MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Heart_P0_H3K4me2_58_167_0.559_1.764077e-133 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me2_30_165_0.617_2.155716e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me2_55_161_0.579_7.732144e-183 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me2_53_175_0.568_4.200414e-122 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me2_50_168_0.587_1.316882e-213 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.279 0.107 0.338 0.277 0.066 0.09 0.764 0.08 0.166 0.557 0.134 0.143 0.155 0.11 0.579 0.156 0.142 0.539 0.155 0.164 0.128 0.16 0.507 0.205 0.034 0.075 0.075 0.816 0.017 0.063 0.087 0.833 0.063 0.072 0.097 0.768 0.682 0.132 0.106 0.08 0.771 0.089 0.075 0.065 0.354 0.189 0.25 0.208 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me2_41_169_0.602_2.792299e-278 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me2_39_162_0.605_1.698949e-236 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Lung_P0_H3K4me2_39_164_0.596_5.423953e-245 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me2_54_156_0.572_5.639116e-164 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.769 0.056 0.086 0.089 0.088 0.067 0.764 0.081 0.145 0.589 0.141 0.125 0.117 0.113 0.632 0.138 0.082 0.743 0.08 0.095 0.077 0.1 0.033 0.79 0.056 0.061 0.069 0.814 0.053 0.074 0.065 0.808 0.084 0.094 0.091 0.731 0.738 0.084 0.097 0.081 0.813 0.067 0.063 0.057 0.809 0.05 0.07 0.071 MOTIF Heart_E13.5_H3K9ac_60_164_0.531_4.991632e-68 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.459 0.178 0.176 0.186 0.137 0.137 0.14 0.586 0.148 0.136 0.136 0.58 0.573 0.148 0.132 0.147 0.608 0.118 0.143 0.131 0.171 0.622 0.135 0.072 0.76 0.037 0.028 0.175 0.139 0.133 0.613 0.115 0.183 0.498 0.154 0.166 0.176 0.156 0.495 0.173 0.143 0.589 0.146 0.122 0.524 0.176 0.109 0.191 MOTIF Heart_E14.5_H3K9ac_28_161_0.574_1.833796e-182 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K9ac_31_160_0.600_1.015661e-169 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_42_166_0.591_1.67127e-134 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.217 0.226 0.315 0.242 0.157 0.532 0.144 0.167 0.15 0.14 0.557 0.153 0.118 0.619 0.121 0.142 0.109 0.123 0.076 0.692 0.084 0.111 0.113 0.692 0.089 0.113 0.109 0.689 0.124 0.131 0.127 0.618 0.634 0.124 0.12 0.122 0.682 0.111 0.108 0.099 0.671 0.099 0.116 0.114 0.26 0.21 0.301 0.229 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K9ac_38_168_0.577_2.057557e-141 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Stomach_E15.5_H3K9ac_36_165_0.627_1.245094e-141 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.139 0.279 0.25 0.332 0.072 0.299 0.191 0.439 0.623 0.146 0.138 0.093 0.608 0.16 0.226 0.006 0.649 0.056 0.195 0.1 0.549 0.199 0.162 0.09 0.439 0.015 0.251 0.295 0.001 0.131 0.803 0.065 0.097 0.636 0.002 0.265 0.214 0.059 0.554 0.173