MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E11.5_H3K4me3_25_166_0.687_4.514437e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.138 0.118 0.112 0.632 0.706 0.077 0.093 0.124 0.095 0.107 0.701 0.097 0.091 0.105 0.098 0.706 0.089 0.704 0.098 0.109 0.08 0.116 0.717 0.087 0.09 0.745 0.1 0.065 0.094 0.093 0.712 0.101 0.665 0.117 0.108 0.11 0.102 0.714 0.088 0.096 MOTIF Hindbrain_P0_H3K4me3_25_162_0.694_3.700628e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.857 0.045 0.056 0.042 0.13 0.685 0.092 0.093 0.081 0.071 0.812 0.036 0.039 0.068 0.077 0.816 0.065 0.832 0.036 0.067 0.092 0.084 0.779 0.045 0.049 0.837 0.05 0.064 0.094 0.069 0.787 0.05 0.72 0.092 0.122 0.066 0.058 0.876 0.045 0.021 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me3_35_164_0.656_1.861644e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.101 0.726 0.083 0.09 0.052 0.074 0.825 0.049 0.078 0.715 0.05 0.157 0.088 0.081 0.778 0.053 0.844 0.045 0.046 0.065 0.048 0.821 0.063 0.068 0.026 0.07 0.845 0.059 0.059 0.08 0.075 0.786 0.031 0.832 0.093 0.044 0.827 0.074 0.028 0.071 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me3_7_153_0.742_7.162844e-311 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.67 0.104 0.133 0.093 0.113 0.694 0.106 0.087 0.082 0.088 0.705 0.125 0.113 0.119 0.104 0.664 0.099 0.702 0.075 0.124 0.088 0.1 0.736 0.076 0.078 0.74 0.09 0.092 0.106 0.092 0.693 0.109 0.712 0.105 0.092 0.091 0.686 0.131 0.106 0.077 MOTIF Kidney_P0_H3K4me3_7_154_0.730_2.007608e-314 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.092 0.099 0.105 0.704 0.117 0.672 0.106 0.105 0.089 0.111 0.712 0.088 0.083 0.723 0.095 0.099 0.106 0.106 0.691 0.097 0.694 0.09 0.112 0.104 0.11 0.714 0.094 0.082 0.078 0.104 0.714 0.104 0.096 0.139 0.112 0.653 0.093 0.722 0.101 0.084 MOTIF Stomach_E15.5_H3K4me3_6_159_0.723_1.533086e-320 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.126 0.129 0.683 0.062 0.686 0.107 0.112 0.095 0.109 0.754 0.075 0.062 0.088 0.126 0.72 0.066 0.098 0.136 0.102 0.664 0.093 0.694 0.096 0.117 0.07 0.103 0.735 0.092 0.096 0.678 0.12 0.106 0.095 0.086 0.704 0.115 0.68 0.116 0.109 0.095 MOTIF Limb_E11.5_H3K9ac_29_169_0.589_2.876298e-219 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.692 0.074 0.147 0.087 0.03 0.755 0.135 0.08 0.082 0.108 0.633 0.177 0.058 0.084 0.124 0.734 0.028 0.816 0.032 0.124 0.061 0.1 0.75 0.089 0.023 0.836 0.054 0.087 0.787 0.061 0.072 0.08 MOTIF Kidney_E15.5_H3K9ac_19_162_0.664_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.088 0.078 0.798 0.036 0.072 0.799 0.057 0.072 0.056 0.041 0.873 0.03 0.711 0.057 0.098 0.134 0.124 0.683 0.127 0.066 0.061 0.127 0.703 0.109 0.104 0.124 0.063 0.709 0.063 0.151 0.062 0.724 MOTIF Neural-Tube_E15.5_H3K9ac_10_157_0.673_1.982958e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.723 0.09 0.086 0.101 0.717 0.091 0.109 0.083 0.704 0.085 0.113 0.098 0.112 0.667 0.129 0.092 0.109 0.143 0.642 0.106 0.111 0.108 0.098 0.683 0.09 0.71 0.108 0.092 0.093 0.108 0.7 