MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_49_67_0.517_3.202049e-32
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.474521	0.0	0.338197	0.187282
0.018318	0.980437	0.0	0.001245
0.699817	0.063843	0.032475	0.203865
0.059057	0.854066	0.084623	0.002254
0.871375	0.002811	0.017157	0.108658
0.0	0.021746	0.975897	0.002357
0.005818	0.869033	0.097906	0.027244
0.239696	0.729162	0.020425	0.010717
0.624941	0.281036	0.03979	0.054233
0.308571	0.038817	0.628755	0.023856
0.009836	0.431702	0.428919	0.129544

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K4me1_63_51_0.515_2.191224e-71
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.404877	0.357131	0.051756	0.186236
0.027615	0.906462	0.044743	0.02118
0.926485	0.015022	0.022294	0.0362
0.284551	0.640547	0.06429	0.010613
0.929475	0.006181	0.028941	0.035402
0.0	0.017201	0.975129	0.007671
0.050712	0.798785	0.10833	0.042173
0.133004	0.667665	0.173033	0.026298
0.776285	0.140571	0.041541	0.041603
0.088748	0.036499	0.759829	0.114924
0.168894	0.297591	0.405707	0.127807

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_79_118_0.511_4.257119e-46
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.69461	0.039229	0.11885	0.147312
0.152456	0.791797	0.043765	0.011982
0.724357	0.079484	0.029192	0.166967
0.019074	0.922997	0.050924	0.007005
0.753482	0.013685	0.091326	0.141507
0.0	0.012259	0.973998	0.013743
0.040155	0.776243	0.057079	0.126523
0.090851	0.776552	0.116997	0.0156
0.805576	0.068632	0.024953	0.100839

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me1_52_71_0.516_4.244178e-73
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.814408	0.042848	0.085978	0.056766
0.119666	0.764645	0.028887	0.086802
0.797294	0.031928	0.08723	0.083548
0.074924	0.856436	0.05815	0.010491
0.745245	0.008466	0.137925	0.108364
0.001267	0.013597	0.977743	0.007393
0.030532	0.785588	0.042922	0.140958
0.076446	0.714285	0.133918	0.075351
0.721336	0.138875	0.078311	0.061478
0.126384	0.315515	0.258491	0.299611

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me1_37_21_0.535_1.535642e-61
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.03337	0.84093	0.112009	0.013691
0.758572	0.069414	0.04475	0.127264
0.041902	0.80869	0.130779	0.018629
0.799143	0.033952	0.088039	0.078865
0.050062	0.801987	0.138542	0.009408
0.806696	0.040307	0.061252	0.091744
0.017155	0.030848	0.903627	0.04837
0.041193	0.874928	0.058305	0.025573
0.060087	0.72457	0.103789	0.111554
0.394369	0.274861	0.090662	0.240108
0.06126	0.353693	0.35977	0.225277
0.158792	0.391605	0.138383	0.31122

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me1_59_31_0.514_4.960786e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.10085	0.715617	0.150786	0.032747
0.804556	0.057229	0.075492	0.062723
0.061995	0.895024	0.035805	0.007176
0.888791	0.041624	0.024684	0.044901
0.070153	0.756696	0.158039	0.015112
0.832552	0.014433	0.050162	0.102852
0.008865	0.033347	0.947823	0.009965
0.050781	0.729267	0.158407	0.061545
0.179077	0.608752	0.077257	0.134915

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me1_72_34_0.505_0.002692991
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.097711	0.710926	0.107601	0.083762
0.729209	0.097276	0.075206	0.098309
0.044574	0.915603	0.033224	0.006598
0.840596	0.044946	0.023153	0.091305
0.026174	0.797091	0.152398	0.024338
0.824344	0.016429	0.062467	0.09676
0.007117	0.04794	0.914243	0.030701
0.008243	0.796192	0.131508	0.064057
0.162787	0.674717	0.020817	0.14168

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K4me1_43_20_0.523_2.268048e-82
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.086111	0.695897	0.157031	0.060961
0.787271	0.080272	0.075337	0.05712
0.033458	0.895921	0.065154	0.005467
0.855575	0.050037	0.02475	0.069639
0.055712	0.747975	0.179896	0.016417
0.798015	0.036664	0.067383	0.097938
0.017843	0.036093	0.898383	0.047681
0.022757	0.849574	0.080484	0.047184
0.149139	0.70548	0.026264	0.119117
0.24325	0.141304	0.248333	0.367114

