MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Heart_E14.5_H3K9ac_60_167_0.533_9.768931e-37 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.768 0.069 0.093 0.07 0.771 0.089 0.077 0.063 0.74 0.081 0.108 0.071 0.099 0.731 0.074 0.096 0.775 0.06 0.046 0.119 0.083 0.102 0.727 0.088 0.098 0.097 0.088 0.717 0.066 0.096 0.062 0.776 0.05 0.075 0.063 0.812 0.056 0.104 0.086 0.754 0.079 0.719 0.093 0.109 0.131 0.711 0.044 0.114 MOTIF Limb_E13.5_H3K9ac_73_174_0.527_1.040652e-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.669 0.114 0.115 0.102 0.66 0.11 0.13 0.1 0.126 0.689 0.11 0.075 0.758 0.057 0.069 0.116 0.099 0.112 0.71 0.079 0.65 0.129 0.113 0.108 0.124 0.113 0.113 0.65 0.08 0.121 0.094 0.705 0.077 0.124 0.106 0.693 0.088 0.705 0.103 0.104 0.176 0.564 0.077 0.183 0.147 0.148 0.545 0.16 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me2_67_173_0.548_6.06145e-59 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.414 0.163 0.293 0.13 0.894 0.077 0.028 0.001 0.832 0.005 0.152 0.011 0.375 0.162 0.22 0.243 0.296 0.155 0.323 0.227 0.067 0.866 0.032 0.035 0.202 0.001 0.001 0.796 0.136 0.099 0.749 0.016 0.538 0.193 0.038 0.231 0.141 0.029 0.061 0.769 0.008 0.001 0.001 0.99 0.182 0.155 0.142 0.521 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K4me2_70_165_0.555_2.866121e-68 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.864 0.031 0.085 0.02 0.849 0.045 0.088 0.018 0.869 0.011 0.03 0.09 0.12 0.075 0.686 0.119 0.036 0.831 0.041 0.092 0.803 0.025 0.036 0.136 0.066 0.039 0.846 0.049 0.056 0.065 0.038 0.841 0.008 0.025 0.011 0.956 0.003 0.022 0.003 0.972 0.012 0.096 0.115 0.777 0.111 0.709 0.048 0.132 MOTIF Intestine_E15.5_H3K4me2_81_172_0.538_8.466645e-40 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.756 0.05 0.101 0.093 0.9 0.012 0.087 0.001 0.785 0.001 0.142 0.072 0.153 0.115 0.636 0.096 0.04 0.738 0.137 0.085 0.836 0.001 0.001 0.162 0.106 0.107 0.65 0.137 0.089 0.138 0.056 0.717 0.038 0.093 0.064 0.805 0.019 0.121 0.069 0.791 0.136 0.035 0.079 0.75 0.115 0.147 0.564 0.174 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me3_77_160_0.566_2.408833e-96 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.748 0.074 0.088 0.09 0.789 0.066 0.08 0.065 0.717 0.096 0.099 0.088 0.107 0.066 0.089 0.738 0.086 0.088 0.73 0.096 0.103 0.719 0.086 0.092 0.771 0.069 0.071 0.089 0.099 0.081 0.711 0.109 0.082 0.076 0.077 0.765 0.079 0.07 0.077 0.774 0.058 0.075 0.078 0.789 0.082 0.088 0.082 0.748 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me3_89_169_0.537_7.804034e-46 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.148 0.117 0.615 0.12 0.671 0.11 0.121 0.098 0.718 0.089 0.102 0.091 0.704 0.094 0.105 0.097 0.657 0.1 0.125 0.118 0.131 0.626 0.117 0.126 0.133 0.095 0.092 0.68 0.121 0.112 0.635 0.132 0.124 0.627 0.108 0.141 0.121 0.101 0.085 0.693 0.095 0.107 0.107 0.691 0.11 0.114 0.094 0.682 MOTIF Midbrain_E16.5_H3K4me3_72_168_0.544_3.271665e-48 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.119 0.09 0.7 0.091 0.756 0.076 0.09 0.078 0.793 0.053 0.076 0.078 0.785 0.067 0.074 0.074 0.746 0.08 0.08 0.094 0.107 0.709 0.092 0.092 0.1 0.058 0.065 0.777 0.08 0.074 0.755 0.091 0.107 0.699 