MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K27me3_16_16_0.560_1.277459e-75
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.124751	0.804323	0.034907	0.036019
0.054902	0.098201	0.688245	0.158651
0.020937	0.866815	0.050799	0.061449
0.113055	0.059046	0.752456	0.075443
0.04504	0.031505	0.874369	0.049087
0.050362	0.023048	0.85213	0.07446
0.792617	0.053046	0.044406	0.109931
0.050128	0.04402	0.812381	0.09347
0.061577	0.856804	0.045091	0.036528
0.091652	0.165036	0.544608	0.198704
0.016901	0.683916	0.284884	0.014299
0.146424	0.424048	0.0	0.429528

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K27me3_8_25_0.539_5.177539e-38
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.033501	0.922658	0.018295	0.025545
0.072897	0.040953	0.755349	0.130802
0.02017	0.890336	0.02425	0.065244
0.069213	0.072395	0.84331	0.015082
0.050013	0.031333	0.744875	0.173779
0.098484	0.021777	0.78017	0.09957
0.824031	0.017536	0.061511	0.096922
0.009495	0.238839	0.717882	0.033784
0.051641	0.903698	0.007301	0.03736
0.020525	0.0	0.567149	0.412325

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K27me3_14_27_0.542_1.901347e-46
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.055848	0.8302	0.014828	0.099124
0.026642	0.064779	0.887087	0.021492
0.016829	0.757362	0.0	0.225809
0.041354	0.026909	0.906637	0.0251
0.005921	0.02279	0.957104	0.014185
0.087413	0.045164	0.771067	0.096356
0.878065	0.030471	0.009969	0.081496
0.056025	0.239003	0.576462	0.12851
0.066901	0.735611	0.02303	0.174457

MOTIF	Heart_E12.5_H3K4me2_36_26_0.580_6.390185e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.033185	0.899815	0.01298	0.05402
0.164099	0.087117	0.719929	0.028854
0.008612	0.816504	0.038241	0.136643
0.031398	0.045631	0.918249	0.004722
0.017456	0.020453	0.851188	0.110903
0.085125	0.011037	0.851586	0.052251
0.766352	0.050699	0.0	0.182949
0.161356	0.042836	0.785164	0.010644
0.177419	0.759477	0.045865	0.017238

MOTIF	Heart_P0_H3K4me2_27_20_0.610_8.303454e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.476072	0.21934	0.171055	0.133533
0.026839	0.900436	0.030854	0.041871
0.18121	0.049564	0.724051	0.045175
0.024485	0.868096	0.075915	0.031504
0.026146	0.056442	0.898416	0.018996
0.162222	0.014139	0.799631	0.024008
0.163048	0.011705	0.75737	0.067876
0.799827	0.02841	0.051789	0.119974
0.169961	0.029	0.789832	0.011207
0.040791	0.873629	0.07913	0.00645

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K4me2_33_40_0.614_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030234	0.790923	0.037432	0.141412
0.021886	0.066353	0.890765	0.020996
0.173806	0.633046	0.047941	0.145208
0.0	0.01485	0.81414	0.17101
0.010418	0.027662	0.828643	0.133277
0.13454	0.052635	0.774189	0.038636
0.833772	0.029733	0.077549	0.058945
0.026396	0.030306	0.847737	0.095562
0.039385	0.865412	0.069707	0.025496

MOTIF	Heart_E15.5_H3K9ac_22_21_0.623_7.788792e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.029596	0.906946	0.026284	0.037173
0.024326	0.0	0.88521	0.090464
0.042346	0.696574	0.051033	0.210047
0.077723	0.034855	0.069609	0.817814
0.02748	0.904209	0.035761	0.03255
0.017751	0.922483	0.043971	0.015795
0.104044	0.778736	0.042255	0.074966
0.079616	0.04211	0.731371	0.146902
0.301244	0.58207	0.104648	0.012038
0.074886	0.043866	0.873121	0.008127
0.022225	0.029794	0.937459	0.010522

MOTIF	Heart_E11.5_H3K9ac_43_14_0.552_2.095486e-304
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.029561	0.923984	0.036774	0.009681
0.008769	0.078658	0.693281	0.219292
0.063942	0.703159	0.042147	0.190752
0.044674	0.034107	0.039461	0.881759
0.017119	0.940443	0.027513	0.014925
0.024442	0.822083	0.02364	0.129835
0.216628	0.687516	0.080609	0.015248
0.037233	0.024243	0.907431	0.031093
0.050518	0.793184	0.054494	0.101804
0.280828	0.230617	0.256211	0.232344

MOTIF	Heart_P0_H3K9ac_30_24_0.593_8.903327e-311
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.019233	0.84079	0.058406	0.081571
0.111539	0.036558	0.668757	0.183146
0.040337	0.860709	0.033878	0.065075
0.063407	0.066236	0.009574	0.860782
0.025248	0.879549	0.041286	0.053916
0.079111	0.753368	0.054284	0.113236
0.113674	0.780613	0.057783	0.047929
0.085507	0.034703	0.859241	0.020549
0.122356	0.703328	0.106201	0.068115

