MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me3_8_153_0.753_2.534557e-321
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.099	0.704	0.103	0.094
0.079	0.095	0.733	0.093
0.095	0.701	0.095	0.109
0.107	0.114	0.084	0.695
0.094	0.682	0.102	0.122
0.083	0.106	0.725	0.086
0.078	0.737	0.096	0.089
0.103	0.104	0.678	0.115
0.664	0.13	0.119	0.087
0.683	0.111	0.12	0.086

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me3_21_163_0.712_3.693356e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.052	0.061	0.039	0.848
0.043	0.815	0.071	0.071
0.056	0.081	0.766	0.097
0.063	0.791	0.079	0.067
0.062	0.079	0.819	0.04
0.825	0.025	0.079	0.071
0.048	0.081	0.822	0.049
0.08	0.76	0.071	0.089
0.064	0.064	0.803	0.069
0.751	0.074	0.102	0.073

MOTIF	Limb_E11.5_H3K4me3_26_32_0.698_1.609316e-316
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.059383	0.26475	0.0	0.675867
0.545232	0.376349	0.07006	0.00836
0.0	0.029689	0.955043	0.015268
0.051226	0.904293	0.035138	0.009343
0.003663	0.027333	0.962054	0.00695
0.804141	0.060738	0.048292	0.086829
0.0	0.046845	0.932391	0.020765
0.015768	0.667629	0.272811	0.043792
0.194368	0.025969	0.715527	0.064136
0.150569	0.128154	0.656575	0.064702

MOTIF	Heart_P0_H3K4me3_68_46_0.579_1.50312e-193
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.003414	0.64994	0.094331	0.252315
0.087286	0.871227	0.016112	0.025374
0.076516	0.814579	0.068783	0.040122
0.365758	0.538864	0.032145	0.063232
0.089371	0.056889	0.843911	0.009828
0.065701	0.862374	0.066387	0.005538
0.047544	0.015736	0.0	0.93672
0.006112	0.823205	0.162564	0.008119
0.089022	0.016137	0.812275	0.082567
0.0	0.953094	0.046906	0.0

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me3_28_46_0.672_7.487903e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.696606	0.0	0.134982	0.168412
0.0	0.087891	0.912109	0.0
0.048702	0.90601	0.014377	0.03091
0.0	0.0	0.996496	0.003504
0.794672	0.047942	0.026622	0.130765
0.015667	0.027393	0.935445	0.021495
0.030873	0.583002	0.218697	0.167428
0.027647	0.181915	0.604497	0.185941
0.055114	0.011892	0.87083	0.062165

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K27ac_46_44_0.536_1.060658e-95
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.736261	0.031242	0.152258	0.08024
0.007081	0.040593	0.952325	0.0
0.053477	0.500772	0.0	0.445751
0.0	0.069335	0.930665	0.0
0.701812	0.04838	0.046072	0.203736
0.004587	0.031947	0.96059	0.002876
0.021478	0.819377	0.019009	0.140136
0.010762	0.039305	0.949933	0.0
0.024627	0.040319	0.735724	0.199331

MOTIF	Forebrain_P0_H3K27ac_9_31_0.568_2.293238e-216
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.108699	0.0	0.891301	0.0
0.308902	0.350676	0.0	0.340423
0.0	0.930543	0.069457	0.0
0.042321	0.029237	0.928442	0.0
0.178346	0.807283	0.01437	0.0
0.065502	0.070684	0.096906	0.766908
0.0	0.925054	0.04918	0.025766
0.027209	0.024193	0.884969	0.06363
0.0	0.923065	0.068696	0.008239

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K27ac_36_18_0.543_9.080466e-148
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.105908	0.366936	0.245723	0.281433
0.018393	0.0	0.911912	0.069695
0.190096	0.56754	0.086124	0.15624
0.087304	0.82948	0.061939	0.021276
0.093852	0.006823	0.727748	0.171576
0.010771	0.974004	0.015225	0.0
0.034891	0.050528	0.012125	0.902456
0.0	0.918212	0.081788	0.0
0.252698	0.020928	0.685652	0.040722
0.0	0.926873	0.073127	0.0
0.10044	0.607677	0.017285	0.274599

