MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K9me3_119_6_0.504_0.0002391466
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.888004	0.033276	0.068452	0.010268
0.836202	0.03734	0.103834	0.022624
0.724786	0.004075	0.159721	0.111418
0.040063	0.139674	0.769872	0.050392
0.043382	0.822854	0.040891	0.092873
0.037546	0.877854	0.013421	0.07118
0.09577	0.028295	0.003133	0.872802
0.249256	0.023546	0.068168	0.659029
0.032888	0.19137	0.010997	0.764745
0.386521	0.106782	0.241887	0.26481

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K9me3_37_13_0.522_1.81258e-07
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.765858	0.002322	0.206098	0.025722
0.82797	0.068382	0.071986	0.031662
0.868001	0.005834	0.104514	0.021652
0.110312	0.095497	0.715833	0.078357
0.020932	0.875886	0.032855	0.070327
0.106406	0.797969	0.013136	0.082489
0.05192	0.043661	0.020305	0.884114
0.157301	0.173954	0.026059	0.642685
0.146352	0.172803	0.008516	0.672329
0.391474	0.148684	0.27934	0.180502

MOTIF	Midbrain_P0_H3K9me3_84_37_0.511_6.919127e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.732089	0.0	0.264263	0.003648
0.844991	0.032317	0.068819	0.053874
0.791992	0.005053	0.158993	0.043961
0.128378	0.141014	0.707802	0.022805
0.011468	0.909899	0.024425	0.054208
0.037382	0.866483	0.019369	0.076766
0.055511	0.077878	0.017262	0.84935
0.159056	0.042957	0.125319	0.672668
0.15986	0.194846	0.003543	0.641752
0.448697	0.155557	0.226326	0.169419

MOTIF	Heart_E11.5_H3K9me3_84_83_0.509_1.619027e-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.753128	0.001146	0.227855	0.017871
0.673038	0.159711	0.151385	0.015866
0.813713	0.003091	0.165978	0.017218
0.130526	0.213654	0.63829	0.01753
0.090964	0.796712	0.008903	0.103421
0.071512	0.702571	0.098629	0.127287
0.044725	0.031024	0.070633	0.853618
0.234043	0.162482	0.051649	0.551826
0.046134	0.205203	0.005796	0.742867

MOTIF	Forebrain_P0_H3K9me3_106_48_0.500_0.00316254
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.928891	0.002514	0.052241	0.016354
0.730115	0.090848	0.129582	0.049454
0.735105	0.0	0.203726	0.061168
0.227419	0.215784	0.496778	0.060019
0.110507	0.775374	0.008253	0.105866
0.018435	0.75224	0.102028	0.127297
0.096666	0.019968	0.100843	0.782524
0.187879	0.176128	0.023777	0.612217
0.102868	0.236354	0.0	0.660778

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9me3_21_34_0.530_1.424772e-05
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.890993	0.029683	0.074543	0.004781
0.771288	0.062247	0.126566	0.039899
0.689539	0.015477	0.199484	0.0955
0.142274	0.137965	0.644765	0.074996
0.100635	0.778667	0.014761	0.105938
0.058236	0.679474	0.105683	0.156607
0.042577	0.018884	0.100881	0.837658
0.11951	0.199145	0.124211	0.557133
0.023252	0.202522	0.024931	0.749295

MOTIF	Limb_E11.5_H3K9me3_20_49_0.529_1.063903e-11
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.910291	0.004574	0.074573	0.010562
0.692677	0.055257	0.250123	0.001943
0.695619	0.019796	0.26385	0.020734
0.019573	0.14093	0.770347	0.06915
0.022318	0.848854	0.011095	0.117733
0.01436	0.752786	0.057512	0.175342
0.023042	0.032008	0.020069	0.924881
0.129866	0.196783	0.07047	0.602881
0.00849	0.282078	0.037551	0.671881

MOTIF	Liver_E16.5_H3K9me3_44_118_0.526_1.556452e-12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.899012	0.0542	0.033454	0.013335
0.844506	0.010936	0.131188	0.01337
0.788286	0.002945	0.174468	0.034301
0.010575	0.176351	0.791374	0.0217
0.002017	0.857798	0.06842	0.071764
0.04395	0.659365	0.140721	0.155964
0.036901	0.049366	0.031451	0.882283
0.271513	0.034468	0.10227	0.59175
0.006878	0.075611	0.009591	0.90792
0.233397	0.23161	0.510668	0.024326

