MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me3_21_159_0.698_2.032929e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.419	0.258	0.07	0.253
0.339	0.261	0.224	0.176
0.162	0.223	0.167	0.448
0.121	0.309	0.085	0.485
0.072	0.613	0.059	0.256
0.233	0.444	0.064	0.259
0.078	0.108	0.603	0.211
0.069	0.094	0.271	0.566
0.035	0.787	0.155	0.023
0.03	0.023	0.913	0.034

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me3_10_159_0.711_3.163971e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.386	0.057	0.332	0.224
0.283	0.233	0.349	0.136
0.283	0.007	0.027	0.683
0.274	0.134	0.049	0.543
0.155	0.22	0.362	0.263
0.133	0.514	0.134	0.219
0.436	0.167	0.305	0.092
0.069	0.091	0.535	0.305
0.049	0.725	0.049	0.177
0.091	0.006	0.768	0.135
0.113	0.67	0.083	0.134
0.224	0.066	0.614	0.096

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K4me3_2_154_0.784_1.959562e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.247	0.222	0.188	0.343
0.313	0.193	0.229	0.265
0.366	0.058	0.116	0.46
0.185	0.293	0.045	0.477
0.266	0.134	0.47	0.131
0.066	0.755	0.113	0.066
0.015	0.198	0.738	0.049
0.268	0.207	0.378	0.146
0.008	0.847	0.079	0.066
0.099	0.002	0.786	0.113
0.298	0.181	0.26	0.262
0.384	0.212	0.169	0.236

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me3_18_172_0.722_7.059597e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.19	0.244	0.284	0.281
0.177	0.27	0.317	0.237
0.039	0.782	0.071	0.108
0.131	0.025	0.726	0.118
0.19	0.414	0.177	0.218
0.187	0.581	0.183	0.049
0.186	0.025	0.642	0.147
0.163	0.207	0.085	0.545
0.73	0.072	0.08	0.118
0.181	0.118	0.071	0.63
0.177	0.276	0.292	0.256
0.207	0.354	0.235	0.204

MOTIF	Intestine_P0_H3K4me3_15_159_0.697_5.260824e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.123	0.646	0.12	0.111
0.123	0.039	0.678	0.16
0.449	0.207	0.179	0.166
0.136	0.634	0.122	0.108
0.139	0.092	0.626	0.143
0.528	0.194	0.175	0.103
0.168	0.12	0.141	0.571
0.074	0.131	0.08	0.715
0.156	0.139	0.133	0.572
0.581	0.156	0.106	0.157

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me3_21_166_0.655_6.359712e-319
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.326	0.215	0.25	0.208
0.1	0.125	0.666	0.109
0.127	0.616	0.134	0.123
0.111	0.133	0.607	0.149
0.102	0.654	0.13	0.114
0.127	0.61	0.128	0.135
0.123	0.111	0.629	0.137
0.092	0.141	0.652	0.115
0.101	0.133	0.141	0.625
0.088	0.135	0.124	0.653
0.095	0.128	0.121	0.656
0.183	0.271	0.239	0.307

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me3_19_169_0.700_9.91277e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.32	0.214	0.245	0.221
0.092	0.129	0.669	0.11
0.127	0.618	0.134	0.121
0.111	0.132	0.608	0.149
0.092	0.657	0.142	0.109
0.131	0.608	0.126	0.135
0.128	0.111	0.633	0.128
0.099	0.143	0.645	0.113
0.108	0.137	0.138	0.617
0.087	0.139	0.124	0.65
0.09	0.127	0.121	0.662
0.179	0.273	0.237	0.311

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K4me3_36_157_0.648_4.608176e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.278	0.216	0.282	0.225
0.241	0.267	0.302	0.19
0.106	0.687	0.088	0.119
0.094	0.096	0.703	0.107
0.238	0.399	0.031	0.332
0.232	0.29	0.025	0.454
0.025	0.033	0.469	0.473
0.251	0.037	0.258	0.453
0.038	0.07	0.066	0.826
0.26	0.041	0.046	0.653
0.262	0.266	0.229	0.243
0.3	0.23	0.232	0.237

