MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K27me3_43_2_0.509_3.804369e-55 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.024275 0.837512 0.097692 0.040521 0.06128 0.685275 0.011381 0.242064 0.058322 0.892136 0.023349 0.026193 0.021438 0.839307 0.028181 0.111074 0.046957 0.013618 0.90786 0.031565 0.01852 0.795105 0.147482 0.038893 0.059861 0.022794 0.8795 0.037846 0.017403 0.586344 0.366522 0.029732 0.162117 0.716865 0.063288 0.057731 0.088987 0.832332 0.025286 0.053395 0.045343 0.763188 0.04352 0.147949 0.097581 0.0 0.867662 0.034757 MOTIF Lung_E16.5_H3K27me3_11_1_0.570_9.513315e-102 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.032005 0.89499 0.027374 0.045631 0.064318 0.71218 0.17536 0.048142 0.109324 0.723056 0.049129 0.118491 0.025015 0.013342 0.940157 0.021486 0.034507 0.83813 0.079682 0.047681 0.032959 0.015623 0.903096 0.048322 0.056915 0.806651 0.045926 0.090508 0.088266 0.582628 0.189985 0.13912 0.071029 0.879342 0.015817 0.033812 0.250822 0.438793 0.23844 0.071945 0.28962 0.209141 0.109947 0.391292 0.027548 0.504892 0.347966 0.119593 MOTIF Intestine_P0_H3K27me3_6_1_0.562_1.134188e-90 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.035343 0.900264 0.024456 0.039938 0.069425 0.716124 0.171281 0.04317 0.116363 0.741917 0.043455 0.098266 0.023101 0.011514 0.944362 0.021024 0.033805 0.83407 0.084746 0.047379 0.034384 0.013066 0.906564 0.045986 0.051457 0.839984 0.043408 0.065152 0.09176 0.580405 0.202068 0.125767 0.104245 0.829901 0.024093 0.041761 0.268236 0.264211 0.399485 0.068067 0.094446 0.261279 0.287847 0.356428 0.291455 0.366196 0.32191 0.020438 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K27me3_2_1_0.604_6.407935e-62 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.024931 0.903919 0.025327 0.045823 0.059453 0.734739 0.156068 0.04974 0.08081 0.722056 0.087897 0.109237 0.020603 0.014235 0.937094 0.028067 0.031886 0.827392 0.093631 0.047092 0.049138 0.032156 0.851416 0.06729 0.053933 0.836127 0.047757 0.062182 0.081373 0.66545 0.142756 0.110422 0.078375 0.786914 0.101039 0.033672 0.332407 0.29673 0.304683 0.066179 0.106309 0.245641 0.418354 0.229696 MOTIF Stomach_E14.5_H3K27me3_9_0_0.568_1.139761e-44 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.022628 0.885935 0.051234 0.040203 0.05834 0.767778 0.131031 0.04285 0.079901 0.768783 0.059056 0.092261 0.021853 0.021057 0.930988 0.026103 0.027599 0.838094 0.092455 0.041852 0.046469 0.033891 0.796316 0.123324 0.043919 0.833395 0.050752 0.071934 0.070303 0.646479 0.164384 0.118835 0.06393 0.837758 0.067248 0.031064 0.188997 0.377337 0.374633 0.059033 0.135713 0.156193 0.489496 0.218598 0.162707 0.328535 0.452697 0.056061 MOTIF Liver_E16.5_H3K27me3_7_3_0.619_3.923258e-213 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.012048 0.9358 0.01351 0.038642 0.090224 0.756001 0.092604 0.06117 0.034763 0.759358 0.071302 0.134577 0.022957 0.012345 0.960225 0.004473 0.146015 0.751208 0.066021 0.036757 0.036472 0.018491 0.90161 0.043426 0.055703 0.75295 0.160677 0.030671 0.033651 0.552362 0.260928 0.153059 0.017302 0.933403 0.017937 0.031358 0.29719 0.063177 0.284142 0.355492 MOTIF Liver_E15.5_H3K27me3_12_3_0.540_1.835865e-201 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.042693 0.874803 0.049775 0.032729 0.068564 0.623383 0.286008 0.022044 0.040425 0.829715 0.09883 0.031031 0.028007 0.009902 0.936082 0.026009 0.045314 0.757498 0.123931 0.073256 0.042333 0.014675 0.902769 0.040223 0.060611 0.811404 0.035681 0.092304 0.076373 0.690627 0.182413 0.050587 0.026715 0.818279 0.061019 0.093987 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K4me2_15_1_0.649_4.334822e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.023987 0.895296 0.044912 0.035805 0.029525 