MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF	Limb_E14.5_H3K27ac_85_91_0.508_2.315444e-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.038494	0.847403	0.07989	0.034212
0.058558	0.053232	0.041044	0.847166
0.004654	0.151644	0.800071	0.043631
0.022746	0.770329	0.088036	0.11889
0.049032	0.70158	0.028946	0.220442
0.014139	0.037861	0.040213	0.907788
0.004048	0.063948	0.019405	0.912599
0.016825	0.737104	0.014719	0.231352
0.023801	0.800113	0.021538	0.154548
0.060845	0.442803	0.03953	0.456823

MOTIF	Midbrain_E15.5_H3K27ac_40_144_0.541_1.379247e-88
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.145995	0.0	0.854005	0.0
0.735739	0.054256	0.07658	0.133424
0.92217	0.036368	0.016339	0.025123
0.050212	0.045145	0.513557	0.391086
0.027112	0.034838	0.790359	0.147692
0.0	0.949756	0.039723	0.010522
0.985	0.0	0.0	0.015
0.0	0.032508	0.801726	0.165767
0.028861	0.928912	0.0	0.042227

MOTIF	Hindbrain_E11.5_H3K27ac_13_161_0.564_2.350195e-86
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.7	0.1	0.1	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.7	0.1
0.1	0.7	0.1	0.1
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7
0.1	0.1	0.1	0.7

MOTIF	Heart_E11.5_H3K27ac_12_173_0.543_4.011287e-64
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.621	0.131	0.13	0.118
0.592	0.129	0.124	0.155
0.137	0.137	0.156	0.57
0.123	0.133	0.142	0.602
0.144	0.607	0.112	0.137
0.574	0.162	0.128	0.136
0.132	0.126	0.624	0.118
0.134	0.604	0.133	0.129
0.138	0.594	0.144	0.124
0.121	0.132	0.611	0.136

MOTIF	Cranio-Facial_E12.5_H3K27ac_13_167_0.549_1.126402e-78
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.114	0.681	0.122	0.083
0.105	0.107	0.676	0.112
0.081	0.097	0.71	0.112
0.088	0.725	0.081	0.106
0.107	0.078	0.121	0.694
0.088	0.086	0.703	0.123
0.674	0.131	0.114	0.081
0.699	0.087	0.096	0.118
0.121	0.101	0.083	0.695
0.086	0.08	0.09	0.744

MOTIF	Neural-Tube_E11.5_H3K27ac_16_158_0.559_2.253013e-66
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.724	0.1	0.082	0.094
0.699	0.091	0.09	0.12
0.12	0.077	0.084	0.719
0.105	0.097	0.137	0.661
0.129	0.685	0.101	0.085
0.7	0.109	0.068	0.123
0.095	0.096	0.707	0.102
0.103	0.714	0.088	0.095
0.108	0.69	0.095	0.107
0.08	0.108	0.701	0.111

MOTIF	Forebrain_E14.5_H3K27ac_14_165_0.558_1.79146e-87
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.126	0.704	0.064	0.106
0.097	0.071	0.76	0.072
0.089	0.053	0.798	0.06
0.071	0.817	0.053	0.059
0.093	0.054	0.036	0.817
0.037	0.07	0.838	0.055
0.028	0.804	0.064	0.104
0.772	0.088	0.048	0.092
0.067	0.044	0.066	0.823
0.034	0.045	0.055	0.866

MOTIF	Kidney_E14.5_H3K27ac_19_171_0.545_2.584688e-50
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.685	0.135	0.082	0.098
0.631	0.164	0.148	0.057
0.169	0.118	0.18	0.533
0.159	0.133	0.571	0.137
0.166	0.601	0.122	0.111
0.625	0.077	0.145	0.153
0.135	0.131	0.601	0.133
0.152	0.556	0.153	0.139
0.15	0.583	0.144	0.123
0.093	0.144	0.611	0.152

MOTIF	Stomach_E15.5_H3K27ac_11_172_0.543_2.018658e-76
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.702	0.12	0.123	0.055
0.632	0.079	0.137	0.152
0.188	0.159	0.169	0.484
0.153	0.171	0.548	0.128
0.149	0.626	0.113	0.112
0.619	0.116	0.123	0.142
0.145	0.076	0.655	0.124
0.13	0.583	0.151	0.136
0.142	0.61	0.125	0.123
0.134	0.146	0.544	0.176

