MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Liver_E11.5_H3K27me3_23_163_0.529_5.227366e-20 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.143 0.571 0.127 0.159 0.135 0.122 0.609 0.134 0.155 0.562 0.151 0.132 0.576 0.127 0.123 0.174 0.126 0.121 0.137 0.616 0.133 0.136 0.121 0.61 0.591 0.136 0.127 0.146 0.621 0.121 0.113 0.145 0.151 0.121 0.11 0.618 0.126 0.126 0.122 0.626 MOTIF Stomach_P0_H3K27me3_34_166_0.530_4.379515e-07 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.763 0.091 0.086 0.06 0.737 0.088 0.094 0.081 0.11 0.072 0.085 0.733 0.093 0.065 0.123 0.719 0.698 0.118 0.101 0.083 0.708 0.102 0.102 0.088 0.15 0.059 0.11 0.681 0.092 0.099 0.704 0.105 0.115 0.619 0.126 0.14 0.119 0.119 0.641 0.121 MOTIF Limb_E12.5_H3K4me2_50_168_0.577_8.646968e-213 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.036 0.717 0.106 0.141 0.046 0.073 0.734 0.147 0.113 0.731 0.086 0.07 0.83 0.08 0.036 0.054 0.126 0.057 0.128 0.689 0.126 0.035 0.045 0.794 0.728 0.103 0.05 0.119 0.779 0.058 0.097 0.066 MOTIF Kidney_E14.5_H3K27me3_16_161_0.533_5.415524e-23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.206 0.149 0.472 0.173 0.017 0.894 0.066 0.023 0.034 0.049 0.906 0.011 0.618 0.167 0.159 0.056 0.712 0.068 0.092 0.128 0.014 0.013 0.163 0.81 0.115 0.106 0.093 0.686 0.761 0.104 0.046 0.089 0.945 0.012 0.015 0.028 0.119 0.17 0.252 0.459 MOTIF Intestine_E15.5_H3K27me3_22_155_0.534_5.822727e-17 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.258 0.114 0.448 0.179 0.077 0.742 0.083 0.098 0.108 0.146 0.643 0.103 0.532 0.162 0.104 0.202 0.553 0.173 0.164 0.11 0.123 0.193 0.112 0.572 0.122 0.116 0.097 0.665 0.601 0.154 0.136 0.109 0.584 0.134 0.167 0.115 0.126 0.186 0.13 0.558 MOTIF Intestine_E16.5_H3K27me3_23_176_0.539_8.625208e-19 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.187 0.254 0.325 0.235 0.138 0.583 0.158 0.121 0.158 0.145 0.575 0.122 0.518 0.166 0.169 0.147 0.523 0.149 0.155 0.173 0.154 0.148 0.163 0.535 0.154 0.156 0.162 0.528 0.544 0.14 0.149 0.167 0.578 0.144 0.128 0.15 0.277 0.191 0.242 0.29 MOTIF Forebrain_P0_H3K27me3_20_166_0.528_3.756529e-10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.579 0.026 0.081 0.314 0.059 0.059 0.087 0.795 0.021 0.005 0.079 0.895 0.9 0.004 0.052 0.044 0.818 0.068 0.035 0.079 0.157 0.044 0.034 0.765 0.001 0.169 0.168 0.662 0.231 0.44 0.156 0.174 0.263 0.225 0.397 0.116 0.056 0.817 0.086 0.041 MOTIF Liver_E14.5_H3K27me3_36_167_0.551_1.926056e-31 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.062 0.06 0.805 0.073 0.059 0.754 0.11 0.077 0.113 0.049 0.732 0.106 0.833 0.096 0.044 0.027 0.771 0.062 0.054 0.113 0.062 0.037 0.102 0.799 0.07 0.062 0.087 0.781 0.864 0.066 0.052 0.018 0.868 0.06 0.015 0.057 0.063 0.057 0.08 0.8 MOTIF Heart_E15.5_H3K27me3_21_159_0.514_2.353369e-06 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.74 0.066 0.088 0.106 0.086 0.095 0.722 0.097 0.128 0.614 0.132 0.126 0.112 0.115 0.64 0.133 0.705 0.105 0.093 0.097 0.713 0.091 0.092 0.104 0.084 0.073 0.101 0.742 0.093 0.099 0.111 0.697 0.702 0.103 0.094 0.101 0.726 0.089 0.098 0.087 MOTIF Heart_E14.5_H3K27me3_17_166_0.522_8.935355e-12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.097 0.1 0.708 0.095 0.122 0.64 0.117 0.121 0.127 0.096 0.647 0.13 0.697 0.11 0.105 0.088 0.69 0.097 0.095 0.118 0.095 0.075 0.091 0.739 0.08 0.102 0.12 0.698 0.74 0.083 0.095 0.082 0.751 0.087 0.084 0.078 0.118 0.086 0.108 0.688 MOTIF Lung_E14.5_H3K27me3_27_173_0.537_4.177006e-18 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.096 0.102 0.698 0.104 0.119 0.652 0.115 0.114 0.12 0.098 0.643 0.139 0.719 0.1 0.096 0.085 0.726 0.089 0.075 0.11 0.097 0.073 0.101 0.729 0.101 0.082 0.098 0.719 0.7 0.098 0.099 0.103 0.727 0.09 0.087 0.096 0.122 0.096 0.094 0.688 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me2_35_165_0.587_1.502687e-246 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.811 0.06 0.078 0.051 0.677 0.062 0.114 0.147 0.165 0.077 0.095 0.663 0.07 0.047 0.068 0.815 0.714 0.096 0.166 0.024 0.609 0.126 0.113 0.152 0.052 0.157 0.124 0.667 0.011 0.1 0.117 0.772 0.12 0.685 0.064 0.131 0.123 0.21 0.586 0.081 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me2_24_159_0.640_4.796189e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.626 0.122 0.096 0.156 0.648 0.063 0.049 0.24 0.288 0.143 0.114 0.455 0.174 0.254 0.144 0.428 0.435 0.227 0.328 0.01 0.276 0.216 0.111 0.397 0.185 0.181 0.135 0.499 0.078 0.346 0.16 0.416 0.117 0.698 0.074 0.111 0.054 0.188 0.752 0.006 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me2_77_172_0.561_1.446742e-102 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.332 0.526 0.07 0.072 0.303 0.216 0.419 0.062 0.415 0.267 0.204 0.115 0.012 0.112 0.267 0.609 0.154 0.164 0.063 0.619 0.762 0.011 0.164 0.063 0.62 0.114 0.06 0.206 0.115 0.061 0.164 0.66 0.266 0.062 0.204 0.469 0.062 0.71 0.112 0.116 0.167 0.307 0.365 0.162 0.07 0.225 0.232 0.474 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me2_48_165_0.605_3.080133e-245 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me3_57_163_0.596_2.201711e-201 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_E15.5_H3K4me3_51_170_0.615_1.12006e-233 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.838 0.071 0.051 0.04 0.799 0.062 0.061 0.078 0.08 0.05 0.088 0.782 0.049 0.045 0.101 0.805 0.805 0.086 0.054 0.055 0.758 0.079 0.087 0.076 0.05 0.057 0.036 0.857 0.042 0.084 0.071 0.803 0.081 0.794 0.045 0.08 0.057 0.102 0.758 0.083