MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K27ac_30_161_0.539_9.732498e-94
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.108	0.106	0.683	0.103
0.15	0.543	0.143	0.164
0.15	0.153	0.538	0.159
0.118	0.051	0.106	0.725
0.108	0.11	0.671	0.111
0.673	0.109	0.092	0.126
0.123	0.086	0.102	0.689
0.115	0.087	0.117	0.681
0.678	0.098	0.11	0.114
0.719	0.088	0.1	0.093
0.702	0.099	0.101	0.098
0.698	0.086	0.107	0.109

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K27ac_1_156_0.581_1.683248e-180
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.014	0.099	0.844	0.043
0.003	0.933	0.022	0.042
0.026	0.045	0.901	0.028
0.114	0.172	0.222	0.492
0.24	0.142	0.471	0.147
0.609	0.103	0.069	0.219
0.16	0.095	0.047	0.698
0.241	0.001	0.01	0.748
0.624	0.111	0.105	0.16
0.68	0.101	0.087	0.132

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K27ac_5_153_0.571_1.743058e-158
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.095	0.887	0.017
0.087	0.815	0.036	0.062
0.157	0.174	0.457	0.212
0.099	0.087	0.158	0.656
0.174	0.205	0.474	0.147
0.719	0.087	0.031	0.163
0.214	0.001	0.002	0.783
0.143	0.001	0.006	0.85
0.706	0.036	0.029	0.229
0.695	0.073	0.132	0.1

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K27ac_2_152_0.579_7.983448e-221
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.101	0.725	0.102	0.072
0.016	0.048	0.891	0.045
0.088	0.696	0.127	0.089
0.06	0.171	0.669	0.1
0.118	0.116	0.145	0.621
0.191	0.179	0.451	0.18
0.67	0.113	0.063	0.154
0.079	0.072	0.015	0.834
0.102	0.018	0.022	0.858
0.645	0.112	0.121	0.122

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K27ac_14_164_0.568_1.979705e-164
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.845	0.055	0.03	0.07
0.825	0.013	0.074	0.088
0.13	0.058	0.129	0.683
0.078	0.679	0.143	0.1
0.661	0.218	0.034	0.087
0.064	0.71	0.117	0.109
0.061	0.037	0.85	0.052
0.06	0.748	0.138	0.054

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K27ac_7_154_0.561_7.538286e-158
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.003	0.017	0.944	0.036
0.112	0.847	0.018	0.023
0.633	0.111	0.078	0.178
0.114	0.143	0.126	0.617
0.646	0.093	0.111	0.15
0.755	0.013	0.042	0.19
0.182	0.006	0.001	0.811
0.079	0.047	0.127	0.747

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K27ac_2_153_0.577_8.884823e-182
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.023	0.975	0.001
0.179	0.653	0.063	0.105
0.301	0.075	0.316	0.308
0.111	0.094	0.377	0.419
0.571	0.132	0.154	0.143
0.795	0.001	0.001	0.203
0.16	0.001	0.001	0.838
0.119	0.007	0.107	0.767
0.35	0.27	0.092	0.287
0.6	0.219	0.012	0.169

MOTIF	Forebrain_P0_H3K27ac_6_153_0.570_1.189596e-131
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.005	0.012	0.905	0.078
0.025	0.678	0.141	0.156
0.215	0.239	0.406	0.14
0.259	0.023	0.257	0.46
0.744	0.069	0.153	0.034
0.883	0.001	0.001	0.115
0.071	0.001	0.001	0.927
0.005	0.001	0.058	0.936
0.663	0.064	0.053	0.22
0.476	0.169	0.238	0.117

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K27ac_5_151_0.568_4.955894e-175
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012	0.107	0.76	0.121
0.115	0.519	0.202	0.164
0.203	0.177	0.418	0.203
0.103	0.099	0.088	0.71
0.698	0.103	0.12	0.079
0.997	0.001	0.001	0.001
0.082	0.001	0.001	0.916
0.071	0.05	0.111	0.768
0.649	0.068	0.102	0.181
0.526	0.168	0.172	0.134

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K27ac_23_151_0.561_8.607769e-116
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.105	0.076	0.602	0.217
0.073	0.463	0.225	0.239
0.111	0.339	0.299	0.251
0.165	0.035	0.199	0.601
0.614	0.171	0.166	0.049
0.979	0.005	0.004	0.012
0.04	0.004	0.008	0.948
0.006	0.011	0.077	0.906
0.803	0.038	0.008	0.151
0.475	0.191	0.294	0.04

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K27ac_3_154_0.580_1.316992e-122
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.106	0.693	0.115	0.086
0.104	0.112	0.681	0.103
0.099	0.117	0.704	0.08
0.094	0.692	0.105	0.109
0.112	0.1	0.68	0.108
0.104	0.101	0.103	0.692
0.689	0.097	0.109	0.105
0.72	0.093	0.072	0.115
0.109	0.074	0.089	0.728
0.054	0.112	0.113	0.721

MOTIF	Limb_E11.5_H3K27ac_17_156_0.550_6.757808e-45
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.106	0.097	0.099	0.698
0.758	0.092	0.064	0.086
0.749	0.07	0.064	0.117
0.091	0.082	0.077	0.75
0.092	0.09	0.088	0.73
0.673	0.128	0.106	0.093
0.135	0.657	0.117	0.091
0.125	0.112	0.631	0.132
0.084	0.679	0.125	0.112
0.123	0.674	0.092	0.111

MOTIF	Limb_E12.5_H3K27ac_13_153_0.542_1.235848e-77
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.104	0.113	0.653	0.13
0.114	0.138	0.66	0.088
0.126	0.654	0.113	0.107
0.082	0.108	0.685	0.125
0.1	0.101	0.129	0.67
0.734	0.088	0.086	0.092
0.744	0.062	0.084	0.11
0.108	0.074	0.061	0.757
0.095	0.09	0.065	0.75
0.695	0.096	0.092	0.117

MOTIF	Midbrain_P0_H3K27ac_19_158_0.559_2.532931e-97
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.19	0.141	0.116	0.553
0.706	0.122	0.123	0.049
0.823	0.008	0.014	0.155
0.221	0.006	0.064	0.709
0.146	0.18	0.135	0.539
0.505	0.189	0.138	0.168
0.155	0.527	0.162	0.156
0.138	0.163	0.545	0.154
0.058	0.62	0.172	0.15
0.164	0.48	0.168	0.187

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me1_12_157_0.542_3.027871e-63
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.08	0.538	0.261	0.121
0.229	0.001	0.001	0.769
0.014	0.001	0.984	0.001
0.001	0.866	0.118	0.015
0.259	0.255	0.314	0.173
0.142	0.173	0.484	0.202
0.649	0.001	0.218	0.132
0.614	0.001	0.053	0.332
0.287	0.001	0.001	0.711
0.157	0.016	0.008	0.819