MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me2_55_55_0.580_1.42778e-267
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.081449	0.150706	0.0	0.767846
0.0	0.960667	0.0	0.039333
0.020072	0.77855	0.138717	0.062661
0.132357	0.851887	0.0	0.015756
0.441371	0.531662	0.026967	0.0
0.006821	0.063978	0.921227	0.007975
0.097854	0.865657	0.0	0.036489
0.0	0.0	1.0	0.0
0.868859	0.0	0.0	0.131141

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me2_42_40_0.589_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.409146	0.146414	0.0	0.444439
0.13717	0.808564	0.0	0.054266
0.068552	0.860865	0.035562	0.035021
0.087233	0.887073	0.025694	0.0
0.231953	0.539225	0.228822	0.0
0.021054	0.032222	0.946724	0.0
0.258537	0.707295	0.0	0.034169
0.0	0.062154	0.937846	0.0
0.803752	0.049014	0.05125	0.095984

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K4me2_33_14_0.617_2.817478e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.069804	0.779283	0.022473	0.12844
0.065713	0.09372	0.788984	0.051582
0.002267	0.89043	0.008509	0.098793
0.113306	0.19844	0.542624	0.14563
0.010167	0.053467	0.915702	0.020664
0.037151	0.014896	0.924857	0.023096
0.130385	0.028658	0.822247	0.01871
0.891282	0.020021	0.037376	0.051321
0.077877	0.266809	0.642216	0.013098
0.189869	0.416634	0.107847	0.285649

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K4me2_18_11_0.670_5.329204e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.063399	0.84448	0.044262	0.047859
0.017053	0.05328	0.895701	0.033967
0.07006	0.806383	0.021401	0.102156
0.020678	0.055652	0.77046	0.153209
0.019158	0.046	0.843704	0.091138
0.198893	0.030273	0.649898	0.120937
0.024467	0.026863	0.913494	0.035176
0.819965	0.058667	0.073011	0.048358
0.177683	0.037389	0.70386	0.081068
0.113828	0.285112	0.416067	0.184993
0.375729	0.360433	0.179523	0.084316
0.006106	0.026096	0.677061	0.290737

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me2_20_16_0.596_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.017926	0.9159	0.034223	0.031952
0.009894	0.096332	0.779314	0.114459
0.154601	0.712151	0.006523	0.126724
0.016851	0.061124	0.905289	0.016736
0.03856	0.06279	0.781652	0.116998
0.091297	0.040389	0.822125	0.046189
0.09334	0.036355	0.816631	0.053674
0.773517	0.063295	0.111486	0.051701
0.110025	0.057827	0.820752	0.011396
0.234279	0.304326	0.144486	0.316908

MOTIF	Heart_E13.5_H3K4me2_21_18_0.592_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.035219	0.756758	0.0458	0.162223
0.035934	0.056954	0.855792	0.05132
0.040042	0.919588	0.01678	0.023591
0.05114	0.067129	0.750095	0.131635
0.027115	0.133909	0.754282	0.084695
0.042575	0.022535	0.82463	0.11026
0.114061	0.014485	0.844183	0.027272
0.847985	0.010543	0.084259	0.057212
0.217808	0.015431	0.692117	0.074643

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me2_34_25_0.578_3.437777e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.044884	0.860455	0.030329	0.064332
0.036512	0.04662	0.864231	0.052637
0.108479	0.837502	0.018509	0.03551
0.129764	0.054051	0.598543	0.217642
0.017513	0.054428	0.798803	0.129257
0.035139	0.009611	0.823191	0.132059
0.122163	0.027011	0.834568	0.016258
0.874192	0.008961	0.078624	0.038223
0.096617	0.058606	0.829279	0.015499
0.185745	0.135449	0.262362	0.416444

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me2_29_18_0.617_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.046983	0.739649	0.030017	0.183351
0.018618	0.012743	0.840971	0.127667
0.011875	0.865221	0.01548	0.107424
0.04748	0.113079	0.653608	0.185832
0.014485	0.040242	0.926192	0.019081
0.040656	0.101099	0.828734	0.029511
0.223942	0.051627	0.705929	0.018501
0.863304	0.031739	0.046451	0.058507
0.06609	0.077521	0.839732	0.016658
0.247542	0.057126	0.40642	0.288911

MOTIF	Cranio-Facial_E11.5_H3K4me2_42_21_0.616_1.991858e-317
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.159084	0.769128	0.041381	0.030407
0.015631	0.042828	0.845389	0.096153
0.07982	0.756778	0.034872	0.12853
0.129037	0.024571	0.783902	0.06249
0.016852	0.024573	0.940753	0.017821
0.251712	0.049206	0.656788	0.042294
0.053222	0.023265	0.88619	0.037323
0.905948	0.025783	0.031026	0.037242
0.234518	0.034394	0.697407	0.033681
0.181703	0.071009	0.662036	0.085252