MOTIF	Cranio-Facial_E13.5_H3K4me1_8_157_0.541_9.97357e-148
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.782	0.036	0.114	0.068
0.896	0.038	0.032	0.034
0.845	0.046	0.053	0.056
0.068	0.057	0.08	0.795
0.058	0.037	0.859	0.046
0.042	0.86	0.061	0.037
0.899	0.018	0.024	0.059
0.031	0.053	0.87	0.046
0.047	0.819	0.075	0.059
0.077	0.789	0.044	0.09
0.07	0.069	0.037	0.824
0.065	0.094	0.077	0.764

MOTIF	Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_11_158_0.543_4.824095e-129
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.853	0.105	0.027	0.015
0.666	0.101	0.202	0.031
0.415	0.264	0.251	0.07
0.241	0.111	0.506	0.142
0.022	0.929	0.047	0.002
0.074	0.001	0.001	0.924
0.001	0.07	0.907	0.022
0.019	0.964	0.016	0.001
0.583	0.173	0.023	0.221
0.026	0.061	0.086	0.827
0.001	0.057	0.001	0.941
0.001	0.073	0.001	0.925

MOTIF	Forebrain_E13.5_H3K4me1_12_162_0.552_2.860087e-250
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.989	0.001	0.001	0.009
0.835	0.096	0.004	0.065
0.412	0.001	0.088	0.5
0.179	0.001	0.633	0.187
0.173	0.791	0.035	0.001
0.565	0.02	0.046	0.369
0.002	0.177	0.563	0.258
0.221	0.47	0.044	0.265
0.205	0.277	0.231	0.287
0.128	0.231	0.218	0.423

MOTIF	Hindbrain_E16.5_H3K4me1_7_160_0.559_9.154254e-211
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.452	0.213	0.268	0.067
0.217	0.462	0.302	0.019
0.131	0.001	0.669	0.199
0.158	0.685	0.136	0.021
0.17	0.023	0.015	0.792
0.001	0.008	0.909	0.082
0.193	0.643	0.011	0.153
0.51	0.001	0.07	0.419
0.014	0.003	0.057	0.926
0.001	0.001	0.001	0.997

MOTIF	Forebrain_P0_H3K4me1_18_168_0.535_1.354421e-43
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.374	0.215	0.216	0.194
0.18	0.382	0.355	0.083
0.191	0.241	0.461	0.107
0.185	0.559	0.245	0.011
0.008	0.001	0.029	0.962
0.081	0.087	0.621	0.211
0.164	0.659	0.065	0.112
0.922	0.035	0.031	0.012
0.191	0.073	0.163	0.573
0.125	0.049	0.019	0.807

MOTIF	Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_11_161_0.543_6.785817e-116
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.094	0.052	0.053	0.801
0.132	0.055	0.103	0.71
0.856	0.04	0.039	0.065
0.833	0.089	0.029	0.049
0.096	0.06	0.058	0.786
0.06	0.046	0.82	0.074
0.091	0.772	0.09	0.047
0.819	0.037	0.074	0.07
0.073	0.048	0.806	0.073
0.078	0.796	0.051	0.075

MOTIF	Forebrain_E16.5_H3K4me1_17_165_0.545_2.507906e-171
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.039	0.001	0.884	0.076
0.058	0.94	0.001	0.001
0.02	0.008	0.026	0.946
0.015	0.071	0.803	0.111
0.067	0.818	0.027	0.088
0.844	0.11	0.001	0.045
0.001	0.03	0.064	0.905
0.001	0.032	0.001	0.966

MOTIF	Midbrain_E14.5_H3K4me1_12_158_0.543_1.389232e-100
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.853	0.045	0.064	0.038
0.801	0.088	0.062	0.049
0.056	0.065	0.053	0.826
0.088	0.045	0.786	0.081
0.068	0.779	0.096	0.057
0.849	0.046	0.052	0.053
0.04	0.084	0.809	0.067
0.097	0.761	0.046	0.096
0.054	0.12	0.716	0.11
0.05	0.064	0.068	0.818

MOTIF	Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_10_158_0.547_7.057141e-111
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1
0.829	0.055	0.049	0.067
0.821	0.061	0.066	0.052
0.061	0.06	0.064	0.815
0.082	0.042	0.807	0.069
0.073	0.817	0.069	0.041
0.83	0.063	0.041	0.066
0.048	0.063	0.783	0.106
0.049	0.805	0.054	0.092
0.073	0.126	0.712	0.089
0.051	0.067	0.101	0.781