MOTIF	Limb_E14.5_H3K27me3_24_175_0.544_2.170082e-19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.146	0.571	0.143	0.14
0.146	0.158	0.553	0.143
0.604	0.166	0.121	0.109
0.142	0.608	0.188	0.062
0.138	0.551	0.157	0.154
0.124	0.135	0.618	0.123
0.609	0.09	0.171	0.13
0.668	0.121	0.161	0.05
0.593	0.108	0.147	0.152
0.12	0.109	0.147	0.624

MOTIF	Liver_E14.5_H3K4me2_35_166_0.586_3.703799e-252
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.672	0.102	0.099	0.127
0.113	0.101	0.125	0.661
0.077	0.1	0.077	0.746
0.089	0.122	0.117	0.672
0.095	0.724	0.086	0.095
0.097	0.09	0.726	0.087
0.09	0.105	0.699	0.106
0.118	0.101	0.089	0.692
0.102	0.696	0.093	0.109
0.083	0.1	0.71	0.107

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K9ac_20_160_0.671_1.248391e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.183	0.167	0.164	0.485
0.535	0.15	0.135	0.18
0.197	0.067	0.58	0.156
0.112	0.102	0.186	0.6
0.038	0.758	0.15	0.054
0.093	0.117	0.627	0.163
0.125	0.16	0.178	0.537
0.139	0.17	0.148	0.543
0.09	0.683	0.107	0.12
0.069	0.145	0.653	0.133

MOTIF	Heart_E15.5_H3K9ac_16_166_0.636_9.931084e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.141	0.517	0.132	0.21
0.112	0.244	0.459	0.185
0.003	0.872	0.049	0.076
0.021	0.125	0.797	0.057
0.629	0.093	0.112	0.166
0.463	0.112	0.094	0.332
0.445	0.34	0.075	0.14
0.167	0.075	0.592	0.166
0.464	0.148	0.112	0.276
0.414	0.139	0.171	0.277
0.212	0.158	0.268	0.362
0.152	0.324	0.301	0.223

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K9ac_18_157_0.606_1.182058e-301
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.574	0.13	0.148	0.148
0.575	0.132	0.139	0.154
0.146	0.118	0.138	0.598
0.117	0.176	0.135	0.572
0.124	0.662	0.081	0.133
0.122	0.131	0.594	0.153
0.155	0.17	0.156	0.519
0.104	0.159	0.129	0.608
0.138	0.628	0.077	0.157
0.095	0.119	0.672	0.114

MOTIF	Kidney_P0_H3K9ac_23_159_0.618_1.299145e-268
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.628	0.136	0.151	0.085
0.561	0.143	0.153	0.143
0.176	0.145	0.166	0.513
0.097	0.179	0.115	0.609
0.132	0.579	0.125	0.164
0.061	0.129	0.644	0.166
0.145	0.171	0.148	0.536
0.053	0.166	0.14	0.641
0.13	0.653	0.025	0.192
0.034	0.167	0.674	0.125

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K9ac_23_163_0.614_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.071	0.054	0.068	0.807
0.05	0.063	0.102	0.785
0.054	0.783	0.075	0.088
0.089	0.086	0.713	0.112
0.118	0.138	0.619	0.125
0.061	0.049	0.101	0.789
0.056	0.78	0.058	0.106
0.052	0.108	0.726	0.114

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K9ac_28_160_0.615_3.739651e-305
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.587	0.136	0.131	0.146
0.142	0.121	0.141	0.596
0.115	0.127	0.111	0.647
0.127	0.147	0.135	0.591
0.122	0.637	0.119	0.122
0.134	0.134	0.6	0.132
0.141	0.144	0.573	0.142
0.145	0.132	0.145	0.578
0.147	0.59	0.122	0.141
0.126	0.127	0.6	0.147