MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Liver_E16.5_H3K27me3_41_158_0.535_1.784469e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.714	0.086	0.1
0.094	0.1	0.706	0.1
0.075	0.775	0.079	0.071
0.072	0.086	0.071	0.771
0.075	0.088	0.081	0.756
0.084	0.064	0.081	0.771
0.087	0.078	0.736	0.099
0.73	0.102	0.106	0.062
0.774	0.066	0.093	0.067
0.762	0.075	0.095	0.068
0.763	0.054	0.098	0.085
0.083	0.084	0.743	0.09

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K27me3_27_170_0.531_1.440613e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.184	0.227	0.367	0.222
0.115	0.655	0.109	0.121
0.117	0.109	0.662	0.112
0.068	0.81	0.05	0.072
0.032	0.057	0.001	0.91
0.02	0.062	0.057	0.861
0.063	0.015	0.087	0.835
0.075	0.062	0.796	0.067
0.783	0.071	0.093	0.053
0.866	0.045	0.057	0.032
0.823	0.052	0.067	0.058
0.404	0.192	0.231	0.172

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me2_18_152_0.627_3.894962e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.045	0.884	0.035	0.036
0.104	0.001	0.876	0.019
0.221	0.26	0.29	0.228
0.257	0.176	0.026	0.541
0.118	0.255	0.001	0.626
0.281	0.001	0.065	0.653
0.106	0.219	0.534	0.141
0.522	0.226	0.11	0.142
0.813	0.01	0.161	0.016
0.643	0.107	0.111	0.139

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me2_40_166_0.601_3.038185e-252
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.139	0.128	0.114	0.619
0.125	0.116	0.122	0.637
0.132	0.126	0.153	0.589
0.154	0.538	0.15	0.158
0.598	0.133	0.139	0.13
0.616	0.136	0.131	0.117
0.591	0.152	0.12	0.137
0.153	0.148	0.549	0.15
0.12	0.641	0.119	0.12
0.139	0.119	0.621	0.121

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me2_60_163_0.589_4.37027e-173
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me2_69_169_0.564_5.289859e-133
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K4me2_14_155_0.648_8.843775e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.125	0.624	0.116	0.135
0.121	0.122	0.632	0.125
0.132	0.596	0.133	0.139
0.126	0.141	0.149	0.584
0.132	0.152	0.142	0.574
0.125	0.601	0.125	0.149
0.113	0.121	0.639	0.127
0.124	0.613	0.14	0.123
0.558	0.148	0.153	0.141
0.145	0.133	0.584	0.138

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me2_37_172_0.613_5.577631e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.104	0.606	0.142	0.148
0.136	0.472	0.233	0.159
0.135	0.043	0.69	0.132
0.223	0.21	0.211	0.357
0.077	0.052	0.055	0.816
0.062	0.163	0.056	0.719
0.17	0.21	0.178	0.443
0.185	0.155	0.481	0.178
0.258	0.531	0.122	0.089
0.478	0.078	0.213	0.231

MOTIF	Lung_P0_H3K4me2_38_165_0.596_2.119789e-249
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.128	0.14	0.129	0.603
0.136	0.146	0.123	0.595
0.133	0.132	0.589	0.146
0.14	0.59	0.136	0.134
0.6	0.124	0.143	0.133
0.619	0.115	0.145	0.121
0.616	0.125	0.132	0.127
0.558	0.147	0.153	0.142
0.141	0.622	0.107	0.13
0.133	0.117	0.611	0.139

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me2_29_162_0.633_1.122983e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.133	0.173	0.12	0.574
0.177	0.188	0.001	0.634
0.148	0.115	0.5	0.238
0.176	0.61	0.136	0.078
0.563	0.145	0.138	0.154
0.53	0.153	0.188	0.129
0.501	0.229	0.133	0.137
0.18	0.199	0.46	0.162
0.172	0.768	0.029	0.031
0.169	0.036	0.651	0.144

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me2_28_160_0.627_2.764867e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.028	0.802	0.048	0.122
0.001	0.775	0.17	0.054
0.001	0.001	0.997	0.001
0.132	0.515	0.115	0.238
0.041	0.048	0.107	0.804
0.001	0.168	0.014	0.817
0.035	0.129	0.069	0.767
0.021	0.12	0.723	0.136
0.223	0.68	0.085	0.012
0.605	0.013	0.105	0.277

MOTIF	Liver_E11.5_H3K4me2_26_154_0.594_1.085392e-267
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.082	0.001	0.916
0.053	0.163	0.001	0.783
0.088	0.068	0.421	0.423
0.334	0.601	0.045	0.02
0.757	0.001	0.111	0.131
0.886	0.062	0.051	0.001
0.945	0.053	0.001	0.001
0.07	0.065	0.854	0.011
0.001	0.997	0.001	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me2_50_166_0.551_2.796446e-136
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me2_57_168_0.568_2.2265e-142
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.049	0.078	0.051	0.822
0.063	0.093	0.05	0.794
0.052	0.064	0.752	0.132
0.051	0.768	0.105	0.076
0.773	0.057	0.069	0.101
0.837	0.057	0.069	0.037
0.867	0.025	0.063	0.045
0.051	0.057	0.838	0.054
0.099	0.796	0.052	0.053
0.09	0.071	0.753	0.086

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me2_38_173_0.599_7.374946e-270
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.059	0.716	0.017	0.208
0.007	0.028	0.886	0.079
0.078	0.847	0.074	0.001
0.131	0.198	0.378	0.293
0.083	0.108	0.078	0.731
0.243	0.085	0.11	0.562
0.001	0.027	0.951	0.021
0.133	0.68	0.13	0.057
0.824	0.024	0.08	0.072
0.719	0.073	0.193	0.015