MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me3_25_26_0.683_1.11563e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.063051	0.842548	0.033565	0.060836
0.049343	0.816821	0.07366	0.060176
0.0	0.048616	0.941562	0.009822
0.786837	0.021208	0.151697	0.040258
0.007112	0.024553	0.963559	0.004776
0.097062	0.667368	0.043665	0.191905
0.065234	0.686646	0.123485	0.124635
0.192176	0.093312	0.568129	0.146384
0.107102	0.838758	0.022769	0.031371
0.055521	0.024423	0.513499	0.406556
0.00671	0.424341	0.329664	0.239285

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me3_11_23_0.726_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.09214	0.736133	0.120981	0.050746
0.0	0.026219	0.973781	0.0
0.849797	0.021124	0.054128	0.074951
0.002493	0.079839	0.855695	0.061974
0.052029	0.732046	0.073952	0.141973
0.215969	0.488326	0.018594	0.277111
0.011042	0.056996	0.931961	0.0
0.032409	0.861209	0.038234	0.068147
0.080034	0.042454	0.769246	0.108267

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me3_14_24_0.668_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.039598	0.839497	0.068421	0.052485
0.0	0.074259	0.915243	0.010497
0.829052	0.0	0.068298	0.10265
0.003404	0.040243	0.784671	0.171683
0.434588	0.454516	0.074113	0.036783
0.044296	0.955704	0.0	0.0
0.108253	0.063274	0.827181	0.001292
0.018604	0.925658	0.051551	0.004186
0.013125	0.057742	0.929133	0.0
0.877543	0.087453	0.0	0.035003

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me3_10_33_0.705_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.06699	0.811025	0.073008	0.048977
0.010936	0.031152	0.948538	0.009374
0.88493	0.021825	0.053081	0.040163
0.020556	0.103793	0.768541	0.10711
0.070202	0.67971	0.045839	0.204249
0.0	0.82756	0.149853	0.022588
0.236969	0.088513	0.660806	0.013712
0.025756	0.863627	0.022059	0.088558
0.0	0.087293	0.67061	0.242097

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me3_14_37_0.732_9.993466e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.111587	0.804304	0.028013	0.056096
0.013079	0.065552	0.921369	0.0
0.833421	0.038057	0.0	0.128522
0.008365	0.057636	0.929727	0.004272
0.31336	0.452883	0.047588	0.18617
0.059197	0.882096	0.032107	0.026601
0.117262	0.085588	0.760825	0.036326
0.086714	0.775631	0.00969	0.127964
0.0	0.045851	0.921315	0.032834

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me3_12_28_0.720_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.077202	0.88276	0.009257	0.030781
0.00495	0.054448	0.940602	0.0
0.795075	0.048998	0.018281	0.137646
0.008717	0.029707	0.958965	0.002611
0.193112	0.596962	0.101025	0.108901
0.048693	0.889958	0.046638	0.014711
0.1734	0.083234	0.717787	0.025578
0.148262	0.762637	0.044656	0.044446
0.107148	0.060941	0.813666	0.018245

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me3_5_31_0.756_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.107956	0.670409	0.045146	0.176489
0.0	0.12231	0.876461	0.001229
0.82828	0.089771	0.036799	0.045149
0.003591	0.069914	0.920381	0.006114
0.248279	0.515341	0.067557	0.168823
0.185392	0.62607	0.133048	0.05549
0.024792	0.055286	0.857234	0.062688
0.148938	0.807582	0.032878	0.010602
0.024964	0.021356	0.875608	0.078072

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me3_42_30_0.640_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031237	0.04534	0.870559	0.052864
0.906388	0.040245	0.028041	0.025326
0.11705	0.043355	0.793926	0.045669
0.028277	0.809926	0.05272	0.109076
0.071193	0.855763	0.042321	0.030723
0.142763	0.082929	0.774308	0.0
0.334035	0.60439	0.053617	0.007958
0.016863	0.032902	0.869872	0.080362
0.031397	0.906425	0.042816	0.019362
0.233604	0.262601	0.092856	0.41094

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K9ac_34_15_0.590_6.866873e-232
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041966	0.783488	0.171339	0.003207
0.225661	0.664136	0.068391	0.041812
0.0	0.084198	0.915802	0.0
0.760803	0.082141	0.101731	0.055325
0.004952	0.009972	0.919285	0.065791
0.189579	0.685175	0.057537	0.067709
0.10557	0.668716	0.028948	0.196767
0.026309	0.022795	0.914175	0.036721
0.007636	0.95498	0.016434	0.02095
0.25738	0.35755	0.055768	0.329302
0.021517	0.704094	0.040704	0.233685

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K9ac_26_37_0.619_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.106679	0.731246	0.07626	0.085815
0.008577	0.114734	0.875086	0.001603
0.876143	0.0	0.089422	0.034434
0.006236	0.022427	0.971338	0.0
0.218645	0.609047	0.140424	0.031884
0.198952	0.746743	0.024495	0.02981
0.069513	0.016355	0.862973	0.051159
0.016238	0.828864	0.154898	0.0
0.070296	0.718002	0.059262	0.15244

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K9ac_15_44_0.639_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.123558	0.129025	0.747417	0.0
0.090056	0.732297	0.105283	0.072364
0.022107	0.112489	0.85952	0.005885
0.700204	0.113603	0.119264	0.066929
0.0	0.186213	0.710734	0.103053
0.086448	0.554829	0.182415	0.176308
0.158054	0.691343	0.150604	0.0
0.159168	0.027183	0.569455	0.244194
0.022045	0.970575	0.0	0.00738

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K9ac_13_29_0.668_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.489093	0.295221	0.215687
0.032724	0.02671	0.923508	0.017057
0.01712	0.866137	0.106312	0.010431
0.0	0.027276	0.972724	0.0
0.798986	0.046199	0.039494	0.115321
0.0	0.028357	0.956859	0.014785
0.450491	0.332456	0.037885	0.179168
0.061387	0.915818	0.00983	0.012965
0.017136	0.034871	0.884495	0.063499
0.0	0.995406	0.004594	0.0

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K9ac_27_44_0.584_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.017716	0.169007	0.813277	0.0
0.15074	0.601988	0.0	0.247273
0.0	0.162288	0.837712	0.0
0.657803	0.057699	0.145352	0.139146
0.014124	0.144512	0.822199	0.019165
0.536166	0.246584	0.06563	0.151619
0.062364	0.783613	0.150749	0.003274
0.016612	0.054157	0.891912	0.037319
0.097184	0.884667	0.018149	0.0