MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K27ac_78_21_0.511_1.741367e-37
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.346112	0.221537	0.054561	0.37779
0.023511	0.881309	0.064085	0.031095
0.07229	0.031959	0.744483	0.151268
0.08686	0.880769	0.011192	0.021179
0.034001	0.0	0.047792	0.918207
0.0	0.980802	0.00895	0.010249
0.323395	0.361626	0.308437	0.006541
0.004538	0.963421	0.020433	0.011608
0.046077	0.882184	0.024601	0.047137

MOTIF	Lung_E16.5_H3K27ac_66_37_0.513_2.082141e-62
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025848	0.938851	0.035301	0.0
0.442943	0.329561	0.050308	0.177188
0.03383	0.863428	0.081458	0.021283
0.041209	0.0	0.94496	0.013831
0.021134	0.936911	0.031641	0.010313
0.015048	0.027842	0.035897	0.921212
0.012587	0.956688	0.01448	0.016244
0.285839	0.592382	0.067336	0.054443
0.0	0.94385	0.010843	0.045307

MOTIF	Liver_E16.5_H3K4me3_31_24_0.631_6.617728e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.023653	0.90209	0.04644	0.027818
0.012609	0.086419	0.642619	0.258353
0.00248	0.936543	0.013776	0.0472
0.006472	0.097638	0.779512	0.116378
0.018659	0.014987	0.959749	0.006605
0.012244	0.008402	0.976905	0.002449
0.894515	0.010446	0.029344	0.065695
0.229729	0.032396	0.719527	0.018348
0.27126	0.535067	0.008866	0.184807
0.11535	0.289977	0.533465	0.061208

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_36_15_0.666_8.526149e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0554	0.866541	0.050987	0.027073
0.089204	0.049458	0.728238	0.133101
0.017176	0.868674	0.034768	0.079381
0.051672	0.081306	0.045615	0.821406
0.022497	0.845064	0.067614	0.064825
0.017549	0.847405	0.06032	0.074727
0.093844	0.856499	0.026106	0.023551
0.056802	0.028917	0.793911	0.12037
0.052529	0.521311	0.380432	0.045728
0.089636	0.0	0.883465	0.026899
0.897721	0.0	0.0	0.102279

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me3_11_13_0.699_2.014148e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.021526	0.90775	0.048377	0.022348
0.011721	0.060676	0.857485	0.070117
0.040928	0.780993	0.023714	0.154365
0.04297	0.031188	0.016303	0.909538
0.000313	0.971374	0.011113	0.0172
0.114162	0.700515	0.026076	0.159247
0.174785	0.680951	0.063369	0.080895
0.014571	0.056743	0.89417	0.034515
0.093969	0.69772	0.104482	0.103829
0.276183	0.143524	0.375876	0.204417
0.013455	0.654282	0.318213	0.01405
0.169647	0.07426	0.403374	0.352719

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K4me3_10_26_0.701_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013802	0.729926	0.04363	0.212641
0.040955	0.868403	0.066105	0.024537
0.139636	0.028914	0.770224	0.061226
0.038493	0.773937	0.051303	0.136266
0.075542	0.041561	0.025055	0.857842
0.043175	0.735055	0.046422	0.175348
0.017787	0.821853	0.037963	0.122397
0.009636	0.910206	0.057218	0.02294
0.014297	0.056987	0.778962	0.149754

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_13_17_0.710_1.299816e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013174	0.88425	0.069028	0.033548
0.051669	0.905854	0.006964	0.035513
0.034328	0.012865	0.878881	0.073926
0.042338	0.79413	0.048713	0.114819
0.10269	0.032004	0.086242	0.779063
0.057694	0.803168	0.042002	0.097137
0.138353	0.629635	0.032368	0.199644
0.09826	0.834142	0.036544	0.031054
0.048312	0.039794	0.819096	0.092798
0.114448	0.477905	0.238483	0.169165

