MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9ac_43_161_0.564_2.421196e-141 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Limb_E14.5_H3K9ac_56_171_0.567_5.593644e-88 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.303 0.234 0.255 0.208 0.25 0.25 0.275 0.225 0.372 0.103 0.005 0.52 0.346 0.08 0.054 0.52 0.103 0.103 0.032 0.762 0.153 0.493 0.201 0.153 0.301 0.395 0.297 0.007 0.153 0.104 0.688 0.055 0.152 0.055 0.054 0.739 0.2 0.152 0.103 0.545 0.054 0.275 0.201 0.47 0.059 0.551 0.157 0.233 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K9ac_57_165_0.566_2.071142e-103 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Liver_E16.5_H3K9ac_45_163_0.562_4.993227e-65 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_21_158_0.704_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.079 0.802 0.027 0.092 0.08 0.045 0.755 0.12 0.088 0.079 0.075 0.758 0.057 0.023 0.062 0.858 0.073 0.146 0.089 0.692 0.058 0.794 0.057 0.091 0.077 0.094 0.72 0.109 0.073 0.081 0.764 0.082 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me3_35_155_0.641_1.360512e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.118 0.727 0.071 0.084 0.156 0.072 0.614 0.158 0.108 0.249 0.257 0.386 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.317 0.191 0.491 0.001 0.771 0.001 0.227 0.205 0.206 0.584 0.005 0.123 0.223 0.35 0.304 0.023 0.001 0.001 0.975 0.176 0.043 0.121 0.66 MOTIF Kidney_E14.5_H3K9ac_44_162_0.597_4.096325e-225 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Hindbrain_P0_H3K9ac_19_159_0.626_1.151265e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.131 0.596 0.14 0.133 0.126 0.108 0.634 0.132 0.589 0.139 0.148 0.124 0.627 0.112 0.136 0.125 0.561 0.14 0.15 0.149 0.13 0.603 0.131 0.136 0.138 0.111 0.617 0.134 0.565 0.152 0.142 0.141 0.149 0.134 0.123 0.594 0.132 0.132 0.122 0.614 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K9ac_20_153_0.637_3.171425e-299 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.132 0.598 0.133 0.137 0.142 0.11 0.621 0.127 0.586 0.145 0.149 0.12 0.642 0.116 0.128 0.114 0.562 0.146 0.15 0.142 0.137 0.601 0.131 0.131 0.137 0.118 0.628 0.117 0.553 0.148 0.147 0.152 0.146 0.135 0.12 0.599 0.129 0.133 0.128 0.61 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K9ac_18_155_0.675_4.599025e-318 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.643 0.106 0.096 0.155 0.087 0.74 0.076 0.097 0.08 0.07 0.731 0.119 0.059 0.075 0.062 0.804 0.05 0.101 0.049 0.8 0.078 0.075 0.067 0.78 0.084 0.714 0.064 0.138 0.07 0.041 0.788 0.101 MOTIF Limb_E15.5_H3K9ac_27_156_0.621_3.421276e-199 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.712 0.094 0.086 0.108 0.675 0.107 0.121 0.097 0.111 0.711 0.085 0.093 0.097 0.092 0.711 0.1 0.116 0.103 0.107 0.674 0.077 0.095 0.091 0.737 0.091 0.101 0.109 0.699 0.107 0.689 0.093 0.111 0.093 0.103 0.7 0.104 0.103 0.09 0.115 0.692 MOTIF Limb_E13.5_H3K9ac_29_159_0.585_2.842201e-230 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.713 0.087 0.095 0.105 0.746 0.084 0.097 0.073 0.704 0.096 0.093 0.107 0.124 0.698 0.079 0.099 0.098 0.116 0.657 0.129 0.116 0.093 0.097 0.694 0.076 0.093 0.086 0.745 0.104 0.112 0.101 0.683 0.107 0.685 0.092 0.116 0.122 0.094 0.673 0.111 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K9ac_26_157_0.614_3.622439e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.145 0.578 0.14 0.137 0.146 0.102 0.612 0.14 0.585 0.137 0.149 0.129 0.653 0.102 0.13 0.115 0.581 0.141 0.14 0.138 0.156 0.599 0.117 0.128 0.125 0.126 0.588 0.161 0.149 0.152 0.144 0.555 0.112 0.13 0.117 0.641 0.139 0.122 0.129 0.61 MOTIF Kidney_E15.5_H3K9ac_32_160_0.637_4.326057e-305 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.133 0.597 0.131 0.139 0.137 0.11 0.61 0.143 0.577 0.132 0.148 0.143 0.645 0.102 0.128 0.125 0.602 0.131 0.132 0.135 0.17 0.584 0.124 0.122 0.119 0.128 0.577 0.176 0.143 0.141 0.14 0.576 0.123 0.126 0.118 0.633 0.145 0.131 0.127 0.597 MOTIF Stomach_E14.5_H3K9ac_30_155_0.661_1.782316e-296 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.605 0.133 0.13 0.132 0.627 0.117 0.129 0.127 0.57 0.148 0.139 0.143 0.16 0.585 0.128 0.127 0.126 0.132 0.584 0.158 0.137 0.139 0.139 0.585 0.12 0.136 0.111 0.633 0.124 0.152 0.14 0.584 0.131 0.619 0.109 0.141 0.124 0.134 0.607 0.135