MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF Cranio-Facial_E12.5_H3K27ac_14_159_0.547_1.71537e-65 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.178 0.578 0.124 0.12 0.228 0.047 0.438 0.287 0.001 0.178 0.759 0.062 0.006 0.919 0.042 0.033 0.058 0.02 0.001 0.921 0.008 0.081 0.068 0.843 0.003 0.001 0.042 0.954 0.029 0.009 0.947 0.015 0.01 0.001 0.015 0.974 0.001 0.024 0.048 0.927 0.044 0.081 0.012 0.863 0.889 0.041 0.017 0.053 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K27ac_16_157_0.550_6.21588e-95 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 MOTIF Kidney_P0_H3K27ac_18_158_0.546_1.37927e-73 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 MOTIF Heart_E16.5_H3K27ac_23_158_0.536_1.758237e-60 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.135 0.608 0.132 0.125 0.114 0.068 0.659 0.159 0.06 0.075 0.781 0.084 0.06 0.778 0.08 0.082 0.066 0.068 0.035 0.831 0.057 0.089 0.089 0.765 0.06 0.048 0.073 0.819 0.07 0.099 0.756 0.075 0.066 0.101 0.062 0.771 0.059 0.077 0.089 0.775 0.075 0.092 0.062 0.771 0.684 0.104 0.103 0.109 MOTIF Liver_E15.5_H3K27ac_47_169_0.533_1.400912e-27 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.755 0.103 0.062 0.08 0.797 0.136 0.05 0.017 0.758 0.085 0.141 0.016 0.181 0.567 0.122 0.13 0.844 0.101 0.038 0.017 0.778 0.082 0.128 0.012 0.922 0.005 0.038 0.035 0.187 0.122 0.66 0.031 0.055 0.703 0.139 0.103 0.23 0.43 0.097 0.243 0.167 0.18 0.436 0.217 0.143 0.535 0.164 0.158 MOTIF Lung_E16.5_H3K27ac_17_147_0.539_3.392873e-65 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.80255 0.0 0.167372 0.030078 0.893971 0.067709 0.01832 0.02 0.944301 0.009553 0.039525 0.006621 0.0 0.898652 0.06187 0.039479 0.795029 0.066774 0.138197 0.0 0.871092 0.05278 0.069347 0.006781 0.755616 0.0 0.244384 0.0 0.025943 0.313893 0.655668 0.004496 0.079405 0.858368 0.055729 0.006498 MOTIF Lung_E14.5_H3K27ac_18_148_0.540_4.08416e-57 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.851843 0.0 0.094121 0.054037 0.793357 0.083956 0.087329 0.035358 0.907937 0.0 0.092063 0.0 0.050482 0.616498 0.316661 0.016359 0.751543 0.231587 0.010807 0.006063 0.938332 0.029304 0.032364 0.0 0.661593 0.169035 0.169372 0.0 0.001863 0.024798 0.973339 0.0 0.003032 0.988502 0.0 0.008466 MOTIF Cranio-Facial_E14.5_H3K27ac_36_148_0.540_1.752304e-58 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.944254 0.0 0.028885 0.026861 0.792276 0.027136 0.148192 0.032396 0.690431 0.036466 0.266563 0.00654 0.081852 0.768991 0.136415 0.012743 0.940739 0.059261 0.0 0.0 0.697993 0.06845 0.233557 0.0 0.892279 0.007829 0.092137 0.007755 0.054333 0.128836 0.810445 0.006386 0.0 0.95741 0.04259 0.0 MOTIF Midbrain_E13.5_H3K27ac_30_138_0.541_5.456725e-80 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.901273 0.0 0.044073 0.054653 0.58868 0.019217 0.386337 0.005766 0.736553 0.0 0.263447 0.0 0.064075 0.805865 0.107991 0.022068 0.862141 0.130475 0.007384 0.0 0.882786 0.091091 0.026123 0.0 0.849885 0.008196 0.088776 0.053142 0.012846 0.010619 0.972619 0.003916 0.101483 0.859941 0.038576 0.0 MOTIF Cranio-Facial_E15.5_H3K4me1_13_162_0.539_2.466582e-96 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.126 0.112 0.123 0.639 0.816 0.052 0.061 0.071 0.844 0.08 0.037 0.039 0.801 0.031 0.104 0.064 0.043 0.787 0.113 0.057 0.863 0.072 0.012 0.053 0.706 0.175 0.105 0.014 0.872 0.007 0.047 0.074 0.067 0.096 0.771 0.066 0.073 0.815 0.088 0.024 0.167 0.599 0.074 0.16 0.148 0.18 0.488 0.185 MOTIF