0.721458 0.192219 0.056798 0.038894 0.757849 0.117231 0.086026 0.023658 0.008728 0.937011 0.030603 0.110381 0.799999 0.047535 0.042085 0.015823 0.020974 0.907977 0.055226 0.021359 0.707196 0.181086 0.090359 0.069496 0.595464 0.209733 0.125307 0.001529 0.908501 0.055474 0.034496 0.330279 0.029576 0.283261 0.356885 MOTIF Limb_E14.5_H3K4me2_17_9_0.652_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025563 0.908074 0.029007 0.037356 0.020944 0.701292 0.214711 0.063053 0.095048 0.692776 0.118309 0.093868 0.023684 0.011023 0.938088 0.027205 0.14903 0.745981 0.059559 0.04543 0.007582 0.002709 0.932196 0.057514 0.055882 0.731616 0.125149 0.087353 0.079158 0.701279 0.094507 0.125055 0.00896 0.884825 0.050995 0.055221 MOTIF Limb_E11.5_H3K9ac_17_1_0.608_4.481568e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.261114 0.338563 0.278546 0.121777 0.148164 0.205753 0.469493 0.17659 0.32018 0.291109 0.160861 0.22785 0.256766 0.037486 0.424152 0.281596 0.015949 0.917435 0.043262 0.023354 0.102058 0.749945 0.068806 0.079191 0.040717 0.827062 0.063926 0.068295 0.026508 0.022425 0.92955 0.021517 0.128484 0.726217 0.07309 0.072209 0.028416 0.018869 0.93351 0.019205 0.023151 0.66217 0.194025 0.120654 0.03555 0.589147 0.230141 0.145163 0.01497 0.939609 0.012246 0.033175 0.33492 0.063621 0.329806 0.271653 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K9ac_26_2_0.608_2.729214e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.123888 0.017058 0.496632 0.362423 0.019876 0.920485 0.025515 0.034124 0.02784 0.650128 0.216358 0.105675 0.040801 0.814709 0.107102 0.037387 0.027806 0.031865 0.909283 0.031047 0.162847 0.744421 0.059569 0.033163 0.011415 0.006708 0.927292 0.054586 0.061441 0.746883 0.067103 0.124572 0.03012 0.600727 0.2281 0.141054 0.003284 0.911568 0.044311 0.040837 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9ac_13_2_0.657_1.921421e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.010201 0.940303 0.023252 0.026244 0.100803 0.735048 0.086427 0.077723 0.031774 0.797494 0.064582 0.10615 0.019118 0.011615 0.958164 0.011103 0.16167 0.751263 0.056122 0.030945 0.024142 0.032797 0.908036 0.035024 0.073081 0.740733 0.074224 0.111962 0.027535 0.582828 0.222904 0.166733 0.015305 0.925948 0.029836 0.028911 0.217791 0.053866 0.370773 0.35757 0.152517 0.654772 0.151643 0.041069 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9ac_21_3_0.595_4.926606e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.025705 0.926851 0.013817 0.033627 0.023361 0.692638 0.217625 0.066376 0.042177 0.782344 0.129865 0.045615 0.027571 0.020629 0.926036 0.025764 0.170988 0.671712 0.068368 0.088932 0.002631 0.013232 0.944623 0.039514 0.018149 0.830445 0.117925 0.033482 0.085529 0.620273 0.13636 0.157837 0.048868 0.8635 0.048954 0.038678 0.279801 0.012315 0.271403 0.436481 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K9ac_18_1_0.610_4.405637e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.02249 0.922714 0.015656 0.03914 0.022231 0.764483 0.162611 0.050675 0.041578 0.760057 0.114208 0.084157 0.024771 0.017239 0.929616 0.028373 0.109029 0.762849 0.062458 0.065664 0.029112 0.023151 0.91862 0.029118 0.051994 0.652414 0.194818 0.100774 0.031909 0.669049 0.194816 0.104226 0.036028 0.869483 0.0531 0.041388 0.329298 0.027216 0.267526 0.37596 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K9ac_15_7_0.610_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.026651 0.906583 0.025703 0.041063 0.031988 0.71329 0.207564 0.047158 0.093174 0.715014 0.098369 0.093442 0.026937 0.012895 0.9282 0.031968 0.10908 0.788953 0.055099 0.046869 0.026264 0.019314 0.92953 0.024892 0.028117 0.749669 0.122155 0.10006 0.09557 0.623512 0.175214 0.105704 0.043805 0.868081 0.030378 0.057736