MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Lung_E15.5_H3K27me3_48_57_0.513_2.869701e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.192831	0.770756	0.036413	0.0
0.068012	0.091648	0.781141	0.059199
0.011935	0.761739	0.054842	0.171483
0.037339	0.916111	0.021701	0.024849
0.015659	0.883208	0.097261	0.003871
0.807414	0.046296	0.065945	0.080346
0.002158	0.021495	0.944462	0.031884
0.033591	0.458324	0.506969	0.001116
0.879343	0.047901	0.038733	0.034024
0.029741	0.021638	0.830884	0.117737
0.02138	0.689997	0.278562	0.010061
0.034245	0.789657	0.102869	0.07323

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me1_6_174_0.559_1.134401e-65
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001	0.641	0.227	0.131
0.001	0.734	0.204	0.061
0.001	0.805	0.001	0.193
0.29	0.191	0.001	0.518
0.001	0.211	0.63	0.158
0.001	0.871	0.062	0.066
0.491	0.037	0.149	0.324
0.001	0.001	0.924	0.074

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me1_40_13_0.524_1.632746e-33
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012615	0.851902	0.070267	0.065216
0.120699	0.734229	0.036904	0.108167
0.010704	0.891502	0.093847	0.003946
0.761059	0.052555	0.051837	0.134549
0.008448	0.064217	0.906918	0.020417
0.057497	0.793261	0.134439	0.014804
0.663244	0.085752	0.129109	0.121895
0.032985	0.094771	0.791125	0.081119
0.051927	0.821622	0.104018	0.022433
0.065345	0.049758	0.359274	0.525623

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me3_95_74_0.520_1.336326e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.38144	0.457199	0.094984	0.066377
0.245514	0.082459	0.284232	0.387796
0.036526	0.884065	0.056232	0.023177
0.181454	0.743275	0.052298	0.022973
0.0	0.769203	0.230448	0.00035
0.71907	0.053194	0.04684	0.180895
0.000736	0.058493	0.937124	0.003647
0.065577	0.882412	0.045637	0.006374
0.672816	0.041458	0.125687	0.160039
0.002968	0.015371	0.916345	0.065316
0.147754	0.780335	0.028496	0.043415

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me3_83_42_0.549_2.791271e-57
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.293304	0.235944	0.096481	0.374271
0.116386	0.220078	0.097201	0.566335
0.054159	0.852018	0.033363	0.060459
0.031664	0.839665	0.023578	0.105092
0.039258	0.802062	0.024064	0.134617
0.215164	0.057846	0.536627	0.190363
0.08042	0.04637	0.863093	0.010117
0.047507	0.875129	0.049262	0.028101
0.75616	0.090449	0.050881	0.10251
0.0	0.022559	0.934052	0.043388
0.018658	0.928743	0.044058	0.008541

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K9ac_94_115_0.511_4.815652e-59
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.126691	0.783059	0.09025	0.0
0.067912	0.024528	0.063405	0.844155
0.002819	0.028796	0.95804	0.010345
0.003587	0.990204	0.006209	0.0
0.0515	0.0	0.023418	0.925082
0.0	0.174478	0.815061	0.010461
0.089534	0.0	0.604358	0.306107
0.024595	0.053445	0.916028	0.005932
0.255184	0.607053	0.043949	0.093814

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K9ac_77_61_0.529_7.536517e-36
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.316618	0.22438	0.296637	0.162364
0.101771	0.048128	0.424012	0.426088
0.02931	0.909074	0.035331	0.026284
0.135183	0.628091	0.035091	0.201635
0.009857	0.952616	0.036007	0.00152
0.69234	0.047655	0.042245	0.217759
0.004723	0.028247	0.944672	0.022358
0.024392	0.934705	0.031281	0.009622
0.693068	0.052662	0.185729	0.06854
0.0014	0.022394	0.817165	0.159041
0.031822	0.846493	0.041062	0.080623

