MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me2_60_169_0.563_8.477997e-90 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.787 0.113 0.009 0.091 0.745 0.035 0.091 0.129 0.164 0.01 0.083 0.743 0.087 0.115 0.141 0.657 0.728 0.001 0.1 0.171 0.142 0.091 0.704 0.063 0.081 0.772 0.082 0.065 0.872 0.001 0.001 0.126 0.113 0.11 0.571 0.206 0.108 0.147 0.009 0.736 0.006 0.129 0.01 0.855 0.087 0.094 0.091 0.728 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me2_60_161_0.559_1.601897e-101 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Intestine_E15.5_H3K4me2_77_170_0.542_3.506601e-56 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.773 0.077 0.058 0.092 0.676 0.095 0.116 0.113 0.084 0.06 0.091 0.765 0.048 0.687 0.049 0.216 0.09 0.102 0.102 0.706 0.069 0.086 0.784 0.061 0.116 0.734 0.078 0.072 0.658 0.145 0.114 0.083 0.067 0.13 0.695 0.108 0.1 0.051 0.102 0.747 0.089 0.067 0.08 0.764 0.06 0.055 0.064 0.821 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_77_175_0.539_1.209198e-19 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.546 0.165 0.128 0.161 0.624 0.126 0.126 0.124 0.167 0.134 0.086 0.613 0.114 0.138 0.13 0.618 0.15 0.158 0.117 0.575 0.548 0.102 0.162 0.188 0.172 0.575 0.137 0.116 0.666 0.106 0.041 0.187 0.107 0.142 0.609 0.142 0.103 0.717 0.086 0.094 0.153 0.249 0.32 0.279 0.177 0.079 0.138 0.606 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_68_172_0.574_2.660547e-86 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.645 0.095 0.135 0.125 0.435 0.139 0.243 0.183 0.187 0.125 0.463 0.225 0.056 0.775 0.052 0.117 0.116 0.003 0.002 0.879 0.022 0.076 0.692 0.21 0.176 0.151 0.11 0.563 0.657 0.096 0.088 0.159 0.942 0.012 0.039 0.007 0.704 0.061 0.046 0.189 0.154 0.061 0.079 0.706 0.144 0.059 0.082 0.715 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me3_67_164_0.572_1.257272e-79 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.775 0.081 0.08 0.064 0.776 0.064 0.094 0.066 0.101 0.706 0.098 0.095 0.087 0.063 0.055 0.795 0.071 0.083 0.759 0.087 0.119 0.701 0.079 0.101 0.76 0.083 0.063 0.094 0.678 0.076 0.129 0.117 0.114 0.094 0.105 0.687 0.067 0.07 0.073 0.79 0.066 0.069 0.063 0.802 0.083 0.075 0.071 0.771 MOTIF Forebrain_E13.5_H3K4me3_72_168_0.579_1.786868e-111 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.737 0.082 0.046 0.135 0.638 0.093 0.136 0.133 0.119 0.073 0.097 0.711 0.092 0.094 0.054 0.76 0.092 0.001 0.043 0.864 0.134 0.09 0.613 0.163 0.121 0.65 0.093 0.136 0.887 0.001 0.001 0.111 0.083 0.127 0.658 0.132 0.041 0.102 0.056 0.801 0.02 0.063 0.052 0.865 0.11 0.029 0.044 0.817 MOTIF Heart_E12.5_H3K4me3_65_162_0.575_2.267423e-112 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.876 0.066 0.015 0.043 0.951 0.003 0.034 0.012 0.882 0.058 0.055 0.005 0.099 0.717 0.053 0.131 0.202 0.004 0.001 0.793 0.146 0.123 0.651 0.08 0.259 0.493 0.116 0.133 0.679 0.073 0.006 0.242 0.789 0.106 0.08 0.025 0.597 0.155 0.096 0.152 0.066 0.146 0.074 0.714 0.151 0.144 0.095 0.61 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me3_82_173_0.572_3.875234e-102 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me3_75_162_0.567_8.99996e-110 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me3_70_162_0.572_4.916243e-109 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.738 0.081 0.085 0.096 0.708 0.093 0.1 0.099 0.108 0.075 0.069 0.748 0.073 0.089 0.068 0.77 0.104 0.049 0.074 0.773 0.105 0.092 0.693 0.11 0.093 0.741 0.072 0.094 0.804 0.05 0.054 0.092 0.081 0.092 0.686 0.141 0.057 0.084 0.065 0.794 0.062 0.078 0.066 0.794 0.095 0.074 0.078 0.753 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me3_87_167_0.568_2.969556e-110 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.732 0.097 0.08 0.091 0.712 0.094 0.104 0.09 0.099 0.081 0.088 0.732 0.07 0.086 0.079 0.765 0.083 0.046 0.073 0.798 0.111 0.088 0.691 0.11 0.097 0.697 0.088 0.118 0.808 0.05 0.046 0.096 0.08 0.084 0.721 0.115 0.062 0.077 0.068 0.793 0.063 0.076 0.069 0.792 0.087 0.075 0.079 0.759 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me3_76_166_0.567_4.73748e-94 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.745 0.081 0.083 0.091 0.71 0.09 0.096 0.104 0.087 0.083 0.088 0.742 0.074 0.082 0.074 0.77 0.093 0.053 0.076 0.778 0.093 0.09 0.711 0.106 0.093 0.726 0.089 0.092 0.8 0.053 0.055 0.092 0.08 0.1 0.718 0.102 0.068 0.089 0.076 0.767 0.069 0.084 0.069 0.778 0.084 0.079 0.08 0.757 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K4me3_69_164_0.565_7.248307e-98 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.758 0.074 0.077 0.091 0.79 0.07 0.082 0.058 0.761 0.083 0.08 0.076 0.114 0.718 0.088 0.08 0.094 0.05 0.05 0.806 0.094 0.074 0.733 0.099 0.112 0.72 0.085 0.083 0.793 0.07 0.049 0.088 0.744 0.08 0.097 0.079 0.725 0.091 0.087 0.097 0.097 0.108 0.093 0.702 0.094 0.071 0.083 0.752 MOTIF Lung_E14.5_H3K9ac_57_166_0.554_1.416055e-79 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K9ac_27_171_0.607_1.03305e-252 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.201 0.267 0.197 0.336 0.285 0.145 0.238 0.331 0.634 0.123 0.192 0.051 0.006 0.798 0.052 0.144 0.053 0.33 0.448 0.169 0.098 0.052 0.844 0.006 0.1 0.656 0.052 0.192 0.402 0.098 0.377 0.123 0.66 0.098 0.098 0.144 0.705 0.052 0.052 0.191 0.193 0.263 0.193 0.351 0.174 0.29 0.197 0.339