MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K27ac_13_158_0.557_1.183069e-128 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.781 0.085 0.073 0.061 0.715 0.082 0.091 0.112 0.672 0.088 0.107 0.133 0.101 0.162 0.098 0.639 0.114 0.088 0.718 0.08 0.103 0.697 0.094 0.106 0.117 0.102 0.665 0.116 0.706 0.093 0.097 0.104 0.128 0.102 0.095 0.675 0.102 0.091 0.12 0.687 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K27ac_15_165_0.560_3.855673e-137 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.824 0.028 0.073 0.075 0.82 0.055 0.078 0.047 0.819 0.069 0.051 0.061 0.094 0.058 0.064 0.784 0.072 0.07 0.805 0.053 0.109 0.766 0.037 0.088 0.074 0.082 0.777 0.067 0.798 0.067 0.072 0.063 0.077 0.067 0.063 0.793 0.043 0.061 0.083 0.813 MOTIF Intestine_E15.5_H3K27ac_2_166_0.565_2.964132e-166 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.254 0.239 0.256 0.251 0.569 0.132 0.152 0.147 0.59 0.129 0.151 0.13 0.55 0.158 0.145 0.147 0.158 0.547 0.155 0.14 0.137 0.16 0.56 0.143 0.146 0.574 0.154 0.126 0.155 0.143 0.568 0.134 0.525 0.171 0.164 0.14 0.264 0.253 0.253 0.23 MOTIF Limb_E14.5_H3K27ac_2_161_0.578_2.037806e-193 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.401 0.222 0.184 0.193 0.601 0.143 0.146 0.11 0.17 0.521 0.141 0.168 0.107 0.195 0.592 0.106 0.156 0.514 0.18 0.15 0.241 0.118 0.488 0.153 0.519 0.173 0.197 0.111 0.364 0.276 0.167 0.193 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K27ac_1_161_0.589_5.136503e-124 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.528 0.142 0.175 0.155 0.527 0.16 0.142 0.171 0.073 0.17 0.17 0.587 0.131 0.6 0.139 0.13 0.104 0.152 0.659 0.085 0.124 0.633 0.139 0.104 0.089 0.127 0.634 0.15 0.056 0.106 0.163 0.675 0.079 0.155 0.144 0.622 0.164 0.164 0.139 0.533 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K27ac_2_156_0.581_4.79917e-218 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.583 0.148 0.132 0.137 0.562 0.134 0.141 0.163 0.05 0.143 0.143 0.664 0.134 0.574 0.142 0.15 0.127 0.156 0.59 0.127 0.107 0.63 0.133 0.13 0.152 0.135 0.56 0.153 0.052 0.153 0.122 0.673 0.119 0.152 0.136 0.593 0.141 0.159 0.129 0.571 MOTIF Heart_E12.5_H3K27me3_32_154_0.509_4.183455e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.715 0.197 0.039 0.049 0.901 0.04 0.054 0.005 0.9 0.035 0.035 0.03 0.063 0.005 0.015 0.917 0.018 0.082 0.878 0.022 0.324 0.479 0.154 0.043 0.022 0.271 0.505 0.202 0.812 0.034 0.02 0.134 0.034 0.03 0.093 0.843 0.031 0.021 0.033 0.915 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_9_162_0.542_2.814819e-95 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.179 0.001 0.737 0.083 0.153 0.059 0.664 0.124 0.783 0.029 0.137 0.051 0.908 0.032 0.057 0.003 0.765 0.007 0.02 0.208 0.115 0.17 0.026 0.689 0.11 0.129 0.087 0.674 0.103 0.584 0.2 0.113 0.151 0.718 0.001 0.13 0.563 0.193 0.001 0.243 0.142 0.164 0.17 0.524 0.132 0.169 0.169 0.53 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_10_163_0.543_2.190417e-172 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.732 0.052 0.146 0.07 0.842 0.045 