MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Hindbrain_P0_H3K27ac_31_167_0.543_6.626237e-85 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.166 0.541 0.143 0.15 0.187 0.057 0.606 0.15 0.084 0.068 0.768 0.08 0.824 0.066 0.063 0.047 0.813 0.062 0.067 0.058 0.08 0.053 0.079 0.788 0.073 0.059 0.099 0.769 0.76 0.098 0.073 0.069 0.798 0.068 0.051 0.083 0.075 0.068 0.065 0.792 0.053 0.075 0.07 0.802 0.079 0.74 0.083 0.098 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K27ac_19_155_0.563_8.066437e-54 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.122 0.001 0.876 0.001 0.001 0.187 0.811 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.187 0.001 0.811 0.688 0.123 0.188 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.997 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K4me3_63_167_0.598_2.011536e-181 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K4me3_66_160_0.588_1.160376e-163 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.098 0.061 0.747 0.094 0.118 0.653 0.099 0.13 0.128 0.042 0.692 0.138 0.081 0.065 0.766 0.088 0.779 0.073 0.085 0.063 0.761 0.065 0.092 0.082 0.098 0.06 0.083 0.759 0.078 0.073 0.11 0.739 0.769 0.075 0.059 0.097 0.776 0.072 0.059 0.093 0.112 0.069 0.046 0.773 0.075 0.071 0.07 0.784 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me3_58_158_0.590_8.493648e-157 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.077 0.07 0.759 0.094 0.113 0.646 0.109 0.132 0.135 0.055 0.696 0.114 0.074 0.061 0.791 0.074 0.763 0.079 0.094 0.064 0.738 0.076 0.104 0.082 0.089 0.072 0.095 0.744 0.067 0.066 0.097 0.77 0.771 0.084 0.065 0.08 0.783 0.075 0.069 0.073 0.088 0.084 0.072 0.756 0.075 0.071 0.07 0.784 MOTIF Hindbrain_E11.5_H3K4me3_70_166_0.593_6.000331e-151 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.085 0.075 0.746 0.094 0.12 0.645 0.107 0.128 0.144 0.052 0.673 0.131 0.066 0.06 0.803 0.071 0.794 0.064 0.087 0.055 0.747 0.075 0.097 0.081 0.075 0.069 0.091 0.765 0.069 0.078 0.103 0.75 0.758 0.091 0.067 0.084 0.759 0.085 0.072 0.084 0.081 0.071 0.079 0.769 0.067 0.067 0.077 0.789 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me3_69_165_0.586_1.224521e-172 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.084 0.078 0.736 0.102 0.133 0.62 0.115 0.132 0.155 0.053 0.656 0.136 0.086 0.056 0.788 0.07 0.797 0.066 0.079 0.058 0.781 0.07 0.083 0.066 0.086 0.071 0.086 0.757 0.071 0.064 0.1 0.765 0.754 0.094 0.062 0.09 0.775 0.077 0.067 0.081 0.082 0.071 0.07 0.777 0.069 0.067 0.071 0.793 MOTIF Hindbrain_E16.5_H3K4me3_64_161_0.591_2.948644e-186 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.119 0.103 0.661 0.117 0.152 0.563 0.137 0.148 0.164 0.083 0.595 0.158 0.124 0.099 0.673 0.104 0.698 0.104 0.105 0.093 0.674 0.104 0.105 0.117 0.114 0.092 0.105 0.689 0.109 0.104 0.11 0.677 0.675 0.106 0.106 0.113 0.696 0.103 0.089 0.112 0.115 0.094 0.102 0.689 0.098 0.091 0.1 0.711 MOTIF Forebrain_P0_H3K4me3_53_164_0.618_1.004459e-242 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Midbrain_P0_H3K4me3_50_170_0.620_5.95376e-267 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K9ac_47_165_0.587_8.163913e-157 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 MOTIF Hindbrain_E12.5_H3K9ac_59_167_0.557_3.117875e-109 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.111 0.108 0.67 0.111 0.154 0.565 0.14 0.141 0.172 0.082 0.59 0.156 0.122 0.09 0.69 0.098 0.699 0.105 0.107 0.089 0.676 0.099 0.114 0.111 0.112 0.093 0.109 0.686 0.107 0.102 0.117 0.674 0.667 0.117 0.106 0.11 0.692 0.099 0.094 0.115 0.112 0.098 0.104 0.686 0.095 0.094 0.105 0.706 MOTIF Midbrain_P0_H3K9ac_36_166_0.591_5.173792e-175 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K9ac_59_163_0.568_8.030413e-103 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.045 0.042 0.844 0.069 0.104 0.677 0.129 0.09 0.134 0.023 0.758 0.085 0.045 0.03 0.858 0.067 0.826 0.045 0.072 0.057 0.812 0.047 0.069 0.072 0.049 0.03 0.048 0.873 0.015 0.03 0.03 0.925 0.835 0.057 0.052 0.056 0.867 0.037 0.034 0.062 0.048 0.052 0.045 0.855 0.035 0.056 0.03 0.879 MOTIF Kidney_E16.5_H3K9ac_16_159_0.603_1.355174e-266 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.621 0.04 0.143 0.196 0.148 0.133 0.533 0.186 0.139 0.13 0.197 0.534 0.749 0.093 0.036 0.122 0.604 0.091 0.115 0.19 0.235 0.141 0.056 0.568 0.1 0.188 0.047 0.665 0.095 0.692 0.081 0.132 0.011 0.838 0.104 0.047 0.001 0.006 0.992 0.001 MOTIF Liver_P0_H3K9ac_43_170_0.566_1.484743e-96 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.133 0.109 0.046 0.712 0.124 0.826 0.001 0.049 0.051 0.109 0.814 0.026 0.211 0.026 0.652 0.111 0.807 0.011 0.166 0.016 0.833 0.066 0.043 0.058 0.088 0.058 0.048 0.806 0.069 0.069 0.025 0.837 0.661 0.041 0.072 0.226 0.091 0.715 0.117 0.077 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K9ac_47_172_0.573_4.594402e-137 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.089 0.742 0.082 0.087 0.109 0.116 0.682 0.093 0.117 0.107 0.682 0.094 0.685 0.102 0.114 0.099 0.691 0.075 0.092 0.142 0.099 0.099 0.084 0.718 0.096 0.085 0.103 0.716 0.69 0.101 0.099 0.11 0.094 0.698 0.109 0.099 0.125 0.101 0.077 0.697 MOTIF Stomach_E14.5_H3K9ac_61_166_0.589_2.061036e-101 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.15 0.591 0.119 0.14 0.141 0.096 0.623 0.14 0.121 0.106 0.676 0.097 0.697 0.096 0.121 0.086 0.657 0.103 0.117 0.123 0.126 0.103 0.11 0.661 0.101 0.113 0.1 0.686 0.603 0.135 0.119 0.143 0.119 0.66 0.104 0.117 0.091 0.104 0.075 0.73 0.07 0.099 0.106 0.725 0.093 0.108 0.107 0.692