MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K9ac_44_37_0.577_6.308131e-211
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031186	0.786648	0.157941	0.024225
0.096468	0.040851	0.862681	0.0
0.04664	0.022453	0.76961	0.161298
0.216721	0.686452	0.092411	0.004416
0.04842	0.878181	0.039833	0.033566
0.367244	0.010325	0.608649	0.013783
0.0	0.94258	0.02161	0.03581
0.933373	0.0	0.052011	0.014615
0.0	0.92169	0.072665	0.005645
0.140713	0.345176	0.447974	0.066138

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_39_43_0.601_4.523968e-287
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.014703	0.012972	0.9129	0.059425
0.03018	0.816043	0.052922	0.100855
0.029292	0.069449	0.891323	0.009937
0.137149	0.036637	0.734846	0.091368
0.084482	0.8794	0.022277	0.013842
0.074568	0.847014	0.050963	0.027455
0.256172	0.022804	0.663324	0.057699
0.0	0.787062	0.038772	0.174166
0.882732	0.0	0.073602	0.043666

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K27me3_10_3_0.558_4.40403e-42
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.238303	0.240097	0.36673	0.15487
0.071106	0.829024	0.046856	0.053015
0.06098	0.060869	0.78495	0.093201
0.069706	0.799361	0.068938	0.061995
0.069693	0.026494	0.840843	0.06297
0.037199	0.048103	0.829007	0.085692
0.070491	0.811374	0.053011	0.065124
0.106462	0.683694	0.042426	0.167418
0.076358	0.029468	0.835105	0.059069
0.047398	0.842672	0.073523	0.036406

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me2_14_2_0.650_1.759826e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.23206	0.150492	0.610648	0.0068
0.313226	0.361197	0.299674	0.025903
0.166926	0.486466	0.338772	0.007836
0.373001	0.068248	0.05667	0.502081
0.037883	0.932298	0.011509	0.01831
0.081809	0.088881	0.713544	0.115766
0.046821	0.865832	0.039621	0.047726
0.068192	0.030316	0.83749	0.064002
0.017086	0.021924	0.930872	0.030117
0.034491	0.91745	0.022183	0.025876
0.127862	0.646209	0.05245	0.173479
0.090711	0.057354	0.726436	0.125499
0.050311	0.702784	0.17377	0.073135

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me2_4_3_0.690_1.670487e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.154652	0.559344	0.220687	0.065317
0.142608	0.476325	0.231073	0.149994
0.247381	0.04808	0.503844	0.200694
0.192335	0.754087	0.033688	0.019891
0.07226	0.07633	0.722229	0.129181
0.055763	0.876243	0.027813	0.040181
0.064906	0.032467	0.83558	0.067047
0.016215	0.033821	0.921336	0.028628
0.030074	0.935087	0.018313	0.016527
0.155119	0.595741	0.089627	0.159513
0.089219	0.071855	0.739482	0.099445
0.066006	0.843999	0.019714	0.070281

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me2_4_2_0.671_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.229641	0.560318	0.157185	0.052857
0.291897	0.058881	0.361914	0.287307
0.02775	0.937785	0.014646	0.019819
0.065006	0.067011	0.7781	0.089883
0.073405	0.795785	0.04414	0.086671
0.055776	0.020709	0.860628	0.062886
0.05848	0.058666	0.783349	0.099505
0.081319	0.796712	0.046009	0.075961
0.095969	0.730436	0.049404	0.124191
0.092614	0.082555	0.676094	0.148736
0.047699	0.850925	0.044556	0.056821

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me2_16_5_0.645_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.14554	0.16741	0.519352	0.167698
0.021955	0.946773	0.014153	0.017118
0.090672	0.05155	0.695746	0.162033
0.075687	0.809905	0.058831	0.055577
0.231531	0.009385	0.610068	0.149016
0.011636	0.01042	0.940158	0.037786
0.036223	0.921313	0.010194	0.032271
0.051728	0.845773	0.034574	0.067925
0.10848	0.021887	0.696604	0.173029
0.060782	0.822706	0.097452	0.019059

