001793
0.835237	0.05645	0.043394	0.064919
0.047281	0.034514	0.910979	0.007225
0.111408	0.22635	0.595232	0.06701
0.058695	0.02171	0.903029	0.016567
0.1259	0.030967	0.030404	0.812729
0.022359	0.897052	0.035841	0.044747
0.278831	0.193159	0.012359	0.515651
0.006661	0.960508	0.0	0.032832
0.168989	0.155976	0.309431	0.365605
0.014593	0.025712	0.923313	0.036383

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me1_107_41_0.501_7.958241e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.006162	0.98388	0.005799	0.004158
0.728085	0.066646	0.047649	0.157621
0.015051	0.066199	0.894164	0.024586
0.100588	0.142376	0.682699	0.074338
0.069134	0.045432	0.825512	0.059923
0.078459	0.233371	0.101681	0.586489
0.017948	0.896794	0.026257	0.059001
0.084872	0.083354	0.018069	0.813705
0.004103	0.897195	0.066346	0.032356
0.123313	0.304223	0.322003	0.250461

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me1_92_48_0.503_1.902038e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001864	0.979408	0.011636	0.007092
0.67909	0.10845	0.064287	0.148172
0.035327	0.083155	0.869576	0.011942
0.078919	0.112167	0.760786	0.048128
0.058564	0.049207	0.840066	0.052163
0.128563	0.132449	0.063009	0.675978
0.011446	0.903811	0.024229	0.060514
0.092614	0.109394	0.013628	0.784365
0.001436	0.802086	0.159919	0.03656
0.115667	0.225639	0.36304	0.295654