MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_10_4_0.639_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04678	0.915791	0.0	0.037429
0.063617	0.849529	0.006292	0.080562
0.061339	0.044547	0.724413	0.169701
0.137349	0.687677	0.063131	0.111843
0.021572	0.054063	0.834897	0.089468
0.133933	0.739943	0.044275	0.08185
0.078209	0.012555	0.800205	0.109032
0.026085	0.812263	0.07109	0.090562
0.001451	0.06129	0.890855	0.046403
0.017839	0.075377	0.041099	0.865684
0.010596	0.206072	0.065213	0.718119
0.015943	0.09204	0.0	0.892017

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K9ac_5_1_0.651_6.904324e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012782	0.647288	0.231536	0.108393
0.296193	0.032265	0.051597	0.619946
0.022629	0.954611	0.005566	0.017194
0.103601	0.702837	0.049028	0.144534
0.083281	0.080922	0.734821	0.100975
0.115387	0.758286	0.059719	0.066607
0.020489	0.062757	0.857109	0.059644
0.102325	0.748304	0.069295	0.080076
0.041592	0.057845	0.780532	0.120031
0.072122	0.757745	0.080365	0.089768
0.050086	0.0	0.884655	0.06526

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K9ac_5_17_0.712_1.15927e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.184279	0.72468	0.057652	0.033389
0.106823	0.026855	0.761419	0.104904
0.130284	0.776059	0.044618	0.049039
0.090662	0.165357	0.697771	0.04621
0.01346	0.910917	0.050781	0.024842
0.125003	0.064697	0.720367	0.089933
0.004068	0.040927	0.947812	0.007193
0.77926	0.015957	0.059529	0.145254
0.110119	0.029935	0.854173	0.005772

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K9ac_3_11_0.634_5.977531e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.040101	0.919941	0.0	0.039958
0.079034	0.827224	0.0	0.093742
0.069297	0.01314	0.812535	0.105029
0.10933	0.717507	0.02494	0.148223
0.023698	0.060485	0.833638	0.082179
0.130363	0.715632	0.086831	0.067175
0.083288	0.006002	0.810976	0.099733
0.027385	0.918018	0.006246	0.048351
0.109649	0.016861	0.667146	0.206344

MOTIF	Liver_E13.5_H3K9ac_1_3_0.623_1.26837e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.289073	0.597287	0.0	0.11364
0.041168	0.931377	0.0	0.027455
0.121855	0.705191	0.0785	0.094454
0.050887	0.048086	0.813919	0.087109
0.129029	0.765272	0.043437	0.062262
0.078486	0.046963	0.819028	0.055523
0.090567	0.746313	0.091782	0.071339
0.05453	0.05211	0.832652	0.060708
0.071084	0.817991	0.045561	0.065363
0.097119	0.0	0.785611	0.11727

MOTIF	Lung_E15.5_H3K9ac_1_5_0.739_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.123532	0.721901	0.089796	0.064772
0.04669	0.747106	0.033398	0.172806
0.075928	0.025057	0.873244	0.025771
0.113072	0.849221	0.017497	0.02021
0.019229	0.03032	0.917388	0.033063
0.151231	0.733434	0.038585	0.076751
0.040515	0.009124	0.833571	0.11679
0.027466	0.835101	0.061522	0.075911
0.149673	0.098048	0.681335	0.070945

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K9ac_1_4_0.676_3.690404e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.060273	0.783753	0.08986	0.066114
0.120807	0.73413	0.034106	0.110956
0.058031	0.04479	0.800814	0.096365
0.088501	0.799195	0.064403	0.047901
0.020518	0.052953	0.858853	0.067677
0.077396	0.810084	0.06468	0.04784
0.088841	0.055787	0.7889	0.066472
0.057244	0.823063	0.04814	0.071554
0.062613	0.036867	0.769137	0.131384

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K9ac_1_3_0.659_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.093633	0.717112	0.125906	0.063349
0.104261	0.750474	0.032141	0.113124
0.058572	0.053011	0.867178	0.021239
0.178695	0.739628	0.02433	0.057348
0.015022	0.024295	0.900858	0.059825
0.108859	0.793191	0.040677	0.057273
0.094574	0.039699	0.821159	0.044568
0.029901	0.824553	0.081515	0.064031
0.034538	0.065699	0.777616	0.122146

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K9ac_1_7_0.703_5.692936e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.066229	0.864362	0.018457	0.050952
0.090657	0.733455	0.023667	0.152221
0.048989	0.017025	0.795622	0.138363
0.044424	0.902239	0.023715	0.029622
0.02574	0.063593	0.780792	0.129875
0.112077	0.731871	0.041011	0.115041
0.077544	0.055581	0.790461	0.076414
0.026255	0.837267	0.071112	0.065367
0.035115	0.067986	0.766417	0.130482

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K9ac_1_9_0.740_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034156	0.865759	0.0	0.100085
0.258987	0.531426	0.030583	0.179004
0.013664	0.090598	0.803003	0.092736
0.161488	0.725954	0.025904	0.086653
0.018345	0.056555	0.89003	0.03507
0.114848	0.835566	0.01934	0.030245
0.086025	0.071269	0.810202	0.032504
0.04077	0.886238	0.033847	0.039145
0.058219	0.029519	0.843696	0.068566

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K9ac_5_9_0.712_5.508958e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.03203	0.896636	0.0	0.071334
0.154017	0.690856	0.021553	0.133574
0.094237	0.078383	0.726241	0.101139
0.172329	0.665989	0.038284	0.123398
0.01049	0.071301	0.879164	0.039045
0.113925	0.775993	0.026612	0.08347
0.079502	0.077154	0.816607	0.026737
0.035892	0.886796	0.022699	0.054613
0.041769	0.0	0.889983	0.068248
0.0	0.0	0.068231	0.931769

MOTIF	Liver_P0_H3K9ac_3_7_0.628_9.255826e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.008648	0.963002	0.0	0.02835
0.045717	0.874718	0.01735	0.062215
0.058465	0.050085	0.742427	0.149024
0.113173	0.557618	0.21807	0.111139
0.033157	0.028712	0.913077	0.025055
0.127252	0.807149	0.028452	0.037147
0.064132	0.040735	0.77935	0.115783
0.03745	0.766699	0.074757	0.121094
0.043973	0.026036	0.874264	0.055727
0.278482	0.339596	0.0	0.381921

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K9ac_4_8_0.671_1.103244e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.043426	0.92512	0.023964	0.007489
0.048785	0.895134	0.015972	0.040109
0.129548	0.047744	0.681802	0.140906
0.217309	0.644525	0.050244	0.087922
0.022613	0.005657	0.942771	0.028958
0.133405	0.750496	0.029166	0.086932
0.097633	0.047494	0.78658	0.068293
0.02821	0.696452	0.242579	0.032758
0.052756	0.0	0.898815	0.048429

MOTIF	Stomach_P0_H3K9ac_1_5_0.641_1.402986e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.467699	0.26898	0.093419	0.169902
0.030032	0.924316	0.02071	0.024942
0.056544	0.87685	0.008048	0.058559
0.115612	0.04445	0.687574	0.152364
0.179653	0.657607	0.065124	0.097617
0.024182	0.074024	0.879364	0.022429
0.026265	0.930588	0.014871	0.028276
0.078397	0.032281	0.73251	0.156812
0.094603	0.736412	0.083425	0.08556
0.089427	0.017704	0.841239	0.05163