MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Heart_P0_H3K9me3_7_155_0.539_1.429394e-52 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.559 0.106 0.234 0.101 0.796 0.012 0.19 0.002 0.701 0.001 0.258 0.04 0.142 0.417 0.12 0.321 0.747 0.031 0.003 0.219 0.158 0.101 0.616 0.125 0.109 0.267 0.15 0.474 0.284 0.034 0.26 0.423 0.051 0.698 0.143 0.108 0.006 0.713 0.001 0.28 0.823 0.001 0.026 0.15 0.086 0.566 0.156 0.192 MOTIF Liver_E16.5_H3K9me3_24_156_0.543_1.708844e-14 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.163 0.103 0.555 0.179 0.054 0.006 0.052 0.888 0.233 0.001 0.749 0.017 0.229 0.001 0.74 0.03 0.435 0.242 0.001 0.322 0.482 0.087 0.301 0.13 0.085 0.627 0.049 0.239 0.048 0.006 0.012 0.934 0.255 0.026 0.535 0.184 0.163 0.109 0.149 0.579 0.056 0.102 0.221 0.621 0.229 0.054 0.124 0.593 MOTIF Lung_E16.5_H3K9me3_16_154_0.551_1.713585e-62 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.315 0.12 0.512 0.053 0.203 0.003 0.072 0.722 0.251 0.001 0.673 0.075 0.198 0.024 0.696 0.082 0.431 0.316 0.006 0.247 0.458 0.185 0.258 0.099 0.01 0.633 0.157 0.2 0.01 0.141 0.046 0.803 0.363 0.154 0.4 0.084 0.049 0.251 0.149 0.551 0.151 0.006 0.194 0.649 0.119 0.231 0.144 0.506 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K9me3_5_155_0.546_6.434395e-83 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.217 0.127 0.472 0.184 0.099 0.006 0.158 0.737 0.247 0.011 0.576 0.166 0.213 0.066 0.631 0.09 0.396 0.222 0.156 0.226 0.461 0.208 0.272 0.059 0.102 0.565 0.114 0.219 0.212 0.049 0.019 0.72 0.256 0.144 0.515 0.085 0.146 0.21 0.088 0.556 0.12 0.128 0.126 0.626 0.149 0.121 0.183 0.547 MOTIF Stomach_E14.5_H3K9me3_10_158_0.537_8.471207e-22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.639 0.107 0.179 0.075 0.744 0.084 0.087 0.085 0.66 0.133 0.135 0.072 0.093 0.58 0.111 0.216 0.68 0.048 0.078 0.194 0.109 0.124 0.666 0.101 0.125 0.259 0.185 0.431 0.146 0.105 0.311 0.438 0.107 0.739 0.086 0.068 0.128 0.735 0.002 0.135 0.821 0.041 0.045 0.093 0.098 0.697 0.07 0.135 MOTIF Heart_E15.5_H3K9me3_14_169_0.533_7.939905e-17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.001 0.001 0.997 0.057 0.001 0.906 0.036 0.067 0.184 0.547 0.202 0.189 0.746 0.042 0.023 0.543 0.262 0.001 0.194 0.02 0.463 0.012 0.505 0.001 0.001 0.001 0.997 0.197 0.001 0.678 0.124 0.009 0.001 0.169 0.821 0.001 0.001 0.059 0.939 MOTIF Intestine_E14.5_H3K9me3_5_154_0.548_1.254092e-56 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.085 0.118 0.743 0.054 0.033 0.015 0.021 0.931 0.15 0.001 0.621 0.228 0.158 0.324 0.481 0.037 0.396 0.422 0.01 0.171 0.651 0.078 0.201 0.07 0.001 0.951 0.044 0.004 0.142 0.002 0.002 0.854 0.372 0.081 0.52 0.027 0.055 0.153 0.021 0.771 0.022 0.033 0.016 0.929 0.018 0.169 0.277 0.536 MOTIF Heart_E13.5_H3K9me3_6_156_0.552_1.516748e-214 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.595 0.145 0.087 0.173 0.94 0.029 0.021 0.01 0.941 0.014 0.034 0.011 0.026 0.348 0.028 0.598 0.894 0.008 0.075 0.023 0.047 0.01 0.915 0.028 0.022 0.079 0.025 0.874 