0.099 0.083 0.74 0.087 0.09 0.09 0.11 0.715 0.085 MOTIF Liver_E13.5_H3K9ac_12_158_0.599_0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.215 0.411 0.18 0.195 0.181 0.173 0.636 0.01 0.216 0.589 0.007 0.188 0.303 0.13 0.444 0.124 0.997 0.001 0.001 0.001 0.209 0.576 0.023 0.192 0.101 0.286 0.467 0.147 0.159 0.358 0.187 0.297 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K9ac_9_152_0.613_9.603389e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.073 0.052 0.041 0.834 0.094 0.743 0.066 0.097 0.033 0.112 0.811 0.044 0.048 0.833 0.059 0.06 0.161 0.058 0.717 0.064 0.758 0.094 0.097 0.051 0.137 0.682 0.099 0.082 0.129 0.087 0.622 0.162 MOTIF Liver_E12.5_H3K9ac_1_153_0.628_1.913239e-313 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.075 0.747 0.063 0.115 0.019 0.094 0.755 0.132 0.075 0.165 0.059 0.701 0.108 0.721 0.085 0.086 0.057 0.051 0.827 0.065 0.047 0.83 0.051 0.072 0.105 0.068 0.727 0.1 0.695 0.074 0.127 0.104 MOTIF Liver_P0_H3K9ac_10_157_0.613_8.017046e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.087 0.103 0.094 0.716 0.106 0.711 0.099 0.084 0.092 0.107 0.711 0.09 0.093 0.743 0.092 0.072 0.113 0.108 0.679 0.1 0.682 0.101 0.113 0.104 0.118 0.677 0.111 0.094 0.106 0.12 0.695 0.079 0.092 0.713 0.098 0.097 0.092 0.129 0.103 0.676 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K9ac_32_163_0.608_4.813579e-312 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.083 0.042 0.836 0.039 0.062 0.107 0.062 0.769 0.041 0.796 0.062 0.101 0.072 0.07 0.846 0.012 0.029 0.792 0.078 0.101 0.115 0.081 0.758 0.046 0.847 0.046 0.046 0.061 0.049 0.779 0.088 0.084 0.103 0.091 0.719 0.087 0.005 0.077 0.071 0.847 MOTIF Liver_E11.5_H3K9ac_16_154_0.610_3.05545e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.038 0.09 0.806 0.066 0.048 0.078 0.048 0.826 0.029 0.822 0.052 0.097 0.028 0.06 0.871 0.041 0.04 0.82 0.057 0.083 0.105 0.063 0.786 0.046 0.801 0.086 0.07 0.043 0.098 0.758 0.107 0.037 0.081 0.087 0.73 0.102 0.033 0.11 0.076 0.781 MOTIF Heart_P0_H3K9ac_12_155_0.624_8.083242e-310 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.106 0.073 0.115 0.706 0.095 0.704 0.091 0.11 0.101 0.084 0.728 0.087 0.122 0.668 0.125 0.085 0.086 0.101 0.691 0.122 0.678 0.094 0.126 0.102 0.124 0.676 0.087 0.113 0.1 0.079 0.688 0.133 0.124 0.098 0.087 0.691 0.103 0.634 0.151 0.112 MOTIF Heart_E16.5_H3K9ac_16_156_0.586_3.003414e-309 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.077 0.106 0.713 0.104 0.093 0.11 0.102 0.695 0.113 0.699 0.087 0.101 0.087 0.114 0.715 0.084 0.081 0.714 0.122 0.083 0.109 0.08 0.722 0.089 0.689 0.099 0.115 0.097 0.103 0.724 0.093 0.08 0.088 0.125 0.649 0.138 0.093 0.128 0.097 0.682 MOTIF Stomach_P0_H3K9ac_18_162_0.610_6.182543e-315 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.091 0.116 0.696 0.097 0.1 0.1 0.1 0.7 0.105 0.698 0.103 0.094 0.08 0.094 0.742 0.084 0.097 0.682 0.122 0.099 0.078 0.108 0.732 0.082 0.696 0.105 0.113 0.086 0.102 0.712 0.096 0.09 0.089 0.123 0.672 0.116 0.104 0.124 0.101 0.671