MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Lung_E14.5_H3K27me3_17_40_0.561_4.81249e-58
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.880528	0.082783	0.036689
0.0	0.956774	0.043226	0.0
0.236984	0.0	0.763016	0.0
0.00746	0.978013	0.014527	0.0
0.090568	0.747757	0.161675	0.0
0.007517	0.0	0.942573	0.04991
0.100365	0.066404	0.418221	0.41501
0.0	0.007993	0.992007	0.0
0.874244	0.087118	0.0	0.038639

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_30_49_0.613_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.091128	0.846347	0.062525	0.0
0.157051	0.767205	0.06905	0.006695
0.101778	0.0	0.81892	0.079302
0.0	0.98618	0.011234	0.002587
0.047488	0.703897	0.080881	0.167734
0.016271	0.027254	0.903294	0.053181
0.023947	0.013744	0.829844	0.132465
0.272133	0.0	0.727867	0.0
0.772063	0.031	0.030727	0.16621

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me2_61_51_0.563_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.203521	0.750787	0.020582	0.02511
0.06422	0.824397	0.045322	0.066061
0.251979	0.033994	0.658202	0.055824
0.041525	0.867074	0.091401	0.0
0.239962	0.544087	0.057467	0.158485
0.014993	0.0275	0.957507	0.0
0.020455	0.015206	0.929038	0.035301
0.027771	0.014765	0.946746	0.010718
0.753255	0.018904	0.082297	0.145544

MOTIF	Lung_P0_H3K4me2_50_41_0.576_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036974	0.865567	0.015886	0.081573
0.107083	0.798126	0.057487	0.037303
0.180054	0.001793	0.708234	0.109919
0.0	0.966583	0.025751	0.007666
0.125492	0.643682	0.039997	0.190829
0.039844	0.032494	0.818959	0.108702
0.110348	0.035238	0.816527	0.037887
0.0	0.03037	0.954625	0.015005
0.718395	0.082958	0.038243	0.160404

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_61_52_0.556_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.093576	0.717393	0.07488	0.114152
0.213683	0.034714	0.678576	0.073027
0.033888	0.929127	0.027461	0.009524
0.173662	0.735791	0.061631	0.028916
0.178399	0.022012	0.799588	0.0
0.020443	0.04228	0.813968	0.123309
0.11156	0.023113	0.850605	0.014722
0.910099	0.02325	0.036835	0.029817
0.036845	0.950745	0.0	0.012411

MOTIF	Heart_P0_H3K4me2_40_44_0.597_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.080676	0.833645	0.047092	0.038587
0.264156	0.022474	0.672663	0.040707
0.029824	0.901699	0.056714	0.011764
0.048392	0.887895	0.020548	0.043165
0.050665	0.016547	0.877978	0.05481
0.14717	0.046738	0.71403	0.092062
0.026755	0.005402	0.967843	0.0
0.966098	0.011049	0.0	0.022853
0.303006	0.056989	0.503389	0.136616

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me2_46_29_0.583_1.99716e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.117416	0.036171	0.797987	0.048426
0.010317	0.875362	0.044942	0.069379
0.064358	0.780583	0.104781	0.050277
0.025062	0.046098	0.886972	0.041868
0.125665	0.015784	0.822571	0.035979
0.149285	0.010701	0.837799	0.002215
0.796472	0.044238	0.016789	0.142502
0.184612	0.154434	0.640732	0.020221
0.049958	0.874099	0.029034	0.046909
0.382224	0.274669	0.211677	0.13143

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K27ac_11_172_0.562_7.469178e-213
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.129	0.138	0.148	0.585
0.125	0.593	0.122	0.16
0.117	0.138	0.142	0.603
0.107	0.6	0.158	0.135
0.127	0.591	0.14	0.142
0.127	0.608	0.141	0.124
0.125	0.147	0.597	0.131
0.12	0.152	0.607	0.121
0.134	0.619	0.129	0.118
0.138	0.128	0.596	0.138

