MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K27ac_29_167_0.553_1.446814e-85
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.809	0.057	0.073	0.061
0.78	0.059	0.104	0.057
0.103	0.069	0.106	0.722
0.135	0.472	0.208	0.185
0.218	0.053	0.52	0.209
0.08	0.119	0.709	0.092
0.738	0.104	0.078	0.08
0.083	0.041	0.049	0.827
0.016	0.027	0.04	0.917
0.02	0.066	0.037	0.877
0.054	0.102	0.061	0.783
0.065	0.829	0.037	0.069

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K27ac_17_171_0.562_4.595082e-57
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.892	0.001	0.106	0.001
0.845	0.043	0.016	0.096
0.141	0.033	0.208	0.618
0.001	0.828	0.119	0.052
0.176	0.246	0.238	0.34
0.164	0.068	0.743	0.025
0.503	0.236	0.001	0.26
0.057	0.001	0.001	0.941
0.001	0.049	0.001	0.949
0.169	0.226	0.159	0.446

MOTIF	Liver_E14.5_H3K27me3_37_154_0.549_1.998866e-23
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.275	0.128	0.497	0.1
0.913	0.048	0.032	0.007
0.987	0.001	0.001	0.011
0.828	0.049	0.065	0.058
0.044	0.05	0.109	0.797
0.096	0.723	0.117	0.064
0.298	0.108	0.328	0.266
0.03	0.007	0.945	0.018
0.828	0.058	0.011	0.103
0.164	0.02	0.097	0.719
0.001	0.01	0.009	0.98
0.021	0.205	0.13	0.644

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me2_56_169_0.568_1.615292e-150
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me2_36_171_0.588_9.240115e-284
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.722	0.09	0.098	0.09
0.742	0.091	0.093	0.074
0.704	0.097	0.098	0.101
0.12	0.098	0.124	0.658
0.084	0.742	0.08	0.094
0.114	0.12	0.65	0.116
0.093	0.126	0.693	0.088
0.678	0.13	0.089	0.103
0.098	0.101	0.099	0.702
0.091	0.103	0.098	0.708

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me2_58_170_0.574_3.341863e-191
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1

MOTIF	Heart_E16.5_H3K4me3_8_151_0.673_6.782658e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.233	0.291	0.243	0.233
0.369	0.06	0.407	0.164
0.613	0.098	0.194	0.095
0.741	0.119	0.049	0.091
0.317	0.254	0.312	0.117
0.007	0.784	0.072	0.137
0.021	0.022	0.848	0.109
0.474	0.123	0.29	0.113
0.712	0.095	0.078	0.115
0.475	0.133	0.18	0.212

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me3_14_151_0.679_1.489494e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.353	0.153	0.293	0.201
0.701	0.063	0.223	0.013
0.483	0.179	0.182	0.156
0.222	0.424	0.203	0.151
0.004	0.785	0.204	0.007
0.005	0.18	0.804	0.011
0.328	0.134	0.485	0.053
0.473	0.176	0.19	0.161
0.49	0.288	0.207	0.015
0.219	0.246	0.29	0.245

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me3_54_171_0.617_1.737558e-235
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044	0.406	0.301	0.25
0.142	0.21	0.351	0.297
0.248	0.073	0.177	0.502
0.522	0.141	0.039	0.298
0.627	0.072	0.107	0.194
0.591	0.141	0.142	0.126
0.109	0.778	0.108	0.005
0.006	0.244	0.555	0.195
0.108	0.107	0.713	0.072
0.525	0.141	0.262	0.072
0.162	0.141	0.313	0.384
0.306	0.214	0.145	0.336

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me3_29_158_0.665_1.170945e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.244	0.269	0.222	0.264
0.264	0.141	0.152	0.444
0.652	0.216	0.004	0.128
0.477	0.163	0.229	0.131
0.204	0.387	0.201	0.208
0.039	0.692	0.258	0.011
0.138	0.202	0.62	0.04
0.022	0.11	0.79	0.078
0.624	0.284	0.041	0.051
0.485	0.242	0.227	0.046
0.311	0.253	0.296	0.14
0.271	0.237	0.239	0.252

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me3_26_166_0.677_6.847699e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.221	0.247	0.351	0.181
0.202	0.206	0.435	0.158
0.295	0.042	0.079	0.584
0.115	0.503	0.191	0.191
0.042	0.612	0.304	0.042
0.005	0.228	0.702	0.065
0.334	0.079	0.456	0.131
0.16	0.211	0.116	0.513
0.227	0.042	0.21	0.521
0.19	0.177	0.03	0.603
0.079	0.579	0.116	0.226
0.09	0.133	0.559	0.218

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me3_57_171_0.627_3.306151e-287
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.583	0.126	0.143	0.148
0.56	0.158	0.116	0.166
0.132	0.12	0.139	0.609
0.139	0.639	0.108	0.114
0.133	0.538	0.198	0.131
0.154	0.056	0.657	0.133
0.602	0.153	0.102	0.143
0.137	0.132	0.137	0.594
0.136	0.143	0.087	0.634
0.159	0.151	0.108	0.582

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me3_49_165_0.632_2.52054e-292
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.696	0.12	0.154	0.03
0.574	0.164	0.14	0.122
0.126	0.091	0.153	0.63
0.164	0.644	0.051	0.141
0.138	0.53	0.21	0.122
0.135	0.103	0.641	0.121
0.528	0.163	0.144	0.165
0.131	0.113	0.154	0.602
0.126	0.144	0.118	0.612
0.153	0.161	0.145	0.541

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me3_46_165_0.630_1.241728e-268
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.722	0.012	0.111	0.155
0.466	0.152	0.159	0.223
0.245	0.018	0.12	0.617
0.176	0.662	0.147	0.015
0.168	0.452	0.239	0.142
0.23	0.021	0.666	0.083
0.528	0.187	0.054	0.231
0.186	0.135	0.157	0.522
0.091	0.219	0.057	0.633
0.24	0.204	0.192	0.364

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_52_175_0.601_9.161039e-188
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.863	0.042	0.051	0.044
0.779	0.086	0.071	0.064
0.069	0.083	0.064	0.784
0.071	0.788	0.062	0.079
0.066	0.785	0.063	0.086
0.062	0.056	0.782	0.1
0.793	0.059	0.078	0.07
0.073	0.06	0.081	0.786
0.077	0.054	0.061	0.808
0.063	0.061	0.043	0.833