MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me1_9_167_0.541_8.295652e-75
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.635	0.105	0.122	0.138
0.601	0.133	0.133	0.133
0.157	0.114	0.134	0.595
0.16	0.136	0.571	0.133
0.622	0.142	0.119	0.117
0.62	0.123	0.136	0.121
0.157	0.568	0.134	0.141
0.145	0.136	0.574	0.145
0.115	0.142	0.625	0.118
0.132	0.59	0.142	0.136

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me1_6_160_0.556_9.418992e-256
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044	0.071	0.848	0.037
0.034	0.78	0.129	0.057
0.419	0.182	0.222	0.177
0.638	0.08	0.036	0.246
0.106	0.04	0.044	0.81
0.025	0.02	0.082	0.873
0.223	0.5	0.122	0.155
0.756	0.041	0.034	0.169
0.092	0.032	0.044	0.832
0.036	0.019	0.015	0.93

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me1_7_160_0.551_4.001898e-132
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.819	0.008	0.074	0.099
0.747	0.056	0.148	0.049
0.113	0.042	0.178	0.667
0.294	0.108	0.437	0.161
0.877	0.09	0.025	0.008
0.788	0.018	0.053	0.141
0.122	0.113	0.188	0.577
0.113	0.714	0.052	0.121
0.097	0.147	0.727	0.029
0.045	0.659	0.177	0.119

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me1_7_159_0.545_2.062994e-107
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.755	0.075	0.087	0.083
0.716	0.089	0.086	0.109
0.106	0.079	0.086	0.729
0.136	0.114	0.636	0.114
0.75	0.101	0.074	0.075
0.73	0.089	0.086	0.095
0.145	0.092	0.103	0.66
0.106	0.627	0.116	0.151
0.1	0.114	0.689	0.097
0.08	0.709	0.1	0.111

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me1_10_163_0.547_1.947006e-147
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.739	0.08	0.088	0.093
0.722	0.087	0.09	0.101
0.097	0.079	0.091	0.733
0.154	0.106	0.635	0.105
0.734	0.111	0.079	0.076
0.722	0.095	0.08	0.103
0.147	0.103	0.102	0.648
0.109	0.66	0.111	0.12
0.106	0.108	0.695	0.091
0.081	0.713	0.102	0.104

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K4me1_10_162_0.546_1.945461e-119
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.715	0.077	0.095	0.113
0.687	0.097	0.106	0.11
0.126	0.08	0.092	0.702
0.133	0.112	0.627	0.128
0.742	0.104	0.073	0.081
0.722	0.084	0.09	0.104
0.125	0.101	0.105	0.669
0.114	0.66	0.107	0.119
0.085	0.1	0.741	0.074
0.08	0.735	0.091	0.094

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me1_10_169_0.536_2.124093e-93
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.726	0.093	0.089	0.092
0.709	0.091	0.09	0.11
0.102	0.1	0.09	0.708
0.11	0.089	0.095	0.706
0.729	0.102	0.077	0.092
0.696	0.107	0.089	0.108
0.117	0.099	0.126	0.658
0.112	0.662	0.089	0.137
0.116	0.103	0.674	0.107
0.076	0.732	0.088	0.104

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me1_11_170_0.537_4.376914e-72
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.708	0.09	0.105	0.097
0.716	0.093	0.099	0.092
0.123	0.085	0.09	0.702
0.114	0.089	0.1	0.697
0.744	0.093	0.074	0.089
0.711	0.113	0.088	0.088
0.122	0.117	0.116	0.645
0.099	0.672	0.099	0.13
0.115	0.11	0.677	0.098
0.077	0.725	0.1	0.098

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me2_77_168_0.544_6.356169e-77
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.127	0.076	0.705	0.092
0.1	0.697	0.111	0.092
0.772	0.086	0.047	0.095
0.707	0.086	0.092	0.115
0.101	0.069	0.081	0.749
0.073	0.076	0.079	0.772
0.083	0.738	0.086	0.093
0.753	0.104	0.033	0.11
0.074	0.07	0.078	0.778
0.04	0.074	0.049	0.837
0.057	0.086	0.05	0.807
0.098	0.685	0.1	0.117

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me2_66_168_0.541_1.835986e-84
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.112	0.087	0.713	0.088
0.792	0.064	0.081	0.063
0.819	0.055	0.078	0.048
0.77	0.082	0.075	0.073
0.1	0.038	0.115	0.747
0.09	0.09	0.732	0.088
0.768	0.072	0.079	0.081
0.734	0.078	0.077	0.111
0.117	0.081	0.088	0.714
0.085	0.043	0.087	0.785
0.083	0.107	0.708	0.102
0.087	0.717	0.084	0.112

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K27ac_20_158_0.546_6.892598e-77
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.134	0.033	0.695	0.138
0.139	0.117	0.659	0.085
0.582	0.157	0.13	0.131
0.121	0.068	0.078	0.733
0.005	0.052	0.011	0.932
0.014	0.079	0.102	0.805
0.114	0.639	0.134	0.113
0.167	0.723	0.006	0.104
0.055	0.07	0.001	0.874
0.016	0.081	0.079	0.824
0.03	0.131	0.046	0.793
0.071	0.742	0.078	0.109

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K27ac_31_168_0.541_5.358468e-58
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.05	0.745	0.105
0.1	0.103	0.711	0.086
0.706	0.099	0.085	0.11
0.112	0.088	0.079	0.721
0.066	0.078	0.063	0.793
0.08	0.081	0.083	0.756
0.095	0.714	0.092	0.099
0.733	0.127	0.047	0.093
0.064	0.071	0.069	0.796
0.053	0.071	0.068	0.808
0.077	0.077	0.065	0.781
0.077	0.735	0.081	0.107

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K27ac_26_161_0.546_1.078963e-79
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.06	0.042	0.831	0.067
0.093	0.806	0.066	0.035
0.81	0.076	0.034	0.08
0.059	0.056	0.046	0.839
0.036	0.078	0.041	0.845
0.044	0.044	0.072	0.84
0.051	0.831	0.052	0.066
0.831	0.079	0.021	0.069
0.039	0.063	0.063	0.835
0.041	0.053	0.034	0.872
0.043	0.047	0.04	0.87
0.052	0.79	0.056	0.102

MOTIF	Hindbrain_E13.5_H3K27ac_18_160_0.549_5.070403e-130
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K27ac_34_166_0.542_2.336596e-90
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1

MOTIF	Midbrain_E13.5_H3K9ac_61_165_0.547_7.712278e-50
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.101	0.073	0.74	0.086
0.811	0.057	0.079	0.053
0.833	0.048	0.076	0.043
0.799	0.066	0.083	0.052
0.102	0.047	0.123	0.728
0.088	0.076	0.767	0.069
0.795	0.073	0.077	0.055
0.799	0.07	0.085	0.046
0.779	0.063	0.091	0.067
0.169	0.577	0.138	0.116
0.119	0.115	0.652	0.114
0.096	0.722	0.103	0.079