MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K27ac_32_151_0.536_3.051732e-51 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.401 0.178 0.26 0.161 0.576 0.14 0.184 0.1 0.617 0.173 0.118 0.092 0.545 0.205 0.196 0.054 0.135 0.805 0.041 0.019 0.941 0.001 0.001 0.057 0.076 0.012 0.638 0.274 0.278 0.647 0.053 0.022 0.106 0.008 0.004 0.882 0.013 0.131 0.663 0.193 0.009 0.27 0.182 0.539 0.114 0.198 0.21 0.477 MOTIF Limb_E12.5_H3K27ac_11_152_0.544_3.78335e-73 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.681 0.107 0.114 0.098 0.754 0.078 0.096 0.072 0.764 0.095 0.07 0.071 0.714 0.092 0.122 0.072 0.093 0.762 0.078 0.067 0.813 0.036 0.046 0.105 0.076 0.063 0.763 0.098 0.1 0.764 0.068 0.068 0.081 0.057 0.047 0.815 0.06 0.102 0.729 0.109 0.06 0.12 0.086 0.734 0.084 0.097 0.112 0.707 MOTIF Hindbrain_E14.5_H3K27ac_28_161_0.554_1.46771e-110 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.29 0.266 0.327 0.117 0.46 0.127 0.231 0.182 0.456 0.12 0.282 0.141 0.427 0.086 0.424 0.063 0.291 0.483 0.132 0.094 0.538 0.034 0.252 0.176 0.037 0.041 0.77 0.152 0.05 0.882 0.032 0.036 0.304 0.034 0.03 0.632 0.035 0.121 0.673 0.171 0.04 0.637 0.05 0.273 0.161 0.313 0.139 0.388 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K27ac_22_160_0.547_4.438888e-76 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.204 0.217 0.482 0.097 0.589 0.035 0.212 0.164 0.109 0.043 0.802 0.046 0.148 0.719 0.105 0.028 0.709 0.001 0.041 0.249 0.033 0.002 0.862 0.103 0.118 0.79 0.041 0.051 0.1 0.041 0.02 0.839 0.121 0.103 0.563 0.213 0.111 0.143 0.111 0.635 0.095 0.234 0.119 0.552 0.175 0.076 0.076 0.673 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K27ac_42_160_0.535_1.534071e-50 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.27 0.222 0.211 0.297 0.229 0.027 0.615 0.129 0.025 0.073 0.773 0.129 0.074 0.743 0.18 0.003 0.931 0.006 0.001 0.062 0.005 0.001 0.954 0.04 0.077 0.84 0.001 0.082 0.043 0.011 0.035 0.911 0.005 0.119 0.852 0.024 0.008 0.215 0.047 0.73 0.001 0.145 0.17 0.684 0.111 0.095 0.056 0.738 MOTIF Midbrain_E14.5_H3K4me1_17_161_0.539_1.351936e-73 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.196 0.386 0.293 0.126 0.991 0.001 0.001 0.007 0.673 0.001 0.325 0.001 0.696 0.001 0.302 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.869 0.015 0.115 0.001 0.677 0.001 0.321 MOTIF Midbrain_E11.5_H3K4me1_7_159_0.552_7.93074e-127 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.2 0.039 0.047 0.714 0.042 0.179 0.055 0.724 0.724 0.045 0.033 0.198 0.866 0.048 0.049 0.037 0.501 0.022 0.151 0.326 0.299 0.494 0.04 0.167 0.619 0.008 0.077 0.296 0.045 0.055 0.86 0.04 0.047 0.863 0.04 0.05 0.398 0.029 0.049 0.524 0.026 0.246 0.383 0.345 0.036 0.351 0.186 0.428 MOTIF Neural-Tube_E11.5_H3K4me1_13_155_0.542_8.235008e-63 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.31 0.199 0.314 0.177 0.086 0.794 0.082 0.038 0.857 0.005 0.011 0.127 0.043 0.027 0.872 0.058 0.06 0.829 0.052 0.059 0.079 0.003 0.001 0.917 0.07 0.071 0.771 0.088 0.054 0.094 0.062 0.79 0.032 0.09 0.089 0.789 0.123 0.089 0.069 0.719 0.661 0.089 0.128 0.122 0.326 0.229 0.211 0.233 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K4me1_14_154_0.537_1.151594e-88 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.317 0.201 0.211 0.271 0.37 0.13 0.197 0.303 0.353 0.17 0.258 0.219 0.368 0.25 0.297 0.085 0.086 0.808 0.027 0.079 0.95 0.006 0.003 0.041 0.161 0.016 0.538 0.285 0.258 0.549 0.015 0.178 0.038 0.005 0.004 0.953 0.035 0.142 0.596 0.227 0.112 0.301 0.203 0.383 0.22 0.285 0.176 0.319 MOTIF