0.064 0.049 0.824 0.058 0.053 0.065 0.162 0.061 0.137 0.64 0.062 0.151 0.669 0.118 0.237 0.49 0.119 0.153 0.236 0.31 0.339 0.115 0.534 0.197 0.151 0.118 0.147 0.18 0.095 0.578 0.075 0.146 0.19 0.589 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me1_20_159_0.540_1.541122e-112 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.651 0.081 0.165 0.103 0.795 0.068 0.094 0.043 0.561 0.17 0.129 0.14 0.201 0.042 0.107 0.65 0.107 0.203 0.472 0.218 0.305 0.274 0.151 0.27 0.221 0.494 0.206 0.079 0.682 0.133 0.06 0.125 0.109 0.121 0.088 0.682 0.046 0.077 0.04 0.837 0.155 0.108 0.13 0.607 0.108 0.46 0.187 0.245 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me1_29_165_0.530_1.410204e-55 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.095 0.111 0.696 0.098 0.783 0.065 0.088 0.064 0.809 0.062 0.08 0.049 0.752 0.072 0.084 0.092 0.108 0.054 0.108 0.73 0.093 0.057 0.725 0.125 0.106 0.106 0.683 0.105 0.093 0.739 0.087 0.081 0.762 0.088 0.042 0.108 0.08 0.078 0.078 0.764 0.058 0.079 0.079 0.784 0.075 0.084 0.07 0.771 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_17_164_0.538_7.649162e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.554 0.068 0.216 0.162 0.722 0.056 0.221 0.001 0.583 0.123 0.215 0.079 0.231 0.001 0.208 0.56 0.128 0.001 0.692 0.179 0.2 0.213 0.447 0.141 0.097 0.702 0.154 0.047 0.551 0.116 0.001 0.332 0.071 0.2 0.231 0.498 0.05 0.123 0.071 0.756 0.06 0.127 0.188 0.625 0.166 0.253 0.168 0.414 MOTIF Limb_E13.5_H3K27me3_12_156_0.519_5.836342e-24 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.748 0.082 0.087 0.083 0.777 0.071 0.078 0.074 0.755 0.076 0.085 0.084 0.09 0.044 0.097 0.769 0.088 0.091 0.734 0.087 0.738 0.077 0.083 0.102 0.081 0.722 0.099 0.098 0.776 0.087 0.05 0.087 0.078 0.083 0.086 0.753 0.086 0.097 0.068 0.749 0.077 0.081 0.083 0.759 0.09 0.719 0.09 0.101 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me2_64_169_0.563_8.543207e-126 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.524 0.15 0.159 0.167 0.647 0.134 0.127 0.092 0.582 0.125 0.13 0.163 0.151 0.135 0.146 0.568 0.193 0.452 0.156 0.199 0.213 0.156 0.452 0.18 0.159 0.565 0.145 0.131 0.624 0.151 0.053 0.172 0.12 0.127 0.127 0.626 0.051 0.159 0.075 0.715 0.076 0.149 0.1 0.675 0.175 0.453 0.167 0.204 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me2_65_171_0.571_2.068903e-141 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.597 0.152 0.015 0.236 0.76 0.049 0.183 0.008 0.427 0.196 0.06 0.316 0.149 0.01 0.07 0.771 0.176 0.089 0.423 0.312 0.108 0.666 0.222 0.004 0.365 0.172 0.335 0.128 0.804 0.006 0.126 0.064 0.269 0.175 0.167 0.389 0.007 0.195 0.042 0.756 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_63_162_0.551_9.924817e-73 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.156 0.12 0.609 0.115 0.852 0.058 0.029 0.061 0.923 0.02 0.047 0.01 0.752 0.068 0.092 0.088 0.085 0.003 0.082 0.83 0.113 0.155 0.609 0.123 0.647 0.099 0.09 0.164 0.185 0.57 0.116 0.129 0.756 0.076 0.007 0.161 0.083 0.075 0.07 0.772 0.012 0.076 0.027 0.885 0.105 0.074 0.024 0.797