MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me2_16_151_0.673_8.790945e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.112 0.431 0.141 0.316 0.001 0.016 0.241 0.742 0.178 0.122 0.202 0.499 0.361 0.166 0.081 0.392 0.402 0.125 0.174 0.299 0.491 0.001 0.001 0.507 0.233 0.001 0.001 0.765 0.126 0.167 0.001 0.706 MOTIF Hindbrain_E13.5_H3K4me2_12_150_0.653_1.102412e-316 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.086 0.883 0.03 0.194 0.229 0.37 0.207 0.258 0.154 0.111 0.477 0.339 0.012 0.177 0.472 0.451 0.182 0.05 0.317 0.581 0.001 0.001 0.417 0.367 0.001 0.001 0.631 0.249 0.034 0.004 0.713 0.376 0.077 0.082 0.464 MOTIF Kidney_E14.5_H3K4me2_11_151_0.665_1.046193e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.36 0.077 0.205 0.359 0.61 0.014 0.001 0.375 0.609 0.004 0.004 0.383 0.385 0.013 0.004 0.598 0.393 0.007 0.001 0.599 0.365 0.256 0.006 0.373 0.499 0.227 0.064 0.21 0.26 0.385 0.236 0.118 0.013 0.966 0.012 0.009 0.006 0.015 0.966 0.013 MOTIF Kidney_P0_H3K4me2_8_151_0.661_1.392717e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.045 0.265 0.428 0.262 0.159 0.01 0.118 0.713 0.299 0.001 0.156 0.544 0.396 0.084 0.024 0.496 0.576 0.021 0.037 0.366 0.296 0.109 0.026 0.569 0.223 0.001 0.001 0.775 0.354 0.093 0.015 0.538 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me2_25_154_0.614_1.103712e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.03 0.906 0.06 0.004 0.008 0.142 0.747 0.103 0.183 0.046 0.485 0.285 0.137 0.224 0.397 0.243 0.288 0.159 0.116 0.437 0.87 0.006 0.036 0.088 0.962 0.002 0.023 0.013 0.25 0.038 0.01 0.702 0.097 0.072 0.058 0.773 0.573 0.076 0.042 0.309 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me2_37_153_0.604_4.275682e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.09 0.739 0.09 0.081 0.091 0.119 0.682 0.108 0.11 0.119 0.626 0.145 0.107 0.131 0.116 0.646 0.13 0.079 0.09 0.701 0.709 0.11 0.09 0.091 0.735 0.085 0.076 0.104 0.093 0.079 0.075 0.753 0.097 0.091 0.082 0.73 0.679 0.101 0.096 0.124 MOTIF Limb_E15.5_H3K4me2_33_159_0.605_5.040577e-241 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.188 0.119 0.155 0.538 0.606 0.15 0.112 0.132 0.596 0.072 0.152 0.18 0.157 0.166 0.068 0.609 0.144 0.167 0.11 0.579 0.58 0.133 0.156 0.131 0.161 0.529 0.157 0.153 0.141 0.15 0.187 0.522 0.169 0.717 0.065 0.049 0.031 0.15 0.75 0.069 MOTIF Forebrain_E16.5_H3K4me2_9_154_0.658_3.409635e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.353 0.127 0.144 0.376 0.622 0.043 0.178 0.157 0.732 0.161 0.007 0.1 0.424 0.021 0.004 0.551 0.023 0.137 0.035 0.805 0.296 0.141 0.087 0.476 0.426 0.202 0.182 0.19 0.247 0.334 0.315 0.104 0.001 0.997 0.001 0.001 0.007 0.001 0.991 0.001 MOTIF Intestine_E14.5_H3K4me2_23_156_0.629_2.06532e-317 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.011 0.832 0.022 0.135 0.036 0.005 0.815 0.144 0.198 0.211 0.325 0.267 0.183 0.072 0.207 0.538 0.642 0.081 0.079 0.198 0.766 0.046 0.108 0.08 0.615 0.092 0.101 0.192 0.128 0.113 0.124 0.635 MOTIF Liver_E16.5_H3K4me2_46_166_0.573_7.822825e-138 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.126 0.1 0.095 0.679 0.7 0.1 0.089 0.111 0.703 0.08 0.111 0.106 0.121 0.089 0.104 0.686 0.093 0.088 0.082 0.737 0.117 0.102 0.081 0.7 0.674 0.104 0.108 0.114 0.141 0.658 0.116 0.085 0.109 0.71 0.086 0.095 0.095 0.074 0.754 0.077 MOTIF Kidney_E16.5_H3K4me2_11_151_0.649_1.156e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.422 0.001 0.001 0.576 0.874 0.001 0.001 0.124 0.997 0.001 0.001 0.001 0.471 0.16 0.112 0.256 0.325 0.068 0.375 0.232 0.426 0.156 0.079 0.339 0.24 0.281 0.088 0.391 0.25 0.521 0.152 0.077 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 MOTIF Lung_E15.5_H3K4me2_11_154_0.645_4.251239e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.872 0.002 0.085 0.041 0.754 0.058 0.125 0.063 0.231 0.117 0.135 0.517 0.128 0.229 0.117 0.526 0.606 0.153 0.102 0.139 0.461 0.137 0.184 0.218 0.17 0.281 0.115 0.434 0.013 0.936 0.001 0.05 0.001 0.001 0.997 0.001 0.012 0.694 0.189 0.105 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me2_14_153_0.656_5.807846e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.416 0.032 0.21 0.343 0.997 0.001 0.001 0.001 0.639 0.181 0.179 0.001 0.413 0.107 0.144 0.336 0.23 0.244 0.226 0.301 0.136 0.316 0.142 0.406 0.305 0.211 0.13 0.355 0.169 0.327 0.321 0.184 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 MOTIF Midbrain_E15.5_H3K4me2_13_152_0.654_1.188038e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.03 0.855 0.078 0.037 0.115 0.001 0.85 0.034 0.354 0.254 0.308 0.084 0.39 0.204 0.157 0.248 0.218 0.173 0.276 0.333 0.192 0.258 0.245 0.305 0.34 0.171 0.254 0.235 0.191 0.194 0.182 0.433 0.001 0.032 0.001 0.966 0.262 0.267 0.001 0.47 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K9ac_53_168_0.575_2.179797e-114 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9ac_20_151_0.627_2.242206e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.112 0.512 0.193 0.183 0.442 0.001 0.004 0.553 0.041 0.036 0.594 0.329 0.106 0.636 0.167 0.091 0.305 0.18 0.157 0.357 0.064 0.001 0.083 0.852 0.001 0.001 0.001 0.997 0.152 0.113 0.001 0.734 MOTIF Kidney_E14.5_H3K9ac_24_155_0.628_7.641812e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.188 0.745 0.001 0.066 0.011 0.001 0.987 0.001 0.177 0.245 0.301 0.277 0.298 0.126 0.18 0.396 0.376 0.148 0.177 0.299 0.082 0.239 0.37 0.309 0.169 0.188 0.013 0.63 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.055 0.285 0.075 0.585