MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Kidney_E16.5_H3K4me2_55_18_0.575_8.327982e-262
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.022974	0.854092	0.029933	0.093001
0.033258	0.866262	0.071263	0.029217
0.202206	0.044896	0.683043	0.069855
0.096984	0.034643	0.852735	0.015638
0.900802	0.00898	0.061908	0.028311
0.072306	0.035272	0.861662	0.03076
0.039918	0.819798	0.061514	0.07877
0.103092	0.807089	0.042712	0.047107
0.084414	0.064374	0.619732	0.231479
0.060668	0.069239	0.766612	0.10348
0.098755	0.205075	0.630642	0.065528
0.527215	0.236113	0.203618	0.033054

MOTIF	Midbrain_E12.5_H3K4me2_36_11_0.606_3.67278e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.464925	0.436784	0.00675	0.091541
0.033786	0.274043	0.288565	0.403606
0.010948	0.781117	0.06275	0.145185
0.015488	0.922051	0.036792	0.02567
0.204812	0.032634	0.633286	0.129268
0.039363	0.05221	0.870938	0.037489
0.812731	0.053611	0.068716	0.064943
0.066803	0.027566	0.862375	0.043256
0.180922	0.670644	0.069373	0.079061
0.043677	0.865954	0.032918	0.057451
0.096689	0.0615	0.785453	0.056358
0.088428	0.423596	0.433679	0.054296

MOTIF	Hindbrain_E14.5_H3K4me2_29_11_0.626_5.907178e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012814	0.863575	0.039028	0.084583
0.043486	0.7428	0.061616	0.152098
0.071688	0.022739	0.822941	0.082632
0.073817	0.065996	0.758832	0.101355
0.025439	0.80975	0.103853	0.060957
0.096438	0.062964	0.058201	0.782397
0.022163	0.886715	0.04491	0.046212
0.099967	0.743087	0.039447	0.1175
0.013939	0.060712	0.858634	0.066715
0.316344	0.368395	0.260634	0.054627
0.204253	0.186128	0.600091	0.009528
0.080713	0.13584	0.546208	0.237239

MOTIF	Lung_E16.5_H3K4me2_36_16_0.592_6.778763e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.013014	0.844468	0.051354	0.091163
0.095622	0.70751	0.063331	0.133536
0.124142	0.02989	0.768483	0.077486
0.067094	0.026936	0.771349	0.134621
0.04399	0.856495	0.0364	0.063116
0.039237	0.039754	0.051869	0.86914
0.001627	0.906463	0.030635	0.061275
0.098087	0.732227	0.119027	0.050659
0.072932	0.065078	0.761297	0.100692
0.27893	0.188706	0.451639	0.080725

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me2_50_16_0.584_2.904739e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.012834	0.820853	0.102571	0.063742
0.104566	0.676731	0.083131	0.135571
0.150278	0.017412	0.808382	0.023929
0.076708	0.040606	0.780771	0.101914
0.030473	0.862277	0.054378	0.052873
0.028564	0.03498	0.043969	0.892487
0.012321	0.871328	0.049889	0.066462
0.0802	0.752736	0.020792	0.146272
0.091071	0.066026	0.749204	0.093698
0.321684	0.041266	0.221322	0.415727

MOTIF	Lung_E15.5_H3K4me2_28_11_0.606_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.056344	0.818429	0.055393	0.069834
0.03176	0.758462	0.093271	0.116508
0.147491	0.027884	0.783774	0.040851
0.016153	0.043017	0.840536	0.100293
0.048491	0.755813	0.123641	0.072055
0.083291	0.035925	0.049108	0.831676
0.019158	0.831752	0.089004	0.060086
0.08493	0.756506	0.032413	0.126151
0.021607	0.07448	0.850147	0.053766

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me2_43_17_0.606_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.055929	0.793734	0.06538	0.084956
0.03383	0.734674	0.080268	0.151228
0.150198	0.038067	0.78747	0.024266
0.038836	0.039788	0.828251	0.093124
0.021556	0.871643	0.063576	0.043225
0.033221	0.030147	0.045379	0.891253
0.019548	0.768602	0.140042	0.071809
0.093394	0.705371	0.046148	0.155086
0.01035	0.071334	0.82886	0.089455

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me2_30_159_0.615_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.139	0.747	0.075	0.039
0.168	0.057	0.667	0.108
0.021	0.028	0.938	0.013
0.001	0.967	0.022	0.01
0.02	0.001	0.001	0.978
0.001	0.978	0.001	0.02
0.041	0.907	0.001	0.051
0.059	0.094	0.846	0.001

MOTIF	Neural-Tube_E15.5_H3K4me2_42_30_0.598_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.019757	0.872849	0.0	0.107394
0.048859	0.905302	0.0	0.045839
0.095395	0.044873	0.81058	0.049152
0.0858	0.0	0.897065	0.017135
0.85727	0.034521	0.085643	0.022566
0.053236	0.027514	0.912025	0.007225
0.181562	0.676443	0.023276	0.11872
0.032554	0.581231	0.054529	0.331687
0.034979	0.052873	0.774044	0.138105

