MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Liver_E13.5_H3K4me2_14_12_0.611_1.008706e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.0	0.241575	0.745912	0.012513
0.198322	0.727359	0.008931	0.065388
0.006465	0.504774	0.37577	0.11299
0.082959	0.768145	0.1013	0.047595
0.043822	0.034133	0.887098	0.034946
0.145597	0.045868	0.768416	0.040119
0.110047	0.686467	0.072182	0.131304
0.065419	0.034228	0.055848	0.844504
0.01135	0.777484	0.021201	0.189964
0.066684	0.851448	0.024073	0.057795
0.02504	0.873735	0.052795	0.048431
0.041782	0.034402	0.897102	0.026714

MOTIF	Heart_E15.5_H3K4me2_45_79_0.579_1.144537e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.099756	0.0	0.648446	0.251798
0.0	0.955823	0.019987	0.02419
0.05213	0.02377	0.913324	0.010776
0.320358	0.019272	0.563825	0.096544
0.013305	0.931019	0.027039	0.028637
0.02931	0.038188	0.028891	0.903611
0.011312	0.962408	0.0	0.026279
0.013151	0.655511	0.030404	0.300935
0.272217	0.669415	0.044999	0.013368

MOTIF	Heart_E14.5_H3K4me2_52_45_0.554_2.358891e-205
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.198739	0.0	0.467938	0.333324
0.098102	0.043646	0.827633	0.030619
0.020334	0.917853	0.016913	0.0449
0.080146	0.022591	0.854664	0.042598
0.102308	0.032839	0.573753	0.2911
0.003226	0.847887	0.063612	0.085274
0.027217	0.018025	0.020212	0.934546
0.04639	0.743387	0.045472	0.164752
0.109333	0.843483	0.029254	0.01793
0.028325	0.92528	0.021547	0.024848
0.289723	0.152587	0.293142	0.264548

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K4me2_57_76_0.582_1.446454e-305
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.088453	0.078113	0.69653	0.136904
0.013101	0.839128	0.039107	0.108665
0.085474	0.015946	0.805322	0.093259
0.022491	0.040501	0.872886	0.064121
0.006738	0.893251	0.004459	0.095552
0.044093	0.0	0.014186	0.941722
0.00324	0.62385	0.060318	0.312592
0.07149	0.69745	0.013001	0.218058
0.000301	0.942696	0.028641	0.028362

MOTIF	Intestine_E14.5_H3K4me2_64_73_0.565_3.618005e-215
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.083793	0.056163	0.613491	0.246553
0.029206	0.773119	0.0	0.197675
0.176438	0.033795	0.746584	0.043183
0.135209	0.031481	0.795401	0.037908
0.005128	0.91162	0.07157	0.011682
0.03446	0.0	0.045392	0.920149
0.0	0.856053	0.042094	0.101853
0.111877	0.781036	0.039031	0.068057
0.049103	0.910525	0.040372	0.0

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K4me2_39_25_0.597_7.851579e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.016193	0.960717	0.0	0.02309
0.279748	0.063419	0.625549	0.031284
0.041469	0.011621	0.733847	0.213063
0.01403	0.739652	0.055505	0.190813
0.020997	0.030314	0.054027	0.894662
0.025921	0.907558	0.023398	0.043123
0.014463	0.779121	0.056276	0.15014
0.037943	0.910237	0.03505	0.01677
0.219142	0.064354	0.702424	0.014079
0.322184	0.559035	0.099063	0.019717

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me2_24_163_0.633_8.343202e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.105	0.627	0.001	0.267
0.054	0.172	0.593	0.181
0.216	0.102	0.533	0.149
0.001	0.997	0.001	0.001
0.005	0.001	0.001	0.993
0.001	0.567	0.282	0.15
0.001	0.978	0.02	0.001
0.001	0.732	0.266	0.001
0.001	0.001	0.997	0.001
0.001	0.001	0.946	0.052

MOTIF	Liver_E14.5_H3K4me2_42_31_0.569_7.555365e-254
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.101619	0.455097	0.160313	0.28297
0.051838	0.86076	0.061421	0.025981
0.058718	0.69484	0.139549	0.106892
0.120156	0.129446	0.731911	0.018487
0.037616	0.030693	0.841367	0.090324
0.132936	0.021718	0.838357	0.006988
0.871793	0.032528	0.006935	0.088744
0.022687	0.086691	0.882032	0.00859
0.096359	0.774996	0.065513	0.063133
0.034353	0.853797	0.059975	0.051874
0.223607	0.0	0.597447	0.178947

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me2_78_40_0.554_7.530351e-209
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.008842	0.873387	0.050811	0.06696
0.102929	0.743867	0.036131	0.117073
0.077379	0.09142	0.711513	0.119687
0.091977	0.026859	0.836029	0.045135
0.045805	0.049238	0.902096	0.002861
0.853414	0.047412	0.022254	0.076919
0.096646	0.055687	0.771503	0.076164
0.08622	0.764292	0.075127	0.074362
0.045735	0.761047	0.032427	0.160792