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K27ac_19_20_0.549_1.839328e-83
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.392306	0.574968	0.0	0.032725
0.060088	0.0	0.928703	0.011209
0.14716	0.703772	0.045921	0.103147
0.028301	0.876799	0.046303	0.048597
0.159771	0.006347	0.747806	0.086076
0.012635	0.946455	0.034006	0.006905
0.073992	0.021114	0.0	0.904894
0.0	0.901194	0.09692	0.001886
0.363045	0.031416	0.569266	0.036272
0.0	0.91261	0.076748	0.010643

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K27ac_17_12_0.556_5.148576e-200
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.064218	0.026296	0.330153	0.579332
0.21288	0.72168	0.051266	0.014175
0.044819	0.034541	0.841217	0.079423
0.206517	0.647479	0.058124	0.087879
0.013565	0.839152	0.082291	0.064992
0.043823	0.049744	0.884573	0.02186
0.079397	0.897727	0.019468	0.003408
0.08328	0.01875	0.026926	0.871044
0.001136	0.978167	0.020697	0.0
0.323018	0.018781	0.636493	0.021708
0.0	0.947008	0.052992	0.0

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K27me3_27_29_0.512_5.579062e-44
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.430686	0.428558	0.018919	0.121837
0.010564	0.943699	0.031762	0.013974
0.017675	0.028818	0.949741	0.003766
0.241024	0.723013	0.031788	0.004175
0.067647	0.108636	0.0	0.823717
0.0	0.964184	0.035816	0.0
0.027957	0.047054	0.906892	0.018096
0.0	0.958375	0.041625	0.0
0.164727	0.729275	0.027313	0.078685

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K27me3_12_26_0.551_1.155172e-42
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.163938	0.5429	0.206814	0.086348
0.047316	0.024353	0.928331	0.0
0.189137	0.617305	0.104426	0.089132
0.024502	0.874703	0.039603	0.061192
0.152504	0.007941	0.833724	0.005832
0.004431	0.972156	0.020341	0.003071
0.231595	0.020077	0.020491	0.727838
0.009439	0.872857	0.058988	0.058717
0.168776	0.010671	0.776212	0.044342
0.00949	0.765577	0.105324	0.119609

MOTIF	Heart_E13.5_H3K9ac_17_24_0.573_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.237439	0.516673	0.245887	0.0
0.118229	0.008575	0.830944	0.042252
0.099604	0.742374	0.019284	0.138738
0.019476	0.82661	0.045013	0.108901
0.156073	0.035907	0.774732	0.033288
0.131537	0.789551	0.067588	0.011324
0.127908	0.013539	0.024704	0.833849
0.0	0.921959	0.050007	0.028034
0.100291	0.029683	0.857114	0.012912
0.0	0.899628	0.051557	0.048816

MOTIF	Forebrain_P0_H3K9ac_21_13_0.633_5.342877e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.393862	0.0	0.277051	0.329087
0.102748	0.816115	0.050303	0.030834
0.106758	0.011662	0.810622	0.070958
0.02273	0.795083	0.064955	0.117232
0.067189	0.691671	0.049249	0.191891
0.072375	0.032337	0.784088	0.1112
0.007143	0.883827	0.102678	0.006351
0.05968	0.045081	0.034522	0.860717
0.000856	0.869493	0.117872	0.011779
0.085598	0.057217	0.618002	0.239183
0.0	0.950474	0.039087	0.010439

MOTIF	Limb_E14.5_H3K9ac_12_14_0.631_5.063375e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.082993	0.838266	0.038076	0.040665
0.095831	0.005987	0.814093	0.084088
0.054147	0.782356	0.051139	0.112357
0.037693	0.767291	0.04808	0.146937
0.03098	0.027552	0.821163	0.120305
0.040753	0.872379	0.086868	0.0
0.075826	0.02864	0.021879	0.873656
0.00126	0.772144	0.212346	0.01425
0.095827	0.0671	0.623861	0.213212
0.003542	0.916937	0.060923	0.018598