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K27ac_30_168_0.546_1.167675e-133
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.066	0.057	0.064	0.813
0.036	0.864	0.049	0.051
0.064	0.061	0.04	0.835
0.047	0.835	0.066	0.052
0.073	0.818	0.047	0.062
0.037	0.839	0.068	0.056
0.116	0.065	0.695	0.124
0.045	0.05	0.842	0.063
0.091	0.732	0.088	0.089
0.121	0.077	0.727	0.075

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me3_19_16_0.714_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.140683	0.081501	0.226442	0.551374
0.007226	0.968404	0.015094	0.009276
0.018099	0.874219	0.065891	0.041792
0.029423	0.022821	0.923841	0.023915
0.14363	0.008756	0.777504	0.070111
0.194188	0.029827	0.770076	0.005909
0.717607	0.052049	0.019382	0.210962
0.187432	0.058728	0.636688	0.117152
0.063121	0.83426	0.038207	0.064412
0.029728	0.017422	0.889786	0.063064

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me3_24_24_0.656_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.03737	0.833774	0.041681	0.087175
0.030784	0.728696	0.083323	0.157197
0.092745	0.068664	0.801116	0.037475
0.123717	0.082754	0.714802	0.078727
0.024476	0.078881	0.879257	0.017386
0.853698	0.04925	0.064055	0.032998
0.1676	0.059958	0.758358	0.014083
0.040336	0.885276	0.061672	0.012716
0.023334	0.041628	0.800645	0.134392

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me3_13_14_0.683_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036708	0.839666	0.073459	0.050167
0.054829	0.820298	0.049759	0.075114
0.049867	0.035285	0.838769	0.07608
0.069739	0.066595	0.818429	0.045238
0.127958	0.053385	0.79242	0.026237
0.783058	0.05019	0.080367	0.086386
0.096367	0.100958	0.724455	0.07822
0.128729	0.776904	0.026343	0.068025
0.023734	0.049015	0.820247	0.107004

MOTIF	Lung_E14.5_H3K4me3_45_40_0.634_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.195928	0.623386	0.038088	0.142598
0.11594	0.063525	0.660176	0.160359
0.017383	0.960884	0.021733	0.0
0.044122	0.732711	0.014025	0.209142
0.041675	0.052197	0.841106	0.065022
0.122327	0.009221	0.857371	0.011081
0.150946	0.033938	0.815117	0.0
0.890042	0.072097	0.012391	0.02547
0.052528	0.086078	0.846367	0.015027

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me3_44_35_0.638_1.077308e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.098684	0.116164	0.670722	0.11443
0.005584	0.952108	0.036212	0.006096
0.064198	0.833362	0.063357	0.039083
0.075244	0.053874	0.827412	0.043469
0.102833	0.018622	0.846935	0.03161
0.109332	0.009283	0.868752	0.012634
0.844653	0.047602	0.048293	0.059452
0.117218	0.078275	0.74334	0.061168
0.139779	0.67266	0.089513	0.098048

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K4me3_59_51_0.602_6.396243e-285
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.138178	0.059679	0.629273	0.172871
0.005585	0.93872	0.04408	0.011615
0.111342	0.775033	0.065232	0.048393
0.10931	0.044828	0.772206	0.073655
0.111985	0.012624	0.866314	0.009077
0.047007	0.014123	0.937654	0.001217
0.887335	0.014688	0.004789	0.093188
0.131683	0.051185	0.750509	0.066623
0.160894	0.660836	0.089004	0.089266

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me3_40_24_0.648_4.955829e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.233258	0.685269	0.053211	0.028262
0.150418	0.354476	0.270022	0.225083
0.137486	0.077944	0.637525	0.147045
0.038816	0.864328	0.043083	0.053773
0.040003	0.871273	0.040637	0.048087
0.028942	0.036822	0.903814	0.030422
0.104559	0.022105	0.860055	0.013282
0.111805	0.031034	0.852053	0.005108
0.816579	0.023803	0.035446	0.124172
0.122372	0.137724	0.698803	0.041101
0.149545	0.765391	0.074539	0.010525