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_62_15_0.513_3.168944e-24
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.078525	0.709571	0.146945	0.064959
0.773092	0.076135	0.090811	0.059962
0.053034	0.875863	0.066318	0.004786
0.808717	0.097835	0.032805	0.060643
0.062746	0.732288	0.199541	0.005425
0.804661	0.032858	0.058517	0.103965
0.013938	0.016807	0.939738	0.029517
0.01219	0.80059	0.131539	0.055681
0.124045	0.796459	0.023531	0.055965
0.372665	0.110551	0.167457	0.349326

MOTIF	Lung_P0_H3K4me1_74_12_0.509_5.215531e-16
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.073759	0.745905	0.132114	0.048223
0.696789	0.155681	0.065947	0.081583
0.026651	0.86338	0.092573	0.017396
0.791907	0.050785	0.072919	0.084389
0.069233	0.740083	0.173178	0.017507
0.835379	0.012739	0.060027	0.091855
0.007243	0.040754	0.918474	0.03353
0.025283	0.810105	0.111421	0.053191
0.109989	0.808721	0.023971	0.057318
0.360218	0.092372	0.146037	0.401373

MOTIF	Heart_E11.5_H3K4me1_54_17_0.514_2.332887e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.087065	0.766306	0.107974	0.038655
0.718196	0.125493	0.039515	0.116795
0.057482	0.888508	0.033329	0.020681
0.853711	0.015079	0.059231	0.071979
0.081057	0.719107	0.181409	0.018428
0.844309	0.030738	0.036044	0.088909
0.018856	0.024505	0.900384	0.056255
0.024739	0.793536	0.111404	0.070321
0.141836	0.764875	0.031167	0.062121
0.342588	0.114255	0.188794	0.354363

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me1_41_11_0.518_8.713542e-19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.10148	0.78122	0.06995	0.047349
0.699431	0.11544	0.070997	0.114131
0.051303	0.890999	0.032289	0.025409
0.821187	0.053383	0.064036	0.061394
0.05918	0.729725	0.194604	0.016491
0.825839	0.023805	0.050747	0.099609
0.015411	0.028539	0.901923	0.054127
0.01512	0.839175	0.0898	0.055905
0.134879	0.722723	0.021221	0.121176
0.338782	0.118709	0.204775	0.337734

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me1_62_18_0.513_1.553101e-18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.080734	0.729429	0.137192	0.052644
0.718307	0.124462	0.043075	0.114156
0.049859	0.883727	0.044118	0.022297
0.821561	0.05805	0.027565	0.092825
0.077898	0.751445	0.159711	0.010946
0.816178	0.035219	0.05647	0.092132
0.016375	0.025943	0.918557	0.039125
0.03402	0.830306	0.082398	0.053277
0.118726	0.740911	0.028163	0.112201
0.279181	0.123169	0.184962	0.412688

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me1_27_22_0.529_1.290619e-33
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.061356	0.837871	0.075429	0.025344
0.777103	0.079212	0.072887	0.070798
0.029604	0.863677	0.100207	0.006512
0.861325	0.056398	0.026863	0.055414
0.069126	0.727953	0.188578	0.014343
0.80697	0.046291	0.039841	0.106898
0.00907	0.02994	0.92068	0.040311
0.020736	0.758965	0.149852	0.070448
0.124601	0.728156	0.017857	0.129386
0.320272	0.175102	0.197213	0.307413

MOTIF	Limb_E11.5_H3K9me3_41_130_0.521_2.005994e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.090679	0.700562	0.0	0.208759
0.803808	0.063748	0.09071	0.041734
0.041606	0.918768	0.006132	0.033493
0.946971	0.008155	0.037988	0.006887
0.033793	0.017881	0.927667	0.02066
0.062964	0.719019	0.159171	0.058846
0.131213	0.804935	0.034975	0.028877
0.836162	0.047474	0.037181	0.079183
0.097825	0.090636	0.737682	0.073857
0.084273	0.481947	0.43378	0.0