0.038 0.017 0.68 0.265 0.026 0.759 0.165 0.05 0.017 0.949 0.001 0.033 0.954 0.012 0.009 0.025 0.026 0.9 0.026 0.048 MOTIF Kidney_E14.5_H3K9me3_6_154_0.544_1.451628e-64 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.605 0.326 0.068 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.88 0.001 0.115 0.004 0.006 0.532 0.067 0.395 0.996 0.001 0.001 0.002 0.042 0.001 0.956 0.001 0.001 0.2 0.113 0.686 0.182 0.001 0.402 0.416 0.001 0.773 0.225 0.001 0.001 0.889 0.001 0.109 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.832 0.001 0.166 MOTIF Heart_E16.5_H3K9me3_9_154_0.553_1.698516e-231 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.487 0.469 0.009 0.036 0.966 0.003 0.03 0.001 0.754 0.168 0.077 0.001 0.016 0.627 0.009 0.348 0.997 0.001 0.001 0.001 0.472 0.016 0.51 0.002 0.012 0.077 0.28 0.631 0.032 0.008 0.756 0.204 0.001 0.8 0.176 0.023 0.001 0.966 0.001 0.032 0.99 0.001 0.001 0.008 0.041 0.908 0.015 0.036 MOTIF Limb_E12.5_H3K9me3_5_152_0.554_6.066212e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.41 0.571 0.001 0.018 0.997 0.001 0.001 0.001 0.949 0.001 0.049 0.001 0.001 0.754 0.02 0.225 0.997 0.001 0.001 0.001 0.42 0.001 0.578 0.001 0.001 0.098 0.473 0.428 0.007 0.001 0.735 0.257 0.001 0.809 0.184 0.006 0.001 0.895 0.001 0.103 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.949 0.001 0.049 MOTIF Heart_E11.5_H3K9me3_3_155_0.544_7.189711e-93 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.43 0.32 0.009 0.241 0.988 0.001 0.01 0.001 0.913 0.001 0.085 0.001 0.031 0.542 0.025 0.402 0.995 0.001 0.001 0.003 0.255 0.046 0.698 0.001 0.084 0.12 0.184 0.612 0.165 0.014 0.572 0.249 0.001 0.719 0.258 0.022 0.001 0.89 0.001 0.108 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.816 0.043 0.14 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K9me3_1_152_0.559_2.469609e-216 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.273 0.035 0.638 0.054 0.001 0.001 0.001 0.997 0.104 0.001 0.894 0.001 0.087 0.245 0.667 0.001 0.165 0.657 0.069 0.109 0.494 0.408 0.088 0.01 0.001 0.676 0.001 0.322 0.046 0.001 0.001 0.952 0.414 0.058 0.527 0.001 0.001 0.17 0.001 0.828 0.043 0.001 0.015 0.941 0.216 0.007 0.536 0.241 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K9me3_1_153_0.556_4.476742e-151 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.227 0.003 0.769 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.144 0.001 0.854 0.001 0.019 0.263 0.717 0.001 0.216 0.617 0.036 0.131 0.649 0.24 0.064 0.047 0.001 0.599 0.002 0.398 0.233 0.001 0.001 0.765 0.416 0.07 0.513 0.001 0.136 0.166 0.001 0.697 0.001 0.003 0.006 0.99 0.117 0.027 0.545 0.311 MOTIF Stomach_E16.5_H3K9me3_6_156_0.554_1.267081e-110 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.344 0.423 0.122 0.111 0.994 0.001 0.004 0.001 0.804 0.044 0.151 0.001 0.001 0.534 0.061 0.404 0.755 0.001 0.131 0.113 0.391 0.023 0.585 0.001 0.049 0.089 0.338 0.524 0.177 0.001 0.521 0.301 0.031 0.679 0.21 0.08 0.04 0.773 0.001 0.186 0.997 0.001 0.001 0.001 0.034 0.793 0.013 0.16