MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_8_156_0.664_1.288696e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.196 0.258 0.357 0.189 0.129 0.601 0.153 0.117 0.115 0.134 0.641 0.11 0.093 0.683 0.154 0.07 0.551 0.197 0.132 0.12 0.123 0.121 0.205 0.551 0.059 0.15 0.701 0.09 0.106 0.669 0.13 0.095 0.113 0.144 0.625 0.118 0.116 0.623 0.157 0.104 0.119 0.138 0.616 0.127 0.175 0.251 0.381 0.192 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_12_157_0.682_4.370323e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.206 0.598 0.065 0.131 0.072 0.136 0.697 0.095 0.209 0.649 0.09 0.052 0.401 0.219 0.131 0.249 0.228 0.142 0.193 0.437 0.033 0.001 0.864 0.102 0.069 0.848 0.005 0.078 0.024 0.085 0.841 0.05 0.108 0.445 0.098 0.349 0.521 0.079 0.188 0.212 MOTIF Stomach_E14.5_H3K4me2_5_153_0.697_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.222 0.379 0.227 0.173 0.104 0.14 0.671 0.085 0.084 0.525 0.085 0.306 0.198 0.199 0.13 0.472 0.417 0.176 0.146 0.261 0.276 0.059 0.599 0.066 0.043 0.827 0.022 0.108 0.026 0.103 0.783 0.088 0.097 0.694 0.138 0.071 0.262 0.172 0.358 0.208 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me2_8_155_0.658_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.088 0.79 0.067 0.055 0.102 0.062 0.784 0.052 0.033 0.85 0.067 0.05 0.076 0.067 0.05 0.807 0.751 0.071 0.064 0.114 0.035 0.058 0.852 0.055 0.087 0.783 0.045 0.085 0.046 0.079 0.8 0.075 0.072 0.802 0.092 0.034 0.087 0.075 0.783 0.055 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me2_6_152_0.703_8.678186e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.041 0.848 0.059 0.052 0.063 0.047 0.837 0.053 0.067 0.855 0.035 0.043 0.06 0.09 0.121 0.729 0.741 0.095 0.069 0.095 0.042 0.047 0.86 0.051 0.076 0.779 0.09 0.055 0.064 0.087 0.773 0.076 0.068 0.781 0.075 0.076 0.073 0.059 0.798 0.07 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me2_5_153_0.670_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.074 0.733 0.093 0.1 0.107 0.084 0.724 0.085 0.093 0.727 0.108 0.072 0.098 0.131 0.105 0.666 0.695 0.09 0.116 0.099 0.093 0.106 0.718 0.083 0.105 0.714 0.095 0.086 0.084 0.092 0.717 0.107 0.107 0.668 0.119 0.106 0.11 0.12 0.637 0.133 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me3_5_152_0.755_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me3_5_157_0.702_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Heart_E15.5_H3K4me3_3_153_0.714_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me3_7_151_0.752_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me3_3_152_0.740_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me3_36_156_0.659_8.605748e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.041 0.845 0.056 0.058 0.098 0.151 0.657 0.094 0.06 0.883 0.056 0.001 0.066 0.001 0.861 0.072 0.042 0.927 0.018 0.013 0.001 0.001 0.057 0.941 0.913 0.001 0.085 0.001 0.001 0.001 0.992 0.006 MOTIF Liver_P0_H3K4me3_34_159_0.643_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.015 0.942 0.03 0.013 0.019 0.001 0.001 0.979 0.879 0.051 0.038 0.032 0.012 0.049 0.922 0.017 0.071 0.846 0.05 0.033 0.027 0.052 0.903 0.018 0.093 0.761 0.109 0.037 0.037 0.08 0.798 0.085 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me3_36_161_0.643_1.984943e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.082 0.815 0.04 0.063 0.088 0.092 0.72 0.1 0.023 0.902 0.074 0.001 0.023 0.058 0.797 0.122 0.027 0.957 0.001 0.015 0.001 0.071 0.001 0.927 0.997 0.001 0.001 0.001 0.035 0.029 0.905 0.031 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_58_165_0.609_1.346642e-293 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.093 0.838 0.034 0.035 0.05 0.127 0.642 0.181 0.034 0.883 0.058 0.025 0.027 0.05 0.812 0.111 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.978 0.001 0.001 0.02 0.036 0.059 0.863 0.042