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me2_4_4_0.649_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02834	0.950403	0.00398	0.017277
0.046437	0.0602	0.841025	0.052337
0.11926	0.616892	0.201121	0.062728
0.129778	0.027403	0.705776	0.137044
0.043128	0.066101	0.816161	0.07461
0.064193	0.808571	0.073318	0.053918
0.054256	0.85433	0.020398	0.071016
0.074698	0.049708	0.748533	0.127062
0.039397	0.840315	0.065989	0.054298

MOTIF	Lung_P0_H3K4me2_2_7_0.663_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.041405	0.917005	0.014524	0.027066
0.053009	0.059276	0.767935	0.11978
0.084806	0.780707	0.066141	0.068346
0.066139	0.0	0.863425	0.070437
0.054059	0.108693	0.808137	0.029111
0.121447	0.760393	0.046865	0.071295
0.105348	0.703736	0.045066	0.14585
0.088521	0.076641	0.71439	0.120448
0.035079	0.877681	0.035471	0.05177

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me2_13_8_0.636_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.120119	0.832384	0.015788	0.031709
0.065896	0.089774	0.696925	0.147406
0.134237	0.716228	0.067827	0.081709
0.076615	0.0	0.851278	0.072108
0.021846	0.00769	0.92998	0.040483
0.035674	0.929698	0.008155	0.026472
0.142794	0.653788	0.042612	0.160805
0.077618	0.046647	0.755101	0.120634
0.067165	0.8393	0.027242	0.066293

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me3_20_6_0.682_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031281	0.927981	0.014782	0.025956
0.0618	0.083176	0.760831	0.094193
0.127243	0.738332	0.067771	0.066653
0.056505	0.001628	0.881397	0.06047
0.049737	0.07278	0.849146	0.028337
0.149877	0.69911	0.064789	0.086225
0.121633	0.704153	0.041468	0.132746
0.065794	0.043796	0.795078	0.095332
0.062079	0.841666	0.044082	0.052173
0.868899	0.0	0.031166	0.099935
0.0	0.030786	0.969214	0.0

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me3_19_3_0.650_3.229637e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.02783	0.908315	0.039786	0.024069
0.0481	0.054228	0.790496	0.107176
0.12457	0.756613	0.056977	0.06184
0.076715	0.009929	0.837484	0.075871
0.054398	0.162837	0.756949	0.025817
0.153497	0.735749	0.043069	0.067685
0.041132	0.858843	0.044127	0.055898
0.090546	0.046385	0.745171	0.117898
0.047659	0.826073	0.071485	0.054782
0.768833	0.062684	0.090031	0.078452
0.0	0.015243	0.984757	0.0
0.071113	0.072751	0.152601	0.703535

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K9ac_5_4_0.644_3.901142e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034409	0.919157	0.02004	0.026394
0.050097	0.069004	0.782338	0.098561
0.072121	0.698041	0.169302	0.060536
0.08072	0.0062	0.846603	0.066477
0.051844	0.128507	0.792567	0.027082
0.102838	0.784956	0.045231	0.066975
0.088702	0.691606	0.093085	0.126607
0.069722	0.058576	0.744977	0.126725
0.033017	0.893	0.028955	0.045028
0.286301	0.674357	0.0	0.039342

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K9ac_13_0_0.597_7.042428e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.186099	0.175661	0.30708	0.331159
0.0366	0.906177	0.032426	0.024797
0.06367	0.07029	0.7825	0.083541
0.049137	0.811816	0.055861	0.083185
0.050163	0.025501	0.861933	0.062402
0.037823	0.130157	0.80973	0.02229
0.104947	0.779636	0.054794	0.060624
0.08053	0.682555	0.145943	0.090973
0.066992	0.058601	0.749638	0.12477
0.032372	0.884823	0.047163	0.035642
0.837134	0.0652	0.0	0.097666
0.0	0.037408	0.962592	0.0