MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me2_100_96_0.514_2.43388e-13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046439	0.649596	0.191978	0.111987
0.072099	0.085112	0.693673	0.149115
0.048069	0.060773	0.669372	0.221786
0.004516	0.938822	0.03669	0.019973
0.043471	0.018794	0.0	0.937735
0.0	0.817044	0.174236	0.00872
0.085646	0.0	0.03206	0.882294
0.010255	0.032011	0.924706	0.033028
0.073843	0.804655	0.068603	0.052899

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me2_84_81_0.515_1.24356e-60
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069746	0.722941	0.063328	0.143985
0.020559	0.050311	0.746542	0.182588
0.0	0.98025	0.018478	0.001272
0.765726	0.031871	0.02831	0.174092
0.0	0.060477	0.939523	0.0
0.751161	0.034095	0.092312	0.122432
0.009918	0.063148	0.910739	0.016196
0.187485	0.644335	0.064582	0.103598
0.041314	0.810202	0.05956	0.088924

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me3_83_78_0.530_3.403645e-39
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034244	0.872659	0.067607	0.02549
0.227381	0.039561	0.678433	0.054626
0.08726	0.067766	0.591036	0.253938
0.014503	0.883763	0.027013	0.074721
0.032006	0.032032	0.06425	0.871712
0.000453	0.968339	0.029847	0.001361
0.041852	0.040174	0.046154	0.87182
0.005174	0.038213	0.918094	0.038518
0.167843	0.587553	0.070357	0.174248
0.122537	0.450549	0.227907	0.199007

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_79_60_0.544_4.451475e-122
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025755	0.079527	0.863133	0.031585
0.113088	0.673641	0.059344	0.153927
0.110168	0.097477	0.698844	0.09351
0.006494	0.95535	0.038156	0.0
0.830868	0.023773	0.042761	0.102598
0.005401	0.025955	0.968644	0.0
0.734167	0.099143	0.046273	0.120417
0.012564	0.026587	0.952921	0.007927
0.220031	0.6818	0.029433	0.068735
0.209745	0.457479	0.223695	0.109081

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_80_94_0.535_2.086571e-57
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044032	0.877013	0.063387	0.015568
0.007569	0.058451	0.721992	0.211987
0.003974	0.93027	0.065152	0.000604
0.797195	0.074469	0.010171	0.118165
0.0	0.032289	0.967711	0.0
0.795303	0.037268	0.062536	0.104894
0.055846	0.046041	0.881435	0.016678
0.26698	0.535752	0.041801	0.155466
0.168276	0.752936	0.044718	0.034069

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me3_66_74_0.601_2.297981e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.205808	0.055843	0.548231	0.190118
0.040226	0.910176	0.03025	0.019348
0.098966	0.051625	0.777683	0.071726
0.0	0.929073	0.070927	0.0
0.729561	0.051898	0.065162	0.15338
0.005682	0.030219	0.964099	0.0
0.793983	0.061805	0.05875	0.085462
0.107809	0.044493	0.745787	0.101911
0.038666	0.761293	0.09389	0.106151

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me3_70_82_0.552_3.033897e-154
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.141299	0.204108	0.54203	0.112562
0.17354	0.639931	0.058153	0.128376
0.087608	0.076508	0.778929	0.056955
0.005734	0.909437	0.084341	0.000487
0.875389	0.030214	0.030449	0.063949
0.004028	0.044635	0.951337	0.0
0.799353	0.113787	0.034475	0.052385
0.103736	0.026293	0.852013	0.017958
0.021553	0.853694	0.016667	0.108086

MOTIF	Heart_E11.5_H3K27ac_50_163_0.524_3.656825e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.761	0.091	0.075	0.073
0.764	0.072	0.1	0.064
0.711	0.103	0.098	0.088
0.093	0.108	0.089	0.71
0.068	0.783	0.092	0.057
0.818	0.042	0.052	0.088
0.091	0.069	0.8	0.04
0.812	0.054	0.067	0.067
0.083	0.073	0.776	0.068
0.083	0.771	0.083	0.063
0.148	0.645	0.079	0.128
0.111	0.109	0.65	0.13

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K27ac_18_177_0.544_1.265539e-94
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K27ac_48_173_0.530_2.331577e-46
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.103	0.759	0.137	0.001
0.133	0.07	0.627	0.17
0.001	0.001	0.997	0.001
0.023	0.926	0.05	0.001
0.001	0.049	0.028	0.922
0.001	0.951	0.03	0.018
0.038	0.001	0.074	0.887
0.012	0.001	0.957	0.03

MOTIF	Forebrain_E12.5_H3K4me2_109_95_0.504_1.412644e-09
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012409	0.962792	0.018796	0.006003
0.926259	0.030073	0.0	0.043669
0.007578	0.039513	0.952909	0.0
0.95671	0.037455	0.0	0.005834
0.009148	0.0	0.988564	0.002288
0.036079	0.828081	0.05868	0.07716
0.391375	0.464744	0.098279	0.045601
0.040493	0.091363	0.851126	0.017018
0.11943	0.090641	0.524235	0.265693
0.332889	0.118811	0.429333	0.118966

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me2_80_81_0.525_2.340549e-63
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013516	0.927575	0.049581	0.009328
0.945242	0.007151	0.027085	0.020522
0.005519	0.060457	0.934024	0.0
0.914955	0.030404	0.032402	0.022239
0.164445	0.107399	0.706402	0.021754
0.183478	0.762608	0.053914	0.0
0.257779	0.694658	0.023663	0.0239
0.020808	0.292599	0.661298	0.025295
0.090144	0.08622	0.785586	0.03805

MOTIF	Limb_E15.5_H3K9ac_74_80_0.517_4.692702e-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.003172	0.888635	0.065653	0.042539
0.848111	0.024661	0.05774	0.069487
0.017987	0.039243	0.940701	0.002068
0.917432	0.041063	0.026763	0.014742
0.104369	0.03903	0.847043	0.009558
0.095	0.771665	0.05543	0.077906
0.12441	0.697158	0.119718	0.058714
0.153418	0.148564	0.658639	0.039379
0.144602	0.092926	0.728013	0.034459

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_77_84_0.533_2.734285e-45
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.113352	0.855464	0.0	0.031184
0.030853	0.026097	0.869058	0.073992
0.010756	0.027198	0.945817	0.016228
0.0	0.786201	0.155846	0.057953
0.005226	0.0	0.0	0.994774
0.0	0.907703	0.053475	0.038822
0.201644	0.054465	0.019426	0.724465
0.0	0.038162	0.949061	0.012777
0.248355	0.367006	0.020947	0.363692
0.0	0.178226	0.448693	0.373082