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K9me3_101_38_0.506_0.01132026
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.868347	0.0006	0.042264	0.088789
0.722881	0.183095	0.070974	0.02305
0.710627	0.044934	0.163397	0.081042
0.066922	0.12727	0.754764	0.051045
0.01969	0.887938	0.002502	0.089869
0.045777	0.786719	0.024481	0.143023
0.011545	0.038457	0.008728	0.941271
0.177307	0.036106	0.0352	0.751387
0.051353	0.168837	0.005613	0.774197
0.612265	0.108731	0.245255	0.033749

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K9me3_79_102_0.511_1.058073e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.78333	0.015399	0.192225	0.009045
0.748142	0.165808	0.067281	0.018768
0.858778	0.005191	0.121677	0.014354
0.059206	0.159686	0.73754	0.043569
0.041231	0.873384	0.024787	0.060598
0.040746	0.824306	0.071036	0.063912
0.046552	0.052902	0.006975	0.893571
0.142225	0.01806	0.188794	0.650922
0.0495	0.078042	0.034741	0.837717
0.427327	0.216166	0.35569	0.000817

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K9me3_51_37_0.510_0.0003010191
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.803654	0.018085	0.146443	0.031819
0.78486	0.106006	0.096143	0.01299
0.776725	0.0049	0.189777	0.028598
0.051176	0.157016	0.761104	0.030704
0.018775	0.896549	0.022384	0.062292
0.049863	0.840054	0.045579	0.064503
0.071829	0.073051	0.004741	0.850379
0.195601	0.058218	0.072926	0.673255
0.022363	0.230646	0.024948	0.722043
0.346827	0.183876	0.465379	0.003917

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K9me3_46_17_0.515_2.932064e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.927522	0.00742	0.044505	0.020553
0.747344	0.124084	0.096585	0.031987
0.790104	0.012804	0.148903	0.048189
0.03894	0.153682	0.7209	0.086478
0.023892	0.870249	0.037312	0.068548
0.023	0.83968	0.03168	0.105641
0.074447	0.020759	0.012791	0.892003
0.145087	0.127181	0.097678	0.630055
0.048305	0.162248	0.027378	0.762068
0.324072	0.121763	0.477691	0.076474

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K9me3_56_53_0.516_1.341074e-06
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.804102	0.028328	0.077911	0.089658
0.811746	0.066611	0.090665	0.030978
0.790831	0.008165	0.155135	0.045869
0.068016	0.118543	0.703957	0.109484
0.020687	0.884897	0.031258	0.063158
0.042184	0.833833	0.033223	0.090761
0.055979	0.063632	0.00455	0.87584
0.179508	0.032151	0.197024	0.591318
0.042279	0.164256	0.012428	0.781037

MOTIF	Limb_E15.5_H3K9me3_45_30_0.517_9.886187e-08
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.873241	0.036802	0.080475	0.009482
0.8102	0.08603	0.078066	0.025703
0.789788	0.015313	0.143776	0.051123
0.065182	0.187627	0.702389	0.044802
0.006598	0.881496	0.031495	0.080411
0.067188	0.787714	0.02857	0.116528
0.050062	0.091364	0.014639	0.843934
0.18779	0.044411	0.09323	0.674569
0.129542	0.154931	0.020556	0.69497

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K9me3_66_53_0.510_0.0001565215
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.792607	0.063929	0.07919	0.064274
0.712714	0.161045	0.099445	0.026797
0.765754	0.017121	0.147816	0.069309
0.049063	0.129907	0.771893	0.049138
0.026007	0.873068	0.002486	0.098439
0.050923	0.78887	0.023584	0.136623
0.017142	0.063031	0.028215	0.891613
0.19281	0.075676	0.079763	0.651752
0.035806	0.147232	0.025936	0.791026

MOTIF	Forebrain_E11.5_H3K9me3_63_120_0.513_0.002059564
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.828293	0.057604	0.073762	0.040341
0.823696	0.011442	0.038704	0.126158
0.020585	0.053758	0.917076	0.008581
0.019472	0.882571	0.060967	0.036991
0.059	0.815624	0.06186	0.063516
0.050861	0.025182	0.015306	0.908651
0.207431	0.142854	0.223641	0.426075
0.015856	0.007151	0.027564	0.949428
0.130088	0.036065	0.804336	0.029511

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K9me3_22_66_0.526_0.006835887
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.898155	0.020706	0.05291	0.028229
0.014264	0.015725	0.932156	0.037854
0.018842	0.834328	0.042322	0.104509
0.101472	0.776876	0.088621	0.033031
0.026484	0.033063	0.00673	0.933722
0.021273	0.171091	0.151839	0.655798
0.075405	0.020652	0.021505	0.882437
0.033559	0.026833	0.856734	0.082874
0.020015	0.55536	0.22101	0.203615
0.198518	0.119603	0.300833	0.381047