0.082 0.112 0.108 0.091 0.051 0.75 0.069 0.088 0.071 0.772 0.081 0.086 0.069 0.764 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me3_77_172_0.541_6.31193e-55 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.755 0.082 0.087 0.076 0.76 0.079 0.089 0.072 0.754 0.059 0.092 0.095 0.107 0.077 0.718 0.098 0.094 0.737 0.08 0.089 0.771 0.072 0.067 0.09 0.089 0.093 0.726 0.092 0.094 0.09 0.087 0.729 0.077 0.076 0.067 0.78 0.072 0.075 0.06 0.793 0.072 0.087 0.075 0.766 0.084 0.71 0.092 0.114 MOTIF Kidney_P0_H3K27ac_21_163_0.544_2.775023e-59 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.582 0.155 0.136 0.127 0.711 0.001 0.247 0.041 0.297 0.001 0.549 0.153 0.199 0.277 0.378 0.145 0.078 0.711 0.005 0.206 0.263 0.001 0.001 0.735 0.079 0.103 0.739 0.079 0.061 0.258 0.037 0.644 0.001 0.043 0.09 0.866 0.001 0.005 0.001 0.993 0.099 0.091 0.212 0.598 0.138 0.421 0.161 0.28 MOTIF Heart_E12.5_H3K9ac_63_170_0.534_4.919743e-42 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.125 0.037 0.099 0.739 0.093 0.089 0.741 0.077 0.741 0.088 0.094 0.077 0.786 0.069 0.081 0.064 0.769 0.075 0.1 0.056 0.721 0.076 0.111 0.092 0.111 0.726 0.096 0.067 0.119 0.044 0.049 0.788 0.064 0.089 0.762 0.085 0.086 0.708 0.079 0.127 0.082 0.101 0.047 0.77 0.064 0.091 0.095 0.75 MOTIF Heart_E16.5_H3K9ac_51_163_0.547_4.27453e-62 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.921 0.008 0.035 0.036 0.633 0.081 0.228 0.058 0.536 0.001 0.221 0.242 0.241 0.15 0.537 0.072 0.064 0.752 0.023 0.161 0.553 0.001 0.001 0.445 0.099 0.262 0.606 0.033 0.157 0.292 0.058 0.492 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.048 0.002 0.949 0.015 0.199 0.188 0.598 0.204 0.425 0.131 0.24 MOTIF Stomach_E16.5_H3K9ac_61_172_0.545_1.048004e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.106 0.103 0.709 0.082 0.752 0.08 0.103 0.065 0.743 0.094 0.105 0.058 0.774 0.037 0.111 0.078 0.095 0.074 0.726 0.105 0.073 0.763 0.077 0.087 0.104 0.053 0.05 0.793 0.075 0.082 0.751 0.092 0.086 0.099 0.085 0.73 0.066 0.081 0.095 0.758 0.063 0.098 0.067 0.772 0.084 0.094 0.092 0.73 MOTIF Lung_E14.5_H3K9ac_68_168_0.540_3.673437e-49 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.103 0.095 0.114 0.688 0.771 0.068 0.076 0.085 0.786 0.069 0.075 0.07 0.754 0.085 0.079 0.082 0.12 0.67 0.111 0.099 0.107 0.756 0.057 0.08 0.799 0.06 0.039 0.102 0.091 0.093 0.729 0.087 0.092 0.085 0.088 0.735 0.069 0.084 0.079 0.768 0.065 0.086 0.072 0.777 0.066 0.086 0.081 0.767 MOTIF Liver_E13.5_H3K9ac_61_162_0.534_1.010222e-37 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.107 0.09 0.714 0.089 0.756 0.072 0.091 0.081 0.782 0.062 0.081 0.075 0.793 0.078 0.072 0.057 0.744 0.08 0.095 0.081 0.088 0.715 0.107 0.09 0.105 0.102 0.057 0.736 0.745 0.059 0.087 0.109 0.09 0.099 0.702 0.109 0.072 0.079 0.082 0.767 0.074 0.074 0.079 0.773 0.085 0.078 0.064 0.773 MOTIF Stomach_P0_H3K9ac_71_172_0.543_2.858386e-62 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.132 0.107 0.141 0.62 0.676 0.094 0.091 0.139 0.743 0.088 0.086 0.083 0.721 0.083 0.095 0.101 0.099 0.712 0.103 0.086 0.103 0.104 0.09 0.703 0.71 0.109 0.085 0.096 0.089 0.104 0.706 0.101 0.095 0.098 0.092 0.715 0.109 0.101 0.094 0.696