Liver_E11.5_H3K4me1_36_166_0.523_8.240445e-39 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.237 0.304 0.229 0.23 0.177 0.516 0.14 0.167 0.177 0.102 0.547 0.174 0.115 0.12 0.647 0.118 0.108 0.649 0.116 0.127 0.106 0.114 0.074 0.706 0.088 0.122 0.137 0.653 0.109 0.078 0.118 0.695 0.106 0.137 0.627 0.13 0.11 0.13 0.108 0.652 0.113 0.108 0.124 0.655 0.216 0.223 0.21 0.351 MOTIF Neural-Tube_E12.5_H3K4me1_12_157_0.542_3.838728e-97 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.216 0.204 0.277 0.303 0.234 0.181 0.198 0.387 0.572 0.048 0.175 0.205 0.722 0.165 0.062 0.051 0.607 0.023 0.059 0.311 0.058 0.498 0.147 0.297 0.876 0.019 0.047 0.058 0.548 0.16 0.254 0.038 0.562 0.009 0.105 0.324 0.081 0.053 0.782 0.084 0.042 0.585 0.339 0.034 0.297 0.437 0.035 0.23 MOTIF Lung_E14.5_H3K4me1_10_146_0.532_1.552399e-42 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.886235 0.00535 0.098581 0.009834 0.888603 0.009773 0.080755 0.02087 0.918104 0.002773 0.079123 0.0 0.048053 0.915361 0.030283 0.006303 0.909685 0.08062 0.009695 0.0 0.78463 0.137144 0.052742 0.025485 0.62239 0.220424 0.157186 0.0 0.023062 0.069713 0.907225 0.0 0.0 0.632608 0.360178 0.007214 MOTIF Forebrain_E11.5_H3K4me1_10_141_0.551_2.427326e-130 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.874618 0.003988 0.035506 0.085888 0.70032 0.0 0.096029 0.203651 0.028719 0.602896 0.187961 0.180424 0.958844 0.0 0.031135 0.010021 0.874241 0.059054 0.062026 0.004679 0.837921 0.012414 0.0 0.149665 0.019173 0.109193 0.866884 0.004749 0.034936 0.929614 0.035449 0.0 0.006908 0.764122 0.213536 0.015434 MOTIF Forebrain_E12.5_H3K4me1_10_145_0.546_3.094186e-159 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.813254 0.081378 0.038727 0.066641 0.816448 0.045445 0.0 0.138107 0.0 0.67132 0.156284 0.172395 0.958328 0.0 0.033722 0.007949 0.916477 0.029711 0.052156 0.001656 0.858166 0.009684 0.0 0.13215 0.070093 0.008666 0.877791 0.04345 0.0084 0.891418 0.100182 0.0 0.009467 0.737149 0.158739 0.094646 MOTIF Midbrain_E12.5_H3K4me1_10_136_0.546_8.482267e-153 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.93606 0.001378 0.027127 0.035434 0.746545 0.093502 0.067312 0.092641 0.813104 0.040271 0.038666 0.107959 0.037177 0.691715 0.234316 0.036792 0.852505 0.032044 0.107491 0.007961 0.789905 0.145708 0.059887 0.0045 0.778738 0.076946 0.060303 0.084013 0.014888 0.095989 0.884519 0.004604 0.004075 0.921007 0.070098 0.00482 MOTIF Neural-Tube_E13.5_H3K4me1_29_146_0.527_1.026247e-67 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.076449 0.046456 0.456582 0.420513 0.595687 0.0 0.311766 0.092547 0.595457 0.033459 0.247135 0.123948 0.924584 0.005094 0.025481 0.04484 0.028273 0.831132 0.022509 0.118086 0.836465 0.008498 0.155037 0.0 0.831958 0.062451 0.092755 0.012835 0.975664 0.004408 0.002733 0.017195 0.040418 0.25187 0.701112 0.0066 0.033552 0.881736 0.084711 0.0 MOTIF Liver_E14.5_H3K4me2_78_170_0.525_4.388403e-28 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.084 0.079 0.743 0.094 0.065 0.775 0.062 0.098 0.059 0.072 0.036 0.833 0.046 0.083 0.092 0.779 0.063 0.036 0.067 0.834 0.065 0.082 0.775 0.078 0.055 0.078 0.079 0.788 0.062 0.075 0.076 0.787 0.067 0.073 0.076 0.784 0.691 0.106 0.099 0.104 0.147 0.604 0.115 0.134 0.143 0.118 0.604 0.135 MOTIF Lung_P0_H3K4me2_58_163_0.560_2.988983e-103 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 100 E= 1.0e-1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.1 0.1 0.1 0.7 0.7 0.1 0.1 0.1