MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Intestine_E14.5_H3K4me3_71_169_0.582_9.95242e-123 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089 0.094 0.698 0.119 0.074 0.066 0.064 0.796 0.063 0.075 0.072 0.79 0.064 0.063 0.069 0.804 0.102 0.68 0.105 0.113 0.09 0.079 0.057 0.774 0.736 0.072 0.084 0.108 0.728 0.08 0.075 0.117 0.093 0.069 0.094 0.744 0.086 0.075 0.08 0.759 0.743 0.076 0.073 0.108 0.749 0.093 0.084 0.074 MOTIF Forebrain_E14.5_H3K4me3_70_169_0.574_1.593334e-79 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.205 0.423 0.193 0.179 0.144 0.132 0.098 0.626 0.115 0.128 0.122 0.635 0.149 0.077 0.128 0.646 0.146 0.137 0.548 0.169 0.155 0.128 0.127 0.59 0.61 0.124 0.114 0.152 0.609 0.118 0.126 0.147 0.138 0.107 0.129 0.626 0.144 0.124 0.126 0.606 0.607 0.127 0.122 0.144 0.469 0.185 0.167 0.179 MOTIF Heart_E13.5_H3K4me3_79_167_0.563_1.300459e-105 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.068 0.078 0.068 0.786 0.061 0.09 0.076 0.773 0.078 0.03 0.056 0.836 0.083 0.081 0.719 0.117 0.111 0.076 0.087 0.726 0.771 0.083 0.067 0.079 0.733 0.074 0.079 0.114 0.109 0.065 0.077 0.749 0.084 0.072 0.085 0.759 0.724 0.086 0.079 0.111 0.752 0.078 0.093 0.077 0.118 0.668 0.108 0.106 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me3_70_169_0.584_1.289875e-117 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.075 0.069 0.073 0.783 0.066 0.093 0.071 0.77 0.087 0.047 0.066 0.8 0.083 0.084 0.728 0.105 0.101 0.091 0.093 0.715 0.789 0.063 0.067 0.081 0.703 0.084 0.087 0.126 0.095 0.072 0.067 0.766 0.077 0.082 0.064 0.777 0.734 0.088 0.065 0.113 0.761 0.081 0.084 0.074 0.113 0.676 0.098 0.113 MOTIF Kidney_P0_H3K4me3_69_168_0.582_1.305313e-134 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.084 0.078 0.077 0.761 0.059 0.079 0.089 0.773 0.087 0.037 0.075 0.801 0.092 0.081 0.728 0.099 0.091 0.086 0.084 0.739 0.776 0.075 0.071 0.078 0.723 0.076 0.091 0.11 0.087 0.072 0.07 0.771 0.087 0.074 0.073 0.766 0.727 0.088 0.078 0.107 0.748 0.082 0.091 0.079 0.113 0.687 0.096 0.104 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me3_68_163_0.581_1.361761e-131 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.078 0.077 0.069 0.776 0.064 0.09 0.068 0.778 0.092 0.038 0.069 0.801 0.093 0.088 0.715 0.104 0.094 0.087 0.09 0.729 0.781 0.079 0.063 0.077 0.734 0.069 0.084 0.113 0.104 0.068 0.068 0.76 0.092 0.077 0.074 0.757 0.735 0.09 0.068 0.107 0.752 0.08 0.08 0.088 0.102 0.684 0.095 0.119 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me3_69_165_0.580_5.426445e-120 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089 0.07 0.07 0.771 0.063 0.086 0.071 0.78 0.085 0.037 0.066 0.812 0.084 0.091 0.716 0.109 0.097 0.092 0.095 0.716 0.773 0.077 0.071 0.079 0.743 0.072 0.078 0.107 0.088 0.065 0.076 0.771 0.087 0.073 0.076 0.764 0.722 0.098 0.07 0.11 0.744 0.082 0.095 0.079 0.104 0.688 0.106 0.102 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me3_68_169_0.573_3.459779e-130 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_67_171_0.577_8.476516e-155 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me3_66_167_0.570_2.650638e-117 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me3_76_160_0.568_1.305318e-119 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me3_76_168_0.572_2.503738e-128 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K9ac_57_166_0.560_3.543047e-81 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.067 0.063 0.077 0.793 0.848 0.047 0.069 0.036 0.859 0.021 0.025 0.095 0.097 0.055 0.044 0.804 0.048 0.055 0.038 0.859 0.872 0.048 0.044 0.036 0.034 0.843 0.087 0.036 0.936 0.02 0.008 0.036 0.899 0.023 0.046 0.032 0.903 0.025 0.046 0.026 0.117 0.639 0.135 0.109 0.072 0.07 0.746 0.112 MOTIF Heart_P0_H3K9ac_60_160_0.550_8.105566e-58 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.176 0.175 0.456 0.193 0.177 0.502 0.152 0.169 0.154 0.159 0.49 0.197 0.104 0.142 0.093 0.661 0.07 0.136 0.122 0.672 0.126 0.028 0.113 0.733 0.114 0.14 0.565 0.181 0.16 0.134 0.141 0.565 0.601 0.123 0.135 0.141 0.581 0.125 0.136 0.158 0.158 0.128 0.132 0.582 0.157 0.168 0.162 0.513 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K9ac_47_163_0.568_6.806194e-111 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Limb_E13.5_H3K9ac_56_163_0.551_4.316335e-83 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7