MOTIF	Hindbrain_E15.5_H3K4me2_33_16_0.618_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.098446	0.588337	0.306933	0.006284
0.090323	0.8345	0.037519	0.037659
0.02086	0.078246	0.785985	0.11491
0.025072	0.842459	0.013856	0.118613
0.132617	0.066632	0.703388	0.097364
0.09121	0.027275	0.838337	0.043178
0.140576	0.023007	0.780594	0.055824
0.147112	0.034516	0.795597	0.022775
0.874994	0.023115	0.04001	0.061882
0.154266	0.029836	0.789892	0.026006

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_29_18_0.619_2.071104e-313
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.027192	0.814605	0.025304	0.132899
0.017292	0.053681	0.803775	0.125251
0.138022	0.811485	0.002075	0.048419
0.027878	0.055121	0.815217	0.101784
0.106219	0.050742	0.820937	0.022102
0.156083	0.049802	0.684316	0.109799
0.04057	0.05735	0.869943	0.032137
0.923388	0.0	0.038128	0.038484
0.138953	0.071589	0.768756	0.020701
0.310811	0.191148	0.457321	0.04072

MOTIF	Liver_E16.5_H3K9ac_44_16_0.568_3.429808e-120
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.056892	0.848347	0.069205	0.025556
0.105163	0.058823	0.798328	0.037686
0.041518	0.912484	0.012445	0.033554
0.172806	0.061336	0.750938	0.014921
0.012979	0.025165	0.856915	0.104941
0.163401	0.019898	0.64526	0.17144
0.127341	0.032445	0.796362	0.043853
0.878719	0.03318	0.037496	0.050605
0.064038	0.053263	0.877106	0.005592
0.227076	0.109878	0.404565	0.25848
0.23487	0.330368	0.34998	0.084783
0.780807	0.0	0.06165	0.157544

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K9ac_56_24_0.604_1.703142e-154
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.489032	0.328682	0.10869	0.073596
0.045395	0.909054	0.015234	0.030317
0.010533	0.060794	0.880842	0.047831
0.043812	0.793538	0.009147	0.153503
0.119096	0.035396	0.62313	0.222378
0.009308	0.021715	0.955903	0.013074
0.063056	0.042199	0.738381	0.156364
0.155473	0.048161	0.735311	0.061054
0.90201	0.012452	0.017647	0.067891
0.022558	0.060979	0.872297	0.044166
0.211011	0.026771	0.734938	0.027279

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K9ac_29_19_0.608_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.047946	0.870694	0.033225	0.048135
0.024354	0.065813	0.815685	0.094148
0.20427	0.756311	0.013136	0.026283
0.028163	0.147818	0.647323	0.176697
0.010357	0.058757	0.917129	0.013758
0.178791	0.027133	0.687761	0.106315
0.034797	0.032825	0.932378	0.0
0.875529	0.055063	0.023561	0.045847
0.105982	0.047852	0.791765	0.054402

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K9ac_30_28_0.594_3.140543e-318
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.04744	0.774615	0.048701	0.129244
0.058414	0.042251	0.787525	0.11181
0.07129	0.86498	0.021059	0.042671
0.03704	0.073507	0.755359	0.134094
0.088919	0.026415	0.852997	0.031669
0.176019	0.019583	0.707517	0.096881
0.080042	0.019262	0.879334	0.021361
0.842684	0.026225	0.06136	0.069731
0.117622	0.070722	0.763571	0.048085

MOTIF	Neural-Tube_E13.5_H3K9ac_33_20_0.578_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.067589	0.670379	0.203496	0.058535
0.043355	0.865058	0.045293	0.046294
0.025952	0.042207	0.735646	0.196195
0.104032	0.860561	0.009522	0.025885
0.031492	0.051967	0.711778	0.204763
0.096871	0.046016	0.7839	0.073214
0.027886	0.037552	0.740209	0.194353
0.029197	0.031265	0.903634	0.035904
0.749048	0.052315	0.078221	0.120417
0.027581	0.063858	0.887898	0.020663

MOTIF	Stomach_P0_H3K9ac_46_41_0.574_5.233839e-227
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.095513	0.740709	0.067088	0.09669
0.01862	0.021233	0.92742	0.032727
0.104558	0.84713	0.018004	0.030309
0.096471	0.023257	0.631273	0.248999
0.140398	0.033488	0.657069	0.169045
0.023853	0.022188	0.924745	0.029214
0.07636	0.132189	0.744152	0.047299
0.875642	0.013098	0.051924	0.059336
0.033475	0.064402	0.877585	0.024537