MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_65_171_0.572_3.41053e-99
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K4me2_69_169_0.555_1.0536e-56
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.552	0.142	0.17	0.136
0.831	0.055	0.061	0.053
0.856	0.038	0.065	0.041
0.848	0.049	0.064	0.039
0.746	0.074	0.102	0.078
0.149	0.71	0.078	0.063
0.164	0.038	0.033	0.765
0.07	0.083	0.694	0.153
0.174	0.694	0.052	0.08
0.717	0.092	0.038	0.153
0.205	0.455	0.212	0.127
0.233	0.17	0.137	0.459

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me2_68_171_0.534_1.25885e-30
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.386	0.086	0.217	0.311
0.108	0.128	0.648	0.116
0.105	0.016	0.078	0.801
0.059	0.048	0.802	0.091
0.077	0.764	0.075	0.084
0.85	0.014	0.013	0.123
0.053	0.06	0.795	0.092
0.071	0.075	0.062	0.792
0.028	0.041	0.057	0.874
0.027	0.068	0.034	0.871
0.057	0.074	0.068	0.801
0.163	0.299	0.172	0.366

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K27ac_21_149_0.554_5.57776e-136
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.163106	0.0	0.774853	0.062041
0.0	0.91948	0.015804	0.064716
0.8277	0.011708	0.029219	0.131373
0.0	0.054001	0.945999	0.0
0.258888	0.286577	0.039286	0.415249
0.040021	0.0	0.112666	0.847314
0.0	0.063598	0.007171	0.929231
0.011796	0.042488	0.0	0.945716

MOTIF	Heart_P0_H3K4me2_62_171_0.554_5.427388e-105
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.761	0.084	0.059	0.096
0.957	0.001	0.001	0.041
0.939	0.001	0.001	0.059
0.904	0.023	0.072	0.001
0.061	0.872	0.066	0.001
0.059	0.001	0.001	0.939
0.141	0.026	0.832	0.001
0.001	0.902	0.001	0.096

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K4me2_77_172_0.557_1.888448e-79
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.755	0.122	0.043	0.08
0.978	0.001	0.001	0.02
0.916	0.001	0.037	0.046
0.935	0.001	0.063	0.001
0.001	0.957	0.041	0.001
0.043	0.04	0.001	0.916
0.101	0.028	0.83	0.041
0.061	0.856	0.001	0.082

MOTIF	Intestine_E16.5_H3K4me2_65_171_0.553_1.571578e-76
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.076	0.067	0.791	0.066
0.059	0.849	0.033	0.059
0.817	0.045	0.046	0.092
0.065	0.081	0.787	0.067
0.05	0.07	0.064	0.816
0.075	0.049	0.075	0.801
0.062	0.061	0.052	0.825
0.056	0.075	0.053	0.816
0.064	0.094	0.05	0.792
0.709	0.109	0.079	0.103

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K4me2_71_173_0.560_7.271844e-81
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.078	0.073	0.806	0.043
0.088	0.811	0.055	0.046
0.836	0.031	0.028	0.105
0.064	0.055	0.806	0.075
0.05	0.061	0.069	0.82
0.098	0.055	0.071	0.776
0.061	0.043	0.039	0.857
0.072	0.055	0.058	0.815
0.077	0.094	0.069	0.76
0.712	0.089	0.057	0.142

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me3_65_164_0.583_2.022279e-113
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.87	0.046	0.001	0.083
0.997	0.001	0.001	0.001
0.929	0.001	0.001	0.069
0.963	0.001	0.035	0.001
0.001	0.939	0.031	0.029
0.126	0.001	0.001	0.872
0.193	0.028	0.724	0.055
0.001	0.815	0.065	0.119

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me3_68_165_0.557_2.101553e-69
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.089	0.056	0.78	0.075
0.099	0.739	0.089	0.073
0.849	0.001	0.064	0.086
0.049	0.064	0.838	0.049
0.003	0.052	0.011	0.934
0.002	0.007	0.081	0.91
0.057	0.074	0.047	0.822
0.042	0.031	0.07	0.857
0.082	0.123	0.724	0.071
0.086	0.082	0.008	0.824
0.03	0.02	0.073	0.877
0.065	0.022	0.054	0.859

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K9ac_56_165_0.559_2.120244e-57
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.106	0.043	0.791	0.06
0.017	0.867	0.001	0.115
0.874	0.001	0.001	0.124
0.042	0.001	0.956	0.001
0.001	0.056	0.001	0.942
0.057	0.071	0.001	0.871
0.025	0.001	0.001	0.973
0.063	0.058	0.041	0.838

MOTIF	Midbrain_E11.5_H3K9ac_59_166_0.561_2.216992e-84
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.062	0.05	0.853	0.035
0.039	0.864	0.001	0.096
0.822	0.001	0.001	0.176
0.06	0.031	0.859	0.05
0.001	0.001	0.001	0.997
0.035	0.046	0.001	0.918
0.022	0.001	0.001	0.976
0.062	0.038	0.081	0.819

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_71_173_0.561_3.339067e-74
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.079	0.035	0.832	0.054
0.001	0.911	0.001	0.087
0.798	0.022	0.047	0.133
0.001	0.037	0.961	0.001
0.001	0.001	0.03	0.968
0.031	0.033	0.001	0.935
0.001	0.001	0.023	0.975
0.122	0.054	0.087	0.737

MOTIF	Liver_P0_H3K9ac_60_172_0.526_1.02672e-32
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.752	0.072	0.095	0.081
0.768	0.087	0.08	0.065
0.794	0.065	0.08	0.061
0.759	0.092	0.081	0.068
0.76	0.078	0.083	0.079
0.084	0.742	0.092	0.082
0.11	0.062	0.054	0.774
0.082	0.086	0.73	0.102
0.116	0.711	0.087	0.086
0.742	0.097	0.062	0.099
0.085	0.72	0.095	0.1
0.111	0.081	0.059	0.749

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K9ac_55_171_0.551_6.408425e-66
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.137	0.149	0.582	0.132
0.145	0.573	0.134	0.148
0.643	0.055	0.148	0.154
0.128	0.112	0.608	0.152
0.153	0.147	0.116	0.584
0.157	0.089	0.139	0.615
0.14	0.096	0.108	0.656
0.093	0.141	0.13	0.636
0.159	0.155	0.121	0.565
0.539	0.146	0.137	0.178

MOTIF	Limb_E13.5_H3K9ac_51_170_0.558_1.085031e-75
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.064	0.071	0.813	0.052
0.062	0.799	0.067	0.072
0.804	0.056	0.047	0.093
0.073	0.077	0.789	0.061
0.08	0.073	0.049	0.798
0.073	0.042	0.08	0.805
0.063	0.03	0.041	0.866
0.05	0.059	0.061	0.83
0.064	0.103	0.054	0.779
0.719	0.11	0.089	0.082

MOTIF	Stomach_P0_H3K9ac_56_171_0.561_1.001325e-69
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7