MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K27ac_49_156_0.529_2.910558e-16 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.776 0.074 0.08 0.07 0.735 0.091 0.09 0.084 0.122 0.102 0.11 0.666 0.091 0.061 0.107 0.741 0.083 0.091 0.741 0.085 0.082 0.755 0.095 0.068 0.79 0.047 0.058 0.105 0.078 0.073 0.771 0.078 0.097 0.732 0.075 0.096 0.075 0.097 0.069 0.759 0.056 0.091 0.093 0.76 0.062 0.085 0.082 0.771 MOTIF Hindbrain_P0_H3K27ac_21_154_0.550_1.445193e-79 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.868 0.001 0.13 0.001 0.767 0.001 0.231 0.001 0.542 0.21 0.001 0.247 0.322 0.001 0.227 0.45 0.232 0.001 0.766 0.001 0.089 0.786 0.124 0.001 0.628 0.001 0.001 0.37 0.001 0.001 0.8 0.198 0.09 0.571 0.201 0.138 0.122 0.488 0.001 0.39 0.013 0.165 0.001 0.821 0.079 0.133 0.215 0.573 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K27ac_12_156_0.554_3.345456e-141 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.481 0.165 0.249 0.105 0.58 0.261 0.141 0.018 0.525 0.002 0.229 0.244 0.2 0.056 0.547 0.197 0.186 0.627 0.18 0.007 0.615 0.002 0.001 0.382 0.002 0.012 0.884 0.102 0.002 0.681 0.154 0.163 0.315 0.372 0.022 0.291 0.257 0.149 0.089 0.505 0.042 0.232 0.11 0.616 0.03 0.273 0.118 0.579 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K27ac_15_159_0.550_1.634747e-74 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.625 0.171 0.162 0.042 0.696 0.201 0.102 0.001 0.617 0.001 0.194 0.188 0.202 0.001 0.681 0.116 0.128 0.716 0.155 0.001 0.565 0.001 0.001 0.433 0.001 0.035 0.88 0.084 0.005 0.861 0.085 0.049 0.386 0.216 0.001 0.397 0.165 0.094 0.085 0.656 0.001 0.025 0.001 0.973 0.052 0.241 0.074 0.633 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K27ac_20_160_0.564_6.007883e-109 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.538 0.178 0.144 0.14 0.696 0.233 0.039 0.032 0.566 0.022 0.151 0.261 0.324 0.017 0.549 0.11 0.214 0.615 0.151 0.02 0.6 0.007 0.016 0.377 0.032 0.031 0.901 0.036 0.03 0.635 0.16 0.175 0.319 0.335 0.017 0.329 0.249 0.028 0.128 0.595 0.028 0.044 0.03 0.898 0.021 0.168 0.037 0.774 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K27ac_12_155_0.564_3.069203e-131 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.489 0.263 0.205 0.042 0.484 0.016 0.259 0.24 0.235 0.034 0.557 0.174 0.183 0.742 0.043 0.032 0.419 0.001 0.002 0.578 0.025 0.039 0.893 0.043 0.096 0.686 0.074 0.144 0.453 0.286 0.017 0.245 0.304 0.035 0.036 0.625 0.035 0.028 0.025 0.912 0.013 0.165 0.039 0.783 0.142 0.308 0.052 0.498 MOTIF Liver_E13.5_H3K4me1_51_161_0.526_1.999274e-72 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.537 0.106 0.21 0.147 0.75 0.053 0.015 0.182 0.672 0.143 0.062 0.123 0.657 0.001 0.125 0.217 0.268 0.122 0.559 0.051 0.001 0.962 0.001 0.036 0.8 0.001 0.001 0.198 0.017 0.143 0.713 0.127 0.163 0.148 0.007 0.682 0.112 0.01 0.136 0.742 0.019 0.091 0.123 0.767 0.223 0.151 0.137 0.489 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me1_5_158_0.549_2.986474e-168 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.518 0.087 0.3 0.095 0.817 0.027 0.152 0.004 0.459 0.146 0.154 0.242 0.317 0.043 0.284 0.357 0.138 0.048 0.69 0.124 0.22 0.655 0.122 0.003 0.541 0.015 0.004 0.44 0.126 0.137 0.463 0.274 0.203 0.406 0.108 0.283 0.234 0.294 0.033 0.439 0.043 0.155 0.289 0.513 0.039 0.293 0.237 0.43 MOTIF Lung_E16.5_H3K4me1_13_158_0.530_2.282189e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.56 0.203 0.204 0.033 0.63 0.199 0.159 0.012 0.498 0.205 0.242 0.055 0.299 0.226 0.253 0.222 0.201 0.178 0.396 0.226 0.121 0.558 0.134 0.187 0.281 0.008 0.009 0.702 0.013 0.196 0.696 0.095 0.06 0.599 0.192 0.149 0.136 0.227 0.03 0.607 0.012 0.226 0.159 0.603 0.124 0.245 0.068 0.563 MOTIF Intestine_E15.5_H3K4me1_3_161_0.545_9.215498e-120 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.468 0.099 0.302 0.131 0.761 0.061 0.174 0.004 0.778 0.13 0.088 0.004 0.674 0.005 0.205 0.116 0.113 0.001 0.593 0.293 0.115 0.241 0.547 0.097 0.241 0.718 0.036 0.005 0.626 0.003 0.003 0.368 0.147 0.097 0.701 0.055 0.124 0.543 0.049 0.284 0.098 0.197 0.011 0.694 0.092 0.136 0.269 0.503 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_6_161_0.551_2.24461e-228 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.748 0.115 0.109 0.028 0.809 0.139 0.051 0.001 0.654 0.004 0.177 0.165 0.204 0.007 0.611 0.178 0.046 0.752 0.2 0.002 0.632 0.001 0.001 0.366 0.001 0.037 0.953 0.009 0.025 0.776 0.121 0.078 0.247 0.398 0.011 0.345 0.181 0.085 0.135 0.599 0.001 0.183 0.108 0.708 0.044 0.221 0.054 0.681 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me1_6_158_0.551_7.763385e-250 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.935 0.011 0.023 0.031 0.964 0.027 0.001 0.008 0.879 0.042 0.034 0.045 0.017 0.001 0.932 0.05 0.001 0.954 0.03 0.015 0.914 0.006 0.007 0.073 0.029 0.039 0.887 0.045 0.001 0.953 0.045 0.001 0.05 0.887 0.016 0.047 0.04 0.064 0.011 0.885 0.001 0.026 0.068 0.905 0.001 0.026 0.001 0.972 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me1_1_169_0.563_3.18722e-153 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.078 0.001 0.89 0.031 0.05 0.905 0.044 0.001 0.837 0.019 0.001 0.143 0.044 0.001 0.937 0.018 0.028 0.893 0.057 0.022 0.001 0.936 0.012 0.051 0.001 0.149 0.001 0.849 0.046 0.079 0.078 0.797 MOTIF Stomach_P0_H3K4me1_3_181_0.550_7.915032e-86 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.712 0.155 0.132 0.001 0.796 0.001 0.202 0.001 0.114 0.135 0.591 0.16 0.134 0.14 0.586 0.14 0.001 0.818 0.18 0.001 0.099 0.158 0.001 0.742 0.008 0.001 0.819 0.172 0.148 0.615 0.152 0.085 0.097 0.171 0.12 0.612 0.001 0.127 0.151 0.721