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K9ac_92_82_0.507_1.147884e-20
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.113927	0.145679	0.212427	0.527967
0.022528	0.815227	0.040347	0.121899
0.209649	0.695831	0.062765	0.031755
0.0	0.955053	0.044947	0.0
0.743435	0.029484	0.062287	0.164793
0.002772	0.050834	0.930659	0.015734
0.118296	0.804566	0.072342	0.004797
0.707877	0.041171	0.070671	0.180281
0.004681	0.040902	0.854844	0.099572
0.040121	0.891289	0.029982	0.038608

MOTIF	Limb_E14.5_H3K9ac_84_76_0.516_3.239693e-17
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.145764	0.079334	0.175916	0.598986
0.031356	0.788699	0.058246	0.121699
0.126249	0.751167	0.024162	0.098422
0.004184	0.958148	0.036781	0.000887
0.709212	0.069212	0.049487	0.17209
0.003295	0.149721	0.825497	0.021486
0.070051	0.910593	0.017093	0.002262
0.664595	0.050388	0.086043	0.198974
0.004248	0.046382	0.875439	0.073931
0.075002	0.782068	0.036486	0.106444
0.0	0.018497	0.32372	0.657784

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K9ac_80_71_0.523_8.402849e-53
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.056234	0.696569	0.129688	0.117508
0.157257	0.679334	0.026482	0.136927
0.011127	0.930534	0.057418	0.00092
0.692417	0.080084	0.026483	0.201015
0.004754	0.01555	0.970798	0.008899
0.042715	0.941255	0.012314	0.003715
0.658656	0.067934	0.068954	0.204456
0.006448	0.03038	0.851073	0.1121
0.061925	0.799366	0.062141	0.076567

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K9ac_94_71_0.525_1.240861e-49
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038034	0.824221	0.047631	0.090114
0.140581	0.791754	0.035676	0.03199
0.021703	0.841901	0.123418	0.012978
0.715541	0.046436	0.1275	0.110524
0.003078	0.073052	0.90294	0.020931
0.041905	0.908105	0.043676	0.006313
0.71433	0.069612	0.046585	0.169473
0.002869	0.050441	0.843495	0.103195
0.077545	0.725301	0.172295	0.024859

MOTIF	Limb_E11.5_H3K9ac_81_69_0.520_1.08961e-29
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.004995	0.747458	0.104451	0.143097
0.077188	0.808969	0.034023	0.07982
0.009044	0.948289	0.023975	0.018691
0.678252	0.093235	0.04425	0.184264
0.007661	0.052058	0.937306	0.002975
0.045107	0.790009	0.160127	0.004758
0.775543	0.052608	0.121214	0.050635
0.012304	0.041517	0.852269	0.09391
0.015089	0.771718	0.183935	0.029258

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_75_61_0.528_1.732874e-59
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.034192	0.697529	0.160498	0.107781
0.161207	0.710761	0.020711	0.107321
0.006843	0.918818	0.073469	0.00087
0.723144	0.089843	0.052931	0.134082
0.002549	0.058239	0.935194	0.004018
0.03528	0.861342	0.097001	0.006377
0.774102	0.049478	0.106138	0.070282
0.008834	0.040336	0.860559	0.090271
0.086974	0.756358	0.128664	0.028004

MOTIF	Forebrain_E15.5_H3K9ac_73_76_0.530_1.005881e-32
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.050039	0.822288	0.077933	0.049739
0.244774	0.260888	0.484815	0.009524
0.012455	0.876208	0.111336	0.0
0.815679	0.039663	0.030789	0.113869
0.0	0.019869	0.972977	0.007154
0.112254	0.723018	0.162899	0.00183
0.873312	0.030203	0.030269	0.066216
0.005492	0.016082	0.898725	0.079701
0.117763	0.770108	0.034397	0.077733

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_81_58_0.544_1.395134e-78
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069358	0.826705	0.054513	0.049424
0.222051	0.228164	0.517761	0.032023
0.003804	0.81885	0.177345	0.0
0.798863	0.072778	0.013358	0.115002
0.0	0.100317	0.898477	0.001206
0.092708	0.787882	0.117764	0.001646
0.846275	0.029025	0.043592	0.081108
0.000777	0.037166	0.942571	0.019486
0.09265	0.819564	0.075165	0.012621