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me3_62_41_0.600_6.595596e-247
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.053065	0.082112	0.713677	0.151146
0.004801	0.857544	0.033125	0.104531
0.034979	0.023098	0.070885	0.871038
0.014555	0.908272	0.040595	0.036578
0.041368	0.889531	0.022637	0.046464
0.134134	0.71965	0.041859	0.104356
0.12038	0.043458	0.664977	0.171185
0.058669	0.799853	0.088702	0.052777
0.024171	0.871878	0.075831	0.02812

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K4me3_39_29_0.641_2.291197e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.600434	0.343704	0.0	0.055861
0.026381	0.94513	0.004103	0.024386
0.1465	0.090801	0.691909	0.07079
0.000696	0.858433	0.033792	0.107079
0.090063	0.03139	0.056027	0.82252
0.034359	0.856208	0.052242	0.057191
0.16704	0.754617	0.054349	0.023994
0.198521	0.775792	0.002145	0.023542
0.033352	0.004844	0.784887	0.176917
0.009942	0.952569	0.029172	0.008317

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me3_29_22_0.670_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027753	0.900505	0.047754	0.023988
0.048823	0.041315	0.840016	0.069847
0.03322	0.826619	0.04631	0.093852
0.028124	0.022038	0.041588	0.908251
0.020911	0.794535	0.031327	0.153227
0.098256	0.80897	0.034737	0.058037
0.030213	0.81709	0.130048	0.022649
0.090672	0.037737	0.609691	0.2619
0.013597	0.886731	0.075732	0.023939
0.24057	0.481613	0.165089	0.112729

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me3_34_15_0.636_4.601233e-320
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.039171	0.884044	0.037791	0.038994
0.018379	0.051335	0.845478	0.084808
0.03996	0.795938	0.030515	0.133587
0.07657	0.020114	0.025574	0.877743
0.027297	0.902439	0.042686	0.027577
0.048767	0.843231	0.008653	0.099349
0.1563	0.775498	0.048432	0.01977
0.105492	0.025896	0.694247	0.174365
0.107625	0.7177	0.12529	0.049385
0.145586	0.489028	0.175803	0.189583

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me3_22_21_0.668_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.112447	0.794839	0.027585	0.065129
0.017311	0.027097	0.884996	0.070596
0.066341	0.756634	0.058457	0.118567
0.078323	0.04803	0.084246	0.789401
0.029483	0.88713	0.051868	0.03152
0.055779	0.842421	0.015581	0.086219
0.134248	0.803573	0.047304	0.014875
0.097035	0.028012	0.742728	0.132225
0.068919	0.762083	0.101831	0.067167

MOTIF	Limb_E13.5_H3K4me3_20_15_0.687_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088752	0.824715	0.042842	0.043691
0.04753	0.057618	0.749104	0.145748
0.039188	0.841493	0.051558	0.067762
0.06682	0.054633	0.088467	0.79008
0.023382	0.899922	0.039394	0.037303
0.056977	0.800924	0.047388	0.094711
0.121051	0.80013	0.057149	0.021669
0.085819	0.035428	0.761099	0.117655
0.050152	0.714036	0.178933	0.05688

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me3_23_17_0.710_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.13597	0.717399	0.043636	0.102995
0.094673	0.049324	0.668726	0.187277
0.071975	0.781684	0.027508	0.118833
0.047053	0.047371	0.080663	0.824914
0.016363	0.87694	0.058686	0.048011
0.073988	0.85898	0.052779	0.014253
0.03703	0.912465	0.029104	0.021401
0.020596	0.03249	0.833583	0.113331
0.06849	0.805763	0.100782	0.024965
0.253066	0.307	0.267385	0.17255

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me3_17_21_0.717_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.109554	0.686013	0.076051	0.128382
0.055968	0.071672	0.719319	0.153041
0.072235	0.784894	0.046496	0.096375
0.04335	0.059911	0.0624	0.83434
0.01097	0.928714	0.025832	0.034484
0.045376	0.803363	0.049312	0.101948
0.102948	0.793168	0.056674	0.04721
0.039497	0.033452	0.89561	0.031441
0.090477	0.739909	0.112801	0.056813