MOTIF	Stomach_P0_H3K4me2_33_27_0.599_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.01678	0.831375	0.082191	0.069654
0.021737	0.800875	0.05969	0.117698
0.183508	0.025101	0.700995	0.090396
0.018331	0.031335	0.910111	0.040222
0.827899	0.037208	0.09051	0.044383
0.103284	0.02164	0.865463	0.009613
0.150704	0.743282	0.053738	0.052276
0.044858	0.66822	0.046537	0.240386
0.042846	0.046325	0.826795	0.084034

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K4me3_10_7_0.727_1.718366e-314
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.029807	0.832295	0.051599	0.086299
0.058307	0.050265	0.787068	0.10436
0.018318	0.012405	0.927773	0.041504
0.079761	0.732834	0.159915	0.02749
0.045584	0.028521	0.07489	0.851005
0.00319	0.939826	0.046794	0.010189
0.096377	0.787066	0.073935	0.042622
0.053315	0.096548	0.707587	0.14255
0.025968	0.759918	0.108081	0.106033
0.074228	0.184416	0.621998	0.119358
0.215307	0.400242	0.210552	0.173899
0.267283	0.25081	0.327052	0.154855

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me3_21_11_0.668_8.041448e-310
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.025133	0.806811	0.073829	0.094226
0.074975	0.037714	0.767599	0.119713
0.016889	0.020511	0.916725	0.045875
0.063398	0.856538	0.042682	0.037382
0.030261	0.0043	0.076541	0.888898
0.002875	0.960457	0.026121	0.010547
0.097085	0.645624	0.057918	0.199374
0.1056	0.162137	0.704224	0.028039
0.021196	0.739521	0.142325	0.096958
0.149931	0.178208	0.580969	0.090892

MOTIF	Kidney_E15.5_H3K4me3_25_12_0.676_0
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.033246	0.832169	0.057417	0.077167
0.127539	0.044494	0.743402	0.084565
0.018644	0.029268	0.913928	0.03816
0.019161	0.879765	0.052929	0.048145
0.034321	0.034949	0.047547	0.883184
0.019398	0.876861	0.051973	0.051769
0.093964	0.719769	0.044512	0.141755
0.078912	0.102985	0.700074	0.118028
0.025287	0.666246	0.215534	0.092933
0.086211	0.1482	0.464335	0.301253

MOTIF	Kidney_P0_H3K4me3_34_7_0.666_2.573975e-312
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.250882	0.100795	0.583068	0.065255
0.049182	0.235389	0.602381	0.113047
0.023509	0.836658	0.067076	0.072757
0.209735	0.069266	0.666604	0.054395
0.010255	0.017159	0.936835	0.035751
0.043046	0.832294	0.037029	0.087631
0.034325	0.020302	0.058742	0.886631
0.007674	0.893495	0.028487	0.070344
0.129445	0.673868	0.017553	0.179134
0.094058	0.053192	0.80605	0.0467
0.019637	0.901043	0.066125	0.013195
0.20773	0.243322	0.386083	0.162865

MOTIF	Midbrain_P0_H3K4me3_26_10_0.682_2.994196e-309
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.020686	0.933727	0.010534	0.035053
0.081318	0.742357	0.060519	0.115805
0.023096	0.070276	0.785917	0.120711
0.065788	0.709704	0.132216	0.092292
0.074649	0.041758	0.7995	0.084093
0.036289	0.043309	0.775394	0.145007
0.02621	0.79468	0.130522	0.048588
0.029931	0.048426	0.025602	0.896041
0.005775	0.94019	0.031138	0.022897
0.09587	0.704173	0.026357	0.173599
0.034495	0.427797	0.41314	0.124568
0.029018	0.292656	0.394873	0.283454
0.104216	0.348979	0.4398	0.107005

MOTIF	Cranio-Facial_E14.5_H3K9ac_69_72_0.551_6.19816e-77
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.001179	0.987274	0.002567	0.008979
0.101839	0.090824	0.02675	0.780588
0.006177	0.80548	0.09973	0.088613
0.218608	0.030861	0.682531	0.068
0.0	0.01662	0.847669	0.135711
0.058993	0.713878	0.055539	0.17159
0.019326	0.041566	0.051519	0.887589
0.030713	0.792964	0.0367	0.139624
0.02681	0.870901	0.037302	0.064986
0.030302	0.187626	0.379185	0.402888

MOTIF	Hindbrain_E12.5_H3K9ac_28_45_0.592_1.982326e-305
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.150824	0.584926	0.238787	0.025463
0.006683	0.038901	0.954416	0.0
0.268108	0.120708	0.593797	0.017387
0.781111	0.150889	0.043612	0.024388
0.027096	0.02327	0.939854	0.00978
0.21961	0.718901	0.051732	0.009758
0.003666	0.925405	0.044538	0.026391
0.031815	0.053767	0.900021	0.014396
0.972318	0.0	0.0	0.027682

MOTIF	Kidney_P0_H3K9ac_70_83_0.527_3.242458e-22
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.141386	0.689506	0.068858	0.100249
0.008479	0.985095	0.006426	0.0
0.137434	0.025562	0.031312	0.805692
0.009862	0.877828	0.097418	0.014892
0.058887	0.02743	0.706497	0.207186
0.0	0.012506	0.961377	0.026117
0.057111	0.732472	0.023316	0.187101
0.044152	0.095836	0.051413	0.808599
0.066184	0.627	0.182428	0.124388