MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Lung_E14.5_H3K4me3_62_166_0.599_3.083378e-172 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.997 0.001 0.001 0.001 0.2 0.001 0.798 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.525 0.473 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.092 0.001 0.761 0.146 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me3_53_166_0.618_6.630033e-181 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_70_171_0.568_1.300683e-63 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.737 0.076 0.084 0.103 0.135 0.089 0.695 0.081 0.089 0.08 0.094 0.737 0.09 0.079 0.075 0.756 0.103 0.078 0.09 0.729 0.078 0.087 0.1 0.735 0.123 0.686 0.074 0.117 0.733 0.066 0.07 0.131 0.075 0.092 0.647 0.186 0.086 0.078 0.071 0.765 0.101 0.074 0.068 0.757 0.068 0.104 0.084 0.744 MOTIF Heart_E11.5_H3K4me3_63_172_0.574_4.258771e-107 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.3 0.165 0.203 0.332 0.124 0.138 0.645 0.093 0.059 0.087 0.071 0.783 0.018 0.039 0.04 0.903 0.004 0.02 0.023 0.953 0.049 0.063 0.094 0.794 0.073 0.751 0.075 0.101 0.822 0.056 0.045 0.077 0.076 0.121 0.627 0.176 0.1 0.107 0.033 0.76 0.053 0.055 0.073 0.819 0.199 0.24 0.165 0.396 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me3_54_162_0.606_7.012349e-183 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.664 0.11 0.004 0.222 0.255 0.083 0.661 0.001 0.02 0.262 0.074 0.644 0.001 0.036 0.001 0.962 0.002 0.006 0.099 0.893 0.012 0.026 0.177 0.785 0.229 0.636 0.023 0.112 0.645 0.184 0.082 0.089 0.186 0.209 0.271 0.334 0.09 0.121 0.028 0.761 0.048 0.043 0.026 0.883 0.139 0.158 0.001 0.702 MOTIF Liver_E14.5_H3K27ac_51_157_0.536_4.94017e-18 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.546 0.143 0.116 0.195 0.759 0.129 0.091 0.021 0.745 0.139 0.11 0.006 0.93 0.068 0.001 0.001 0.109 0.783 0.106 0.002 0.199 0.001 0.001 0.799 0.001 0.01 0.798 0.191 0.278 0.119 0.009 0.594 0.176 0.197 0.143 0.484 0.68 0.084 0.025 0.211 0.641 0.124 0.096 0.139 0.262 0.372 0.286 0.08 MOTIF Liver_E13.5_H3K27ac_48_163_0.528_6.116952e-30 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.088 0.098 0.723 0.091 0.084 0.098 0.095 0.723 0.062 0.077 0.079 0.782 0.082 0.07 0.068 0.78 0.098 0.073 0.094 0.735 0.093 0.733 0.083 0.091 0.797 0.05 0.046 0.107 0.075 0.088 0.75 0.087 0.085 0.069 0.077 0.769 0.079 0.081 0.082 0.758 0.093 0.077 0.081 0.749 0.701 0.104 0.083 0.112 MOTIF Liver_E15.5_H3K27ac_43_168_0.534_6.569132e-32 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.782 0.056 0.07 0.092 0.068 0.202 0.665 0.065 0.055 0.217 0.065 0.663 0.053 0.065 0.068 0.814 0.061 0.048 0.058 0.833 0.207 0.082 0.07 0.641 0.061 0.806 0.065 0.068 0.834 0.04 0.031 0.095 0.067 0.082 0.781 0.07 0.057 0.059 0.045 0.839 0.043 0.068 0.06 0.829 0.061 0.08 0.065 0.794 MOTIF Liver_E15.5_H3K4me1_68_163_0.520_1.483219e-23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.09 0.095 0.082 0.733 0.774 0.004 0.089 0.133 0.114 0.122 0.652 0.112 0.06 0.105 0.081 0.754 0.026 0.03 0.081 0.863 0.14 0.075 0.088 0.697 0.105 0.061 0.114 0.72 0.115 0.702 0.076 0.107 0.864 0.001 0.001 0.134 0.042 0.111 0.753 0.094 0.106 0.063 0.056 0.775 0.119 0.09 0.08 0.711 MOTIF Intestine_E15.5_H3K9ac_62_170_0.554_1.604109e-42 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.787 0.058 0.083 0.072 0.773 0.067 0.084 0.076 0.748 0.071 0.08 0.101 0.099 0.721 0.088 0.092 0.114 0.059 0.052 0.775 0.11 0.082 0.713 0.095 0.73 0.111 0.081 0.078 0.808 0.062 0.081 0.049 0.792 0.081 0.08 0.047 0.688 0.099 0.128 0.085 0.094 0.722 0.092 0.092 0.108 0.089 0.058 0.745 MOTIF Lung_E16.5_H3K9ac_53_163_0.561_1.716672e-100 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.892 0.028 0.048 0.032 0.934 0.034 0.027 0.005 0.879 0.045 0.021 0.055 0.034 0.517 0.408 0.041 0.021 0.031 0.015 0.933 0.009 0.044 0.504 0.443 0.855 0.026 0.047 0.072 0.948 0.017 0.023 0.012 0.975 0.001 0.016 0.008 0.865 0.076 0.03 0.029 0.037 0.536 0.408 0.019 0.037 0.073 0.01 0.88 MOTIF Liver_E12.5_H3K9ac_46_158_0.551_5.011234e-60 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.85 0.035 0.068 0.047 0.049 0.093 0.806 0.052 0.045 0.057 0.043 0.855 0.061 0.06 0.059 0.82 0.037 0.03 0.046 0.887 0.051 0.044 0.069 0.836 0.78 0.088 0.047 0.085 0.84 0.031 0.071 0.058 0.068 0.086 0.781 0.065 0.05 0.079 0.059 0.812 0.048 0.041 0.033 0.878 0.059 0.061 0.025 0.855 MOTIF Liver_E11.5_H3K9ac_51_168_0.549_3.752959e-65 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K9ac_52_162_0.575_2.164112e-82 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.764 0.076 0.08 0.08 0.76 0.083 0.078 0.079 0.742 0.086 0.084 0.088 0.091 0.717 0.095 0.097 0.075 0.077 0.059 0.789 0.097 0.085 0.085 0.733 0.725 0.096 0.08 0.099 0.778 0.084 0.075 0.063 0.759 0.079 0.081 0.081 0.733 0.086 0.083 0.098 0.089 0.711 0.1 0.1 0.083 0.085 0.044 0.788 MOTIF Stomach_P0_H3K9ac_55_163_0.561_6.506154e-86 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.782 0.069 0.079 0.07 0.781 0.083 0.07 0.066 0.759 0.078 0.084 0.079 0.105 0.689 0.105 0.101 0.083 0.081 0.069 0.767 0.108 0.086 0.126 0.68 0.736 0.09 0.08 0.094 0.809 0.064 0.076 0.051 0.787 0.088 0.069 0.056 0.748 0.089 0.083 0.08 0.095 0.726 0.097 0.082 0.112 0.088 0.063 0.737