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me2_47_28_0.588_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020205	0.908401	0.03847	0.032924
0.086217	0.808507	0.036428	0.068847
0.038484	0.023074	0.851173	0.087269
0.071187	0.096423	0.792845	0.039544
0.097086	0.036679	0.862848	0.003387
0.803199	0.053201	0.039069	0.104531
0.085022	0.059908	0.780915	0.074154
0.136467	0.756275	0.037811	0.069448
0.139692	0.691337	0.075513	0.093458
0.298695	0.319055	0.32369	0.05856

MOTIF	Liver_E15.5_H3K4me2_38_32_0.587_2.983172e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022391	0.819486	0.045892	0.11223
0.072568	0.629219	0.205096	0.093117
0.124245	0.055014	0.798784	0.021957
0.170299	0.022736	0.789237	0.017728
0.193599	0.018192	0.785314	0.002895
0.889338	0.062477	0.022693	0.025492
0.033717	0.057997	0.808613	0.099672
0.0349	0.880515	0.06271	0.021875
0.029205	0.886575	0.041223	0.042997
0.09961	0.03475	0.79259	0.07305

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me2_26_20_0.626_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.06831	0.751922	0.097404	0.082364
0.123236	0.046087	0.793398	0.037279
0.06293	0.076222	0.771523	0.089325
0.058791	0.780778	0.06835	0.092081
0.060881	0.017478	0.046542	0.875098
0.006565	0.836685	0.040628	0.116122
0.043978	0.850119	0.031035	0.074867
0.09064	0.784351	0.075448	0.049561
0.08846	0.122353	0.763135	0.026053

MOTIF	Stomach_E16.5_H3K4me2_26_13_0.612_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.036084	0.687345	0.166324	0.110247
0.121593	0.060864	0.768055	0.049488
0.085797	0.063454	0.746077	0.104671
0.077079	0.761436	0.099909	0.061576
0.021506	0.068984	0.081042	0.828468
0.004276	0.887622	0.01863	0.089472
0.012485	0.872277	0.051044	0.064194
0.089625	0.681517	0.129026	0.099832
0.072951	0.089095	0.775295	0.062659

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K27ac_27_22_0.536_5.09825e-47
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.039261	0.0	0.960739	0.0
0.056291	0.930976	0.012733	0.0
0.034436	0.656782	0.231098	0.077684
0.0	0.014773	0.944865	0.040362
0.339044	0.034183	0.600866	0.025907
0.012083	0.010327	0.967999	0.009591
0.887923	0.070561	0.020698	0.020818
0.258145	0.030551	0.696113	0.01519
0.085237	0.887908	0.018651	0.008204
0.25251	0.187059	0.031758	0.528673

MOTIF	Intestine_P0_H3K27ac_30_29_0.536_1.888338e-62
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.111776	0.005558	0.809578	0.073087
0.060989	0.827538	0.025651	0.085823
0.022405	0.77416	0.129952	0.073484
0.109662	0.026364	0.833823	0.030152
0.13692	0.018293	0.714186	0.130602
0.179519	0.0	0.817668	0.002814
0.879028	0.068403	0.034657	0.017912
0.140319	0.064305	0.780448	0.014927
0.029476	0.89192	0.061143	0.017461

MOTIF	Forebrain_P0_H3K9ac_40_22_0.596_2.965671e-210
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.066158	0.033977	0.796457	0.103408
0.041955	0.882216	0.059584	0.016245
0.059954	0.735282	0.163796	0.040968
0.078309	0.029028	0.74416	0.148503
0.078395	0.031807	0.865988	0.023809
0.043061	0.081031	0.871439	0.004469
0.907089	0.045468	0.005985	0.041458
0.045775	0.120329	0.81581	0.018086
0.158734	0.648508	0.139879	0.05288
0.306941	0.423677	0.151755	0.117627
0.048533	0.147577	0.477431	0.326459

MOTIF	Hindbrain_P0_H3K9ac_62_29_0.561_2.254592e-86
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.450941	0.226268	0.139516	0.183274
0.056483	0.267259	0.325097	0.351161
0.006549	0.944988	0.036005	0.012457
0.096286	0.717246	0.05899	0.127478
0.13597	0.061055	0.682247	0.120728
0.08923	0.011102	0.893394	0.006274
0.041943	0.057544	0.898608	0.001905
0.831368	0.053194	0.012962	0.102477
0.115053	0.062921	0.800606	0.02142
0.127077	0.731663	0.125629	0.015631
0.134606	0.72157	0.041552	0.102272

MOTIF	Limb_E12.5_H3K9ac_26_12_0.597_2.020409e-241
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.030595	0.916531	0.010643	0.042231
0.201062	0.03658	0.735782	0.026576
0.074863	0.054707	0.83018	0.040251
0.059462	0.713302	0.051512	0.175724
0.121048	0.033414	0.026063	0.819476
0.009349	0.80564	0.041235	0.143775
0.021502	0.885695	0.029278	0.063525
0.036495	0.868171	0.053556	0.041778
0.178915	0.076351	0.689555	0.05518
0.023381	0.189901	0.708472	0.078246
0.428061	0.241476	0.125842	0.20462
0.02447	0.225316	0.489612	0.260602
0.028282	0.24105	0.478749	0.251919