Forebrain_E15.5_H3K4me1_17_163_0.544_6.715612e-164 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.739 0.097 0.094 0.07 0.727 0.079 0.124 0.07 0.106 0.718 0.096 0.08 0.777 0.057 0.074 0.092 0.07 0.069 0.781 0.08 0.084 0.784 0.068 0.064 0.094 0.069 0.06 0.777 0.077 0.092 0.731 0.1 0.073 0.114 0.086 0.727 0.073 0.073 0.085 0.769 0.072 0.082 0.079 0.767 0.104 0.097 0.096 0.703 MOTIF Limb_E11.5_H3K4me1_4_154_0.552_4.486538e-123 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.257 0.041 0.496 0.206 0.23 0.154 0.447 0.169 0.833 0.057 0.059 0.051 0.839 0.074 0.051 0.036 0.815 0.057 0.087 0.041 0.061 0.83 0.06 0.049 0.893 0.025 0.037 0.045 0.059 0.056 0.658 0.227 0.28 0.622 0.044 0.054 0.061 0.037 0.026 0.876 0.038 0.061 0.834 0.067 0.028 0.362 0.191 0.419 MOTIF Cranio-Facial_E13.5_H3K4me1_3_152_0.547_6.411031e-179 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.463 0.206 0.198 0.133 0.533 0.169 0.25 0.048 0.187 0.777 0.035 0.001 0.915 0.001 0.004 0.08 0.003 0.003 0.658 0.336 0.284 0.689 0.012 0.015 0.017 0.001 0.002 0.98 0.002 0.004 0.968 0.026 0.008 0.227 0.161 0.604 0.07 0.123 0.149 0.658 0.125 0.195 0.088 0.592 0.173 0.238 0.161 0.428 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K4me1_3_153_0.550_2.988591e-159 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.408 0.161 0.278 0.153 0.482 0.198 0.261 0.059 0.176 0.743 0.071 0.01 0.891 0.001 0.006 0.102 0.046 0.005 0.698 0.251 0.221 0.726 0.014 0.039 0.141 0.001 0.001 0.857 0.073 0.023 0.874 0.03 0.057 0.241 0.106 0.596 0.012 0.141 0.086 0.761 0.127 0.147 0.084 0.642 0.235 0.294 0.153 0.318 MOTIF Limb_E13.5_H3K4me1_2_154_0.553_2.605162e-236 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.479 0.156 0.227 0.138 0.556 0.191 0.249 0.004 0.235 0.689 0.073 0.003 0.777 0.001 0.073 0.149 0.009 0.025 0.725 0.241 0.195 0.742 0.058 0.005 0.112 0.003 0.001 0.884 0.019 0.028 0.927 0.026 0.029 0.24 0.111 0.62 0.052 0.053 0.115 0.78 0.063 0.1 0.093 0.744 0.193 0.217 0.125 0.465 MOTIF Limb_E15.5_H3K4me1_4_161_0.552_2.249874e-181 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.465 0.214 0.185 0.136 0.587 0.11 0.269 0.034 0.18 0.635 0.18 0.005 0.75 0.028 0.079 0.143 0.065 0.036 0.805 0.094 0.128 0.845 0.007 0.02 0.144 0.001 0.012 0.843 0.026 0.054 0.885 0.035 0.041 0.261 0.081 0.617 0.06 0.056 0.127 0.757 0.101 0.095 0.065 0.739 0.166 0.184 0.141 0.509 MOTIF Intestine_E14.5_H3K4me1_10_157_0.538_1.076404e-80 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.212 0.615 0.172 0.001 0.689 0.001 0.001 0.309 0.117 0.001 0.771 0.111 0.173 0.803 0.001 0.023 0.367 0.001 0.001 0.631 0.095 0.047 0.815 0.043 0.001 0.343 0.129 0.527 0.07 0.26 0.162 0.508 0.166 0.155 0.177 0.502 0.158 0.275 0.248 0.319 0.217 0.436 0.003 0.344 0.296 0.28 0.002 0.423 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me1_13_163_0.545_1.291864e-142 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.048 0.011 0.83 0.111 0.184 0.214 0.468 0.134 0.746 0.057 0.143 0.054 0.76 0.029 0.188 0.023 0.702 0.052 0.192 0.054 0.067 0.762 0.104 0.067 0.872 0.02 0.012 0.096 0.039 0.006 0.92 0.035 0.07 0.853 0.006 0.071 0.152 0.072 0.008 0.768 0.026 0.126 0.771 0.077 0.051 0.567 0.118 0.264 MOTIF Neural-Tube_E14.5_H3K4me1_12_160_0.544_1.532894e-79 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.123 0.069 0.718 0.09 0.149 0.664 0.128 0.059 0.857 0.053 0.001 0.089 0.733 0.089 0.128 0.05 0.817 0.026 0.136 0.021 0.045 0.831 0.09 0.034 0.882 0.001 0.001 0.116 0.049 0.038 0.868 0.045 0.041 0.951 0.001 0.007 0.161 0.001 0.001 0.837 0.002 0.084 0.88 0.034 0.095 0.655 0.087 0.163