MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_27_172_0.529_2.743357e-58
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.789	0.079	0.131
0.059	0.643	0.001	0.297
0.109	0.605	0.106	0.18
0.115	0.27	0.342	0.273
0.324	0.001	0.414	0.261
0.001	0.001	0.997	0.001
0.264	0.001	0.707	0.028
0.001	0.007	0.989	0.003
0.997	0.001	0.001	0.001
0.533	0.095	0.371	0.001

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me1_29_153_0.540_2.07946e-67
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.057	0.4	0.199	0.345
0.001	0.873	0.001	0.125
0.004	0.858	0.001	0.137
0.001	0.997	0.001	0.001
0.449	0.134	0.001	0.416
0.283	0.001	0.715	0.001
0.245	0.001	0.753	0.001
0.25	0.001	0.748	0.001
0.401	0.001	0.597	0.001
0.434	0.085	0.439	0.042
0.301	0.27	0.366	0.063
0.234	0.388	0.176	0.202

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me1_9_152_0.554_2.819783e-52
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.665	0.147	0.187
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.835	0.001	0.163
0.274	0.486	0.019	0.221
0.356	0.01	0.439	0.195
0.198	0.001	0.8	0.001
0.262	0.016	0.721	0.001
0.152	0.048	0.799	0.001
0.343	0.001	0.655	0.001
0.281	0.163	0.459	0.097

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me1_36_170_0.528_3.418483e-59
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.066	0.336	0.132	0.466
0.012	0.395	0.001	0.592
0.001	0.739	0.001	0.259
0.001	0.786	0.001	0.212
0.047	0.951	0.001	0.001
0.199	0.5	0.062	0.239
0.207	0.131	0.492	0.17
0.099	0.001	0.735	0.165
0.228	0.001	0.761	0.01
0.178	0.001	0.766	0.055

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me1_25_165_0.532_1.217498e-63
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005	0.817	0.036	0.142
0.001	0.782	0.001	0.216
0.001	0.892	0.001	0.106
0.11	0.595	0.005	0.29
0.303	0.007	0.365	0.325
0.064	0.001	0.865	0.07
0.012	0.001	0.986	0.001
0.134	0.001	0.864	0.001
0.518	0.001	0.48	0.001
0.559	0.128	0.257	0.056

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me1_22_157_0.535_8.341131e-124
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.128	0.266	0.215	0.39
0.001	0.997	0.001	0.001
0.013	0.562	0.001	0.424
0.001	0.996	0.002	0.001
0.289	0.383	0.001	0.328
0.3	0.11	0.375	0.215
0.022	0.001	0.854	0.123
0.399	0.001	0.599	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001
0.603	0.001	0.395	0.001
0.362	0.321	0.316	0.001
0.328	0.226	0.163	0.283

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me1_27_164_0.531_6.21302e-63
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.073	0.248	0.131	0.548
0.001	0.626	0.059	0.314
0.047	0.688	0.001	0.264
0.162	0.836	0.001	0.001
0.223	0.48	0.064	0.234
0.446	0.098	0.292	0.165
0.123	0.027	0.849	0.001
0.294	0.001	0.704	0.001
0.001	0.14	0.858	0.001
0.788	0.001	0.21	0.001
0.362	0.134	0.495	0.009
0.375	0.265	0.198	0.162

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_13_155_0.540_1.45357e-131
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.152	0.168	0.27	0.411
0.026	0.412	0.16	0.402
0.052	0.502	0.013	0.433
0.001	0.877	0.009	0.113
0.038	0.696	0.007	0.259
0.001	0.944	0.004	0.051
0.242	0.116	0.001	0.641
0.097	0.01	0.806	0.087
0.075	0.007	0.811	0.107
0.154	0.001	0.834	0.011
0.269	0.068	0.63	0.033
0.61	0.111	0.183	0.096

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me1_16_157_0.540_1.954536e-143
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005	0.356	0.07	0.569
0.001	0.713	0.068	0.218
0.003	0.757	0.001	0.239
0.001	0.997	0.001	0.001
0.224	0.449	0.005	0.322
0.308	0.039	0.388	0.265
0.001	0.001	0.905	0.093
0.238	0.001	0.76	0.001
0.174	0.001	0.824	0.001
0.549	0.049	0.4	0.002
0.478	0.16	0.295	0.066
0.33	0.22	0.215	0.235

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me1_26_163_0.535_3.675189e-97
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.073	0.322	0.116	0.489
0.001	0.788	0.061	0.15
0.001	0.753	0.001	0.245
0.002	0.899	0.001	0.098
0.233	0.467	0.001	0.299
0.303	0.001	0.427	0.268
0.11	0.001	0.812	0.077
0.236	0.001	0.762	0.001
0.128	0.001	0.87	0.001
0.668	0.001	0.33	0.001
0.515	0.171	0.313	0.001
0.374	0.227	0.175	0.225

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_20_159_0.534_2.9059e-57
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.207	0.228	0.245	0.32
0.033	0.327	0.239	0.4
0.024	0.365	0.139	0.471
0.019	0.601	0.053	0.327
0.018	0.665	0.008	0.309
0.072	0.661	0.01	0.257
0.232	0.372	0.057	0.339
0.321	0.091	0.332	0.256
0.056	0.012	0.916	0.016
0.33	0.012	0.602	0.056
0.285	0.14	0.554	0.021
0.371	0.187	0.305	0.137

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_22_167_0.535_3.892222e-78
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.08	0.095	0.091	0.734
0.049	0.781	0.083	0.087
0.073	0.784	0.038	0.105
0.079	0.802	0.037	0.082
0.122	0.672	0.077	0.129
0.146	0.078	0.64	0.136
0.09	0.042	0.78	0.088
0.11	0.021	0.8	0.069
0.082	0.065	0.81	0.043
0.769	0.069	0.108	0.054
0.711	0.102	0.126	0.061
0.715	0.095	0.104	0.086

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me1_20_159_0.539_5.13474e-120
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.152	0.281	0.17	0.396
0.043	0.61	0.042	0.305
0.165	0.396	0.039	0.4
0.044	0.547	0.357	0.052
0.279	0.421	0.042	0.258
0.386	0.078	0.308	0.228
0.245	0.022	0.632	0.101
0.345	0.023	0.602	0.03
0.047	0.18	0.745	0.028
0.626	0.04	0.301	0.033
0.44	0.145	0.381	0.034
0.34	0.244	0.218	0.199