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K9ac_25_18_0.627_1.48201e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.055084	0.410537	0.36004	0.174339
0.043786	0.852199	0.024319	0.079696
0.019068	0.042923	0.885513	0.052496
0.098538	0.720002	0.045432	0.136029
0.077851	0.051987	0.101794	0.768367
0.035688	0.895871	0.046959	0.021482
0.064126	0.826368	0.010126	0.099381
0.149584	0.793655	0.030589	0.026172
0.081808	0.021013	0.774466	0.122713
0.079871	0.748899	0.11465	0.05658

MOTIF	Kidney_P0_H3K9ac_29_22_0.609_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.1211	0.79204	0.06505	0.02181
0.018036	0.046103	0.87272	0.06314
0.036056	0.746958	0.039442	0.177545
0.043145	0.038313	0.046872	0.871669
0.033732	0.907676	0.042534	0.016058
0.104445	0.737446	0.050755	0.107354
0.183896	0.735392	0.068665	0.012048
0.123897	0.023752	0.82267	0.029681
0.080177	0.762013	0.108113	0.049696

MOTIF	Midbrain_E16.5_H3K9ac_27_11_0.598_2.145475e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.031565	0.928319	0.021535	0.018581
0.11621	0.036969	0.765077	0.081745
0.038607	0.802317	0.04153	0.117546
0.139313	0.020212	0.045141	0.795334
0.041637	0.874778	0.025597	0.057988
0.139679	0.80019	0.038913	0.021218
0.12252	0.804332	0.031586	0.041562
0.023237	0.065695	0.89886	0.012208
0.152157	0.738741	0.089682	0.019421
0.069463	0.039778	0.616812	0.273948
0.294936	0.032796	0.35523	0.317038
0.013427	0.698083	0.06166	0.22683

MOTIF	Lung_E16.5_H3K9ac_33_29_0.582_4.03295e-254
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.359524	0.295517	0.013985	0.330974
0.079329	0.613931	0.248441	0.058299
0.046385	0.872648	0.029163	0.051804
0.184611	0.062474	0.71493	0.037985
0.098697	0.860112	0.01624	0.024951
0.016774	0.039344	0.825791	0.118091
0.249976	0.030329	0.693941	0.025753
0.026897	0.037669	0.769305	0.166128
0.832695	0.039806	0.090111	0.037388
0.010944	0.0464	0.932421	0.010235
0.052773	0.923272	0.0	0.023954

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K9ac_23_26_0.617_7.587456e-315
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.039399	0.837743	0.098151	0.024707
0.019521	0.014049	0.947398	0.019032
0.145985	0.656062	0.072778	0.125175
0.083248	0.023668	0.707841	0.185243
0.168083	0.014451	0.78837	0.029096
0.122832	0.075403	0.734741	0.067024
0.876231	0.019898	0.045529	0.058342
0.043687	0.137965	0.808651	0.009697
0.049273	0.923492	0.020439	0.006795
0.182726	0.189589	0.47899	0.148695

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K9ac_15_23_0.634_2.120104e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.03985	0.780783	0.048733	0.130633
0.02717	0.039581	0.888702	0.044547
0.022967	0.914555	0.030426	0.032052
0.006563	0.142098	0.752775	0.098564
0.19609	0.042201	0.76171	0.0
0.030395	0.027034	0.88133	0.061241
0.827882	0.013181	0.044642	0.114294
0.185258	0.038529	0.698453	0.07776
0.162055	0.787828	0.014386	0.035731
0.451928	0.027257	0.272862	0.247953

MOTIF	Intestine_E15.5_H3K9ac_19_24_0.633_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013134	0.816493	0.090436	0.079937
0.034292	0.058941	0.87644	0.030327
0.019191	0.848624	0.008156	0.124029
0.01006	0.01986	0.750478	0.219603
0.068258	0.022852	0.893549	0.015341
0.022497	0.025929	0.906498	0.045077
0.792327	0.010678	0.097529	0.099467
0.201557	0.043244	0.67648	0.078719
0.199149	0.665137	0.105813	0.029901

MOTIF	Stomach_E14.5_H3K9ac_47_39_0.631_3.045346e-235
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.339533	0.408933	0.223842	0.027692
0.025179	0.699341	0.038625	0.236855
0.03564	0.020638	0.834579	0.109144
0.0	0.979116	0.00344	0.017445
0.013134	0.036909	0.636512	0.313445
0.012772	0.01292	0.962574	0.011734
0.02201	0.033396	0.786116	0.158477
0.795879	0.034652	0.083459	0.086011
0.025651	0.05126	0.905107	0.017983
0